| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 缩写表 | 第9-14页 |
| 1 前言 | 第14-32页 |
| 1.1 甘蔗种质资源及利用现状 | 第14-17页 |
| 1.1.1 甘蔗属的分类 | 第14-15页 |
| 1.1.2 甘蔗种质资源的研究意义 | 第15-16页 |
| 1.1.3 甘蔗种质资源的收集保存与研究 | 第16-17页 |
| 1.1.4 我国利用甘蔗种质资源存在的困难和问题 | 第17页 |
| 1.2 割手密野生种质资源研究进展 | 第17-18页 |
| 1.3 遗传图谱的构建 | 第18-23页 |
| 1.3.1 遗传连锁图谱构建的基本步骤 | 第19页 |
| 1.3.2 遗传连锁图谱的构建群体 | 第19-23页 |
| 1.3.3 遗传连锁图谱的作图群体大小 | 第23页 |
| 1.3.4 构建遗传连锁图谱的软件 | 第23页 |
| 1.4 分子标记 | 第23-26页 |
| 1.4.1 RFLP标记技术 | 第24页 |
| 1.4.2 SSR标记技术 | 第24-25页 |
| 1.4.3 RAPD标记技术 | 第25页 |
| 1.4.4 AFLP标记技术 | 第25页 |
| 1.4.5 TRAP标记技术 | 第25-26页 |
| 1.4.6 分子标记技术在构建甘蔗遗传图谱中的应用 | 第26页 |
| 1.5 QTL定位 | 第26-28页 |
| 1.5.1 QTL作图方法 | 第27页 |
| 1.5.2 甘蔗QTL定位研究进展 | 第27-28页 |
| 1.6 甘蔗黑穗病的研究进展 | 第28-31页 |
| 1.6.1 甘蔗对黑穗病的生理及生化抗性 | 第29页 |
| 1.6.2 甘蔗对黑穗病的分子水平抗性 | 第29-30页 |
| 1.6.3 甘蔗品种对黑穗病的抗性鉴定 | 第30-31页 |
| 1.7 研究的目的与意义 | 第31-32页 |
| 2 高效SSR和AFLP分子标记体系的建立 | 第32-48页 |
| 2.1 材料与方法 | 第33-40页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第33页 |
| 2.1.2 主要试剂与仪器 | 第33-34页 |
| 2.1.3 相关试剂配置 | 第34-36页 |
| 2.1.4 主要仪器设备 | 第36页 |
| 2.1.5 试验方法 | 第36-40页 |
| 2.1.6 数据采集 | 第40页 |
| 2.2 结果与分析 | 第40-46页 |
| 2.2.1 聚丙烯酰胺凝胶电泳分离标记统计 | 第40-43页 |
| 2.2.2 毛细管电泳分离标记统计 | 第43-46页 |
| 2.3 讨论 | 第46-47页 |
| 2.4 本章小结 | 第47-48页 |
| 3 割手密分子遗传图谱的构建 | 第48-93页 |
| 3.1 材料与方法 | 第49-51页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第49页 |
| 3.1.2 提取基因组DNA | 第49页 |
| 3.1.3 引物筛选 | 第49-50页 |
| 3.1.4 遗传图谱的构建 | 第50-51页 |
| 3.1.5 同源组构建 | 第51页 |
| 3.1.6 基因组长度估算 | 第51页 |
| 3.2 结果与分析 | 第51-85页 |
| 3.2.1 SSR分子标记引物扩增结果分析 | 第51-56页 |
| 3.2.2 AFLP分子标记引物扩增结果分析 | 第56-61页 |
| 3.2.3 遗传图谱构建 | 第61-78页 |
| 3.2.4 分子标记作图效率 | 第78-84页 |
| 3.2.5 同源分析 | 第84-85页 |
| 3.2.6 基因组长度和基因组覆盖率 | 第85页 |
| 3.3 讨论 | 第85-91页 |
| 3.3.1 割手密高密度遗传图谱构建及应用 | 第85-86页 |
| 3.3.2 SSR标记和AFLP标记在遗传作图中的效率 | 第86-88页 |
| 3.3.3 割手密遗传图谱特征分析 | 第88-90页 |
| 3.3.4 标记偏分离现象 | 第90-91页 |
| 3.4 本章小结 | 第91-93页 |
| 4 黑穗病QTL定位 | 第93-119页 |
| 4.1 材料与方法 | 第93-96页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第93-94页 |
| 4.1.2 实验方法 | 第94页 |
| 4.1.3 数据分析 | 第94-95页 |
| 4.1.4 QTL定位分析 | 第95-96页 |
| 4.2 结果与分析 | 第96-112页 |
| 4.2.1 黑穗病菌单孢分离和交配型的鉴定 | 第96-97页 |
| 4.2.2 接种体生理小种类型的鉴定 | 第97页 |
| 4.2.3 黑穗病发病率频率分布及QTL适合性分析 | 第97-98页 |
| 4.2.4 黑穗病QTL定位-单标记分析法 | 第98-106页 |
| 4.2.5 黑穗病QTL定位-复合区间作图法 | 第106-112页 |
| 4.3 讨论 | 第112-116页 |
| 4.3.1 黑穗病QTL定位结果分析 | 第112-113页 |
| 4.3.2 影响QTL定位的因素 | 第113-116页 |
| 4.3.3 QTL定位在育种上的应用 | 第116页 |
| 4.4 本章小结 | 第116-119页 |
| 5 结论与创新点 | 第119-122页 |
| 5.1 主要结论 | 第119-121页 |
| 5.2 创新点 | 第121页 |
| 5.3 研究展望 | 第121-122页 |
| 致谢 | 第122-123页 |
| 参考文献 | 第123-139页 |
| 附录1 | 第139-141页 |
| 攻读学位期间发表的论文 | 第141页 |
