肉苁蓉及其寄主梭梭的转录组学测序及转移RNA的初步分析
| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-23页 |
| 1.1 寄生植物简介 | 第11-12页 |
| 1.2 肉苁蓉与梭梭简介 | 第12-13页 |
| 1.3 寄生植物和寄主之间的物质交换 | 第13-21页 |
| 1.3.1 寄生植物和寄主间的营养物质交换 | 第15页 |
| 1.3.2 寄生植物和寄主间的蛋白质交换 | 第15页 |
| 1.3.3 寄生植物和寄主间的病毒和类病毒交换 | 第15-16页 |
| 1.3.4 寄生植物和其寄主间的siRNA交换 | 第16-17页 |
| 1.3.5 水平基因转移(HGT) | 第17页 |
| 1.3.6 mRNA的转移 | 第17-21页 |
| 1.4 转录组测序介绍 | 第21-22页 |
| 1.4.1 转录组介绍 | 第21页 |
| 1.4.2 转录组测序介绍 | 第21-22页 |
| 1.5 本研究的意义 | 第22-23页 |
| 第二章 实验材料和方法 | 第23-44页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-25页 |
| 2.1.1 样品采集 | 第23-24页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第24-25页 |
| 2.2 实验方法 | 第25-44页 |
| 2.2.1 转录组数据处理 | 第25-28页 |
| 2.2.2 转移信息筛选 | 第28-34页 |
| 2.2.3 PCR验证中模板的制备 | 第34-38页 |
| 2.2.4 转移序列的PCR鉴定 | 第38-41页 |
| 2.2.5 DNA测序验证 | 第41-44页 |
| 第三章 结果与分析 | 第44-61页 |
| 3.1 测序结果分析 | 第44-52页 |
| 3.1.1 测序质量分析 | 第44-48页 |
| 3.1.2 转录本拼接结果 | 第48页 |
| 3.1.3 差异表达分析 | 第48-52页 |
| 3.2 转移RNA筛选结果 | 第52-56页 |
| 3.2.1 Perl语言程序筛选结果 | 第52-54页 |
| 3.2.2 Python在NCBI数据库运用成果 | 第54页 |
| 3.2.3 本地BLAST应用后的结果 | 第54页 |
| 3.2.4 筛选结果总结 | 第54-56页 |
| 3.3 实验验证结果 | 第56-61页 |
| 3.3.1 梭梭肉苁蓉样品的分子生物学验证 | 第56-57页 |
| 3.3.2 梭梭肉苁蓉基因组DNA的提取 | 第57页 |
| 3.3.3 梭梭肉苁蓉RNA的提取 | 第57-58页 |
| 3.3.4 RT-PCR验证 | 第58-59页 |
| 3.3.5 酶切验证 | 第59-60页 |
| 3.3.6 测序验证 | 第60-61页 |
| 第四章 讨论和结论 | 第61-64页 |
| 4.1 讨论 | 第61-62页 |
| 4.2 结论 | 第62-64页 |
| 参考文献 | 第64-67页 |
| 致谢 | 第67页 |
