| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-29页 |
| 1.1 鲸类适应性进化的研究进展 | 第9-22页 |
| 1.1.1 鲸类的进化与水生适应的形成历史 | 第9-11页 |
| 1.1.2 鲸类水生适应的遗传机制 | 第11-21页 |
| 1.1.3 问题与展望 | 第21-22页 |
| 1.2 脂肪代谢关键酶的研究进展 | 第22-29页 |
| 1.2.1 脂肪合成关键酶 | 第22-24页 |
| 1.2.2 脂肪分解关键酶 | 第24-25页 |
| 1.2.3 脂肪转运关键酶 | 第25-26页 |
| 1.2.4 脂肪调控关键酶 | 第26-28页 |
| 1.2.5 小结 | 第28-29页 |
| 第2章 鲸类脂肪消化酶基因的适应性进化 | 第29-47页 |
| 2.1 前言 | 第29-30页 |
| 2.2 材料与方法 | 第30-34页 |
| 2.2.1 样品的获取 | 第30-31页 |
| 2.2.2 基因组DNA的提取 | 第31页 |
| 2.2.3 目的基因的扩增及测序 | 第31页 |
| 2.2.4 数据分析 | 第31-34页 |
| 2.3 结果 | 第34-44页 |
| 2.3.1 All mammals数据集选择压力分析 | 第35-36页 |
| 2.3.2 Cetaceans only数据集选择压力分析 | 第36-42页 |
| 2.3.3 正选择位点在蛋白质结构中的分布 | 第42-43页 |
| 2.3.4 食肉动物平行/趋同位点的确定 | 第43-44页 |
| 2.4 讨论 | 第44-45页 |
| 2.4.1 鲸类脂肪消化酶关键基因发生了适应性进化 | 第44-45页 |
| 2.4.2 脂肪消化能力的提高促进了鲸类食性转变 | 第45页 |
| 2.5 结论 | 第45-47页 |
| 第3章 鲸类鲸脂层增厚的分子进化机制 | 第47-64页 |
| 3.1 前言 | 第47-48页 |
| 3.2 材料和方法 | 第48-51页 |
| 3.2.1 样本获取和DNA测序 | 第48-49页 |
| 3.2.2 数据来源和基本处理 | 第49页 |
| 3.2.3 分子进化分析 | 第49-51页 |
| 3.2.4 海洋哺乳动物间平行/趋同位点确定 | 第51页 |
| 3.2.5 定位正选择位点到蛋白质结构 | 第51页 |
| 3.3 结果 | 第51-60页 |
| 3.3.1 TAG代谢相关基因在鲸类中的正选择 | 第52-60页 |
| 3.3.2 正选择位点在蛋白结构中的空间分布 | 第60页 |
| 3.4 讨论 | 第60-63页 |
| 3.5 结论 | 第63-64页 |
| 第4章 鲸类脂质代谢通路基因的分子进化 | 第64-82页 |
| 4.1 前言 | 第64-65页 |
| 4.2 材料和方法 | 第65-67页 |
| 4.2.1 数据获取 | 第65-66页 |
| 4.2.2 数据处理 | 第66页 |
| 4.2.3 选择压力分析 | 第66-67页 |
| 4.3 结果 | 第67-79页 |
| 4.3.1 哺乳动物主要枝系脂质代谢通路基因选择压力分析 | 第67-72页 |
| 4.3.2 鲸类脂质代谢通路基因选择压力分析 | 第72-79页 |
| 4.4 讨论 | 第79-81页 |
| 4.5 结论 | 第81-82页 |
| 第5章 总结 | 第82-84页 |
| 附录A | 第84-86页 |
| 附录B | 第86-90页 |
| 附录C | 第90-128页 |
| 附录D | 第128-133页 |
| 参考文献 | 第133-152页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第152-153页 |
| 致谢 | 第153-154页 |
