| 摘要 | 第10-13页 |
| Abstract | 第13-15页 |
| 缩略语表（Abbreviation） | 第16-17页 |
| 第一部分 综述部分 | 第17-35页 |
| 1 寄生虫分类 | 第17-21页 |
| 1.1 传统分类鉴定 | 第17页 |
| 1.2 分子鉴定 | 第17-21页 |
| 1.2.1 PCR-RFLP | 第18页 |
| 1.2.2 RAPD | 第18-19页 |
| 1.2.3 AFLP | 第19页 |
| 1.2.4 SSCP | 第19页 |
| 1.2.5 DNA序列分析 | 第19-20页 |
| 1.2.6 线粒体基因组鉴定方法 | 第20-21页 |
| 2 蛔虫的研究进展 | 第21-25页 |
| 2.1 虫体形态特征和生活史 | 第22-24页 |
| 2.2 流行病学 | 第24页 |
| 2.3 临床症状 | 第24页 |
| 2.4 诊断与防治 | 第24-25页 |
| 3 细颈囊尾蚴的研究进展 | 第25-27页 |
| 3.1 细颈囊尾蚴的形态特征 | 第25-26页 |
| 3.2 生活史 | 第26页 |
| 3.3 流行病学 | 第26-27页 |
| 3.4 诊断 | 第27页 |
| 3.4.1 制片诊断 | 第27页 |
| 3.4.2 分子生物学鉴定 | 第27页 |
| 3.5 鉴别诊断与防治 | 第27页 |
| 4 藏猪概况 | 第27-34页 |
| 4.1 藏猪的品种特性 | 第28-29页 |
| 4.2 藏猪疫病的研究概况 | 第29-34页 |
| 4.2.1 藏猪细菌性疾病的研究 | 第29-30页 |
| 4.2.2 藏猪病毒性性疾病的研究 | 第30-32页 |
| 4.2.3 藏猪寄生虫性疾病的研究 | 第32-34页 |
| 5 本研究目的和意义 | 第34-35页 |
| 第二部分 试验部分 | 第35-86页 |
| 第一章 西藏林芝地区藏猪消化道寄生虫流行情况调查 | 第35-42页 |
| 1 研究背景 | 第36页 |
| 2 材料与方法 | 第36-37页 |
| 2.1 调查动物 | 第36-37页 |
| 2.2 调查方法 | 第37页 |
| 2.3 虫种、虫卵鉴定 | 第37页 |
| 2.4 数据处理 | 第37页 |
| 3 结果 | 第37-40页 |
| 3.1 藏猪消化道寄生虫感染情况 | 第37-38页 |
| 3.2 藏猪消化道寄生虫形态特征 | 第38-40页 |
| 3.2.1 线虫 | 第38-39页 |
| 3.2.2 绦虫蚴 | 第39页 |
| 3.2.3 吸虫 | 第39-40页 |
| 3.2.4 原虫 | 第40页 |
| 3.2.5 棘头虫 | 第40页 |
| 3.3 寄生虫的混合感染率 | 第40页 |
| 4 讨论 | 第40-42页 |
| 第二章 藏猪蛔虫nad1、cox1和cox2基因扩增及序列分析 | 第42-52页 |
| 1 研究背景 | 第43-44页 |
| 2 材料与方法 | 第44-52页 |
| 2.1 材料 | 第44页 |
| 2.1.1 主要试剂 | 第44页 |
| 2.1.2 主要仪器设备 | 第44页 |
| 2.2 方法 | 第44-48页 |
| 2.2.1 虫株与总DNA的提取 | 第44-45页 |
| 2.2.2 目的基因片段的扩增、纯化与序列测定 | 第45页 |
| 2.2.3 PCR产物检测 | 第45-46页 |
| 2.2.4 PCR产物纯化 | 第46-47页 |
| 2.2.5 克隆构建 | 第47页 |
| 2.2.6 序列分析 | 第47-48页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第48-50页 |
