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基于转录组测序的超富集植物鼠耳芥抗Zn/Cd胁迫基因筛选及初步分析

摘要第8-10页
Abstract第10-12页
第1章 文献综述第13-25页
    1.1 土壤重金属污染现状第13-14页
    1.2 植物对重金属的毒害第14-16页
        1.2.1 重金属胁迫对植物生长发育的影响第14-15页
        1.2.2 重金属胁迫对植物新陈代谢的影响第15-16页
        1.2.3 重金属胁迫对植物细胞结构的影响第16页
    1.3 植物对重金属的应答及响应第16-17页
    1.4 植物对重金属胁迫的解毒机制第17-19页
    1.5 植物修复与超富集植物第19-22页
        1.5.1 植物修复技术第19-20页
        1.5.2 超富集植物第20-21页
        1.5.3 Zn/Cd超富集植物—鼠耳芥第21-22页
    1.6 转录组分析技术第22-25页
第2章 引言第25-27页
    2.1 研究目的与意义第25页
    2.2 研究内容第25-26页
    2.3 技术路线第26-27页
第3章 材料与方法第27-35页
    3.1 实验材料第27-28页
        3.1.1 种子来源第27页
        3.1.2 培养条件第27-28页
        3.1.3 胁迫处理与取材第28页
    3.2 实验方法第28-35页
        3.2.1 植物根部Zn和Cd的测定第28-29页
        3.2.2 总RNA提取第29页
        3.2.3 RNA质量检测第29-30页
        3.2.4 cDNA合成第30页
        3.2.5 实时定量PCR第30-32页
        3.2.6 生物学信息分析第32-35页
第4章 研究结果与分析第35-69页
    4.1 Zn/Cd在植物体内的累积第35页
    4.2 Zn/Cd胁迫下鼠耳芥、拟南芥转录组表达谱分析第35-47页
        4.2.1 测序质量分析第36-37页
        4.2.2 物种内部差异分析第37-40页
        4.2.3 GO富集分析第40-43页
        4.2.4 KEGG富集分析第43-45页
        4.2.5 鼠耳芥差异显著基因功能分析第45-46页
        4.2.6 种内转录组分析小结第46-47页
    4.3 Zn/Cd胁迫下鼠耳芥、拟南芥比较性转录分析第47-54页
        4.3.1 Zn/Cd胁迫下鼠耳芥、拟南芥同源基因集的建立第47-48页
        4.3.2 Zn/Cd胁迫下鼠耳芥、拟南芥跨物种差异性比较第48-49页
        4.3.3 鼠耳芥、拟南芥抗Zn/Cd胁迫关键基因筛选。第49-54页
    4.4 鼠耳芥NAS家族基因初步分析第54-58页
        4.4.1 鼠耳芥NAS家族基因成员的鉴定第55-56页
        4.4.2 基于转录组数据下显著差异表达NAS家族基因表达分析第56-58页
    4.5 鼠耳芥ZIP家族基因初步分析第58-69页
        4.5.1 鼠耳芥ZIP家族基因成员的鉴定第58-61页
        4.5.2 鼠耳芥ZIP家族基因蛋白质保守基序分析第61-65页
        4.5.3 鼠耳芥ZIP家族基因蛋白质三级结构预测第65-66页
        4.5.4 跨物种转录组分析中ZIP家族基因表达分析第66-69页
第5章 结论与展望第69-71页
    5.1 结论第69-70页
    5.2 展望第70-71页
参考文献第71-79页
致谢第79-81页
发表学术论文第81页

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