| 2.3.1 PCR扩增结果 | 第48页 |
| 2.3.2 序列比对结果 | 第48-49页 |
| 2.3.3 系统进化分析结果 | 第49-50页 |
| 2.4 讨论 | 第50-52页 |
| 第三章 藏猪细颈囊尾蚴病流行病学调查及其cox2基因扩增、序列分析 | 第52-63页 |
| 1 研究背景 | 第53-54页 |
| 2 材料与方法 | 第54-58页 |
| 2.1 材料 | 第54页 |
| 2.1.1 主要试剂 | 第54页 |
| 2.1.2 主要仪器设备 | 第54页 |
| 2.2 方法 | 第54-56页 |
| 2.2.1 调查范围、对象和内容 | 第54-55页 |
| 2.2.2 血清学检测 | 第55-56页 |
| 2.3 细颈囊尾蚴的采集 | 第56页 |
| 2.4 基因组总DNA的提取 | 第56-57页 |
| 2.5 cox2基因片段的扩增、纯化与序列测定 | 第57页 |
| 2.5.1 cox2基因片段的扩增 | 第57页 |
| 2.5.2 PCR产物的回收与纯化 | 第57页 |
| 2.5.3 载体构建 | 第57页 |
| 2.6 序列分析 | 第57-58页 |
| 2.7 统计分析 | 第58页 |
| 3 结果 | 第58-61页 |
| 3.1 藏猪细颈囊尾蚴的感染情况 | 第58-59页 |
| 3.2 PCR扩增结果 | 第59-60页 |
| 3.3 进化分析结果 | 第60-61页 |
| 4 讨论 | 第61-63页 |
| 第四章 藏猪蛔虫、细颈囊尾蚴线粒体基因组序列测定与分析 | 第63-86页 |
| 1 研究背景 | 第65页 |
| 2 材料与方法 | 第65-72页 |
| 2.1 试验材料 | 第65页 |
| 2.2 主要试剂 | 第65-66页 |
| 2.3 试验方法 | 第66-70页 |
| 2.3.1 线粒体基因组DNA的提取与检测 | 第66-67页 |
| 2.3.2 线粒体DNA提取与检测 | 第67页 |
| 2.3.3 构建文库 | 第67页 |
| 2.3.4 DNA末端修复反应 | 第67-68页 |
| 2.3.5 Adaptor连接 | 第68页 |
| 2.3.6 DNA片段的选择性回收 | 第68-69页 |
| 2.3.7 PCR扩增 | 第69页 |
| 2.3.8 PCR产物的纯化 | 第69-70页 |
| 2.3.9 文库质量检测 | 第70页 |
| 2.4 测序 | 第70-72页 |
| 2.4.1 序列拼接和组装 | 第70-71页 |
| 2.4.2 基因组分分析 | 第71页 |
| 2.4.3 基因组聚类分析 | 第71-72页 |
| 2.4.4 功能分类分析 | 第72页 |
| 2.4.5 生物系统发育树分析 | 第72页 |
| 3 试验结果 | 第72-84页 |
| 3.1 藏猪蛔虫与细颈囊尾蚴线粒体基因组测序结果 | 第72-74页 |
| 3.2 线粒体基因组组分分析 | 第74-76页 |
| 3.3 两种寄生虫线粒体基因A+T含量 | 第76-78页 |
| 3.4 两种寄生虫线粒体基因对应的氨基酸序列 | 第78页 |
| 3.5 两种寄生虫线粒体基因密码子偏好性 | 第78-82页 |
| 3.6 线粒体基因功能分析 | 第82-83页 |
| 3.7 线粒体基因进化分析 | 第83-84页 |
| 4 分析与讨论 | 第84-86页 |
| 全文结论 | 第86-88页 |
| 参考文献 | 第88-103页 |
| 附录 1 | 第103-125页 |
| 附录 2 | 第125-126页 |
| 附录 3 | 第126-128页 |
| 致谢 | 第128-129页 |
