| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 前言 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-42页 |
| 第一节 常用 DNA 分子标记的种类及特点 | 第14-18页 |
| 1 概述 | 第14页 |
| 2 分类 | 第14-18页 |
| ·限制性片段长度多态性 | 第15页 |
| ·随机扩增多态性 | 第15-16页 |
| ·微卫星标记 | 第16页 |
| ·扩增片段长度多态性 | 第16-17页 |
| ·单核苷酸多态性 | 第17页 |
| ·表达序列标签 | 第17-18页 |
| 第二节 遗传连锁图谱的构建 | 第18-28页 |
| 1 连锁图谱构建原理 | 第18-19页 |
| 2 作图群体 | 第19-20页 |
| ·亲本选配 | 第19页 |
| ·分离群体类型 | 第19-20页 |
| ·群体大小 | 第20页 |
| 3 作图标记 | 第20-21页 |
| 4 水产动物遗传图谱构建常用软件 | 第21-22页 |
| 5 多群体遗传连锁图谱的整合 | 第22-23页 |
| 6 遗传连锁图谱的应用 | 第23-25页 |
| ·定位克隆 | 第23-24页 |
| ·分子标记辅助育种 | 第24页 |
| ·比较基因组作图 | 第24-25页 |
| 7 水产养殖动物的遗传图谱研究进展 | 第25-28页 |
| 第三节 QTL 定位 | 第28-33页 |
| 1 QTL 定位原理 | 第28页 |
| 2 QTL 定位的统计分析方法 | 第28-30页 |
| ·单标记法 | 第28-29页 |
| ·区间作图法 | 第29页 |
| ·复合区间作图法 | 第29-30页 |
| 3 QTL 定位常用分析软件 | 第30页 |
| 4 水产养殖动物的 QTL 定位研究进展 | 第30-32页 |
| 5 QTL 定位的局限性 | 第32-33页 |
| 第四节 连锁不平衡分析 | 第33-39页 |
| 1 连锁不平衡概念 | 第33页 |
| 2 影响连锁不平衡的因素 | 第33-35页 |
| 3 连锁不平衡的应用 | 第35-37页 |
| ·连锁不平衡作图 | 第35-37页 |
| ·种群遗传学研究 | 第37页 |
| 4 连锁作图和连锁不平衡作图的整合 | 第37-39页 |
| 第五节 本研究的目标、研究内容与技术路线 | 第39-42页 |
| 1 研究目标 | 第39页 |
| 2 研究内容 | 第39-41页 |
| ·长牡蛎遗传图谱构建 | 第39-40页 |
| ·长牡蛎生长性状和性别相关 QTL 检测 | 第40页 |
| ·长牡蛎连锁不平衡分析 | 第40-41页 |
| 3 技术路线 | 第41-42页 |
| 第二章 长牡蛎遗传图谱构建 | 第42-71页 |
| 第一节 长牡蛎 AFLP 和微卫星标记遗传图谱构建 | 第42-62页 |
| 0 引言 | 第42-43页 |
| 1 材料与方法 | 第43-55页 |
| ·构建牡蛎作图家系 | 第43-44页 |
| ·作图家系 | 第43页 |
| ·DNA 提取 | 第43-44页 |
| ·微卫星标记分析 | 第44-48页 |
| ·引物序列 | 第44-45页 |
| ·微卫星 PCR 扩增 | 第45页 |
| ·扩增产物检测 | 第45-48页 |
| ·AFLP 标记分析 | 第48-52页 |
| ·DNA 酶切 | 第48-49页 |
| ·接头连接反应 | 第49页 |
| ·预选择性扩增反应 | 第49-50页 |
| ·选择性扩增反应 | 第50-51页 |
| ·AFLP 扩增产物检测及数据收集 | 第51-52页 |
| ·连锁图谱构建 | 第52-53页 |
| ·家系分离模式的选择 | 第52-53页 |
| ·基因型统计 | 第53页 |
| ·连锁分析 | 第53页 |
| ·图谱长度和覆盖率 | 第53-55页 |
| 2 结果 | 第55-59页 |
| ·偏分离 | 第55页 |
| ·连锁分析 | 第55-59页 |
| 3 讨论 | 第59-62页 |
| ·偏分离 | 第59-60页 |
| ·连锁图谱和基因组覆盖度 | 第60-62页 |
| 第二节 长牡蛎微卫星整合图谱构建 | 第62-71页 |
| 0 引言 | 第62-63页 |
| 1 材料与方法 | 第63-64页 |
| ·作图家系 | 第63页 |
| ·微卫星标记 | 第63-64页 |
| ·整合图谱构建 | 第64页 |
| 2 结果 | 第64-68页 |
| ·各作图家系遗传图谱 | 第64-65页 |
| ·微卫星标记 | 第65-66页 |
| ·整合图谱 | 第66-68页 |
| 3 讨论 | 第68-71页 |
| ·微卫星标记 | 第68页 |
| ·整合图谱 | 第68-71页 |
| 第三章 长牡蛎生长相关性状 QTL 定位 | 第71-79页 |
| 0 引言 | 第71页 |
| 1 材料与方法 | 第71-73页 |
| ·材料 | 第71-72页 |
| ·表型数据采集 | 第72页 |
| ·表型评估 | 第72页 |
| ·QTL 作图 | 第72-73页 |
| 2 结果 | 第73-76页 |
| ·数量性状分析和二分类性状作图 | 第73-75页 |
| ·雌雄个体生长差异分析 | 第75页 |
| ·生长性状相关 QTL 定位 | 第75-76页 |
| ·性别相关 QTL 定位 | 第76页 |
| 3 讨论 | 第76-79页 |
| ·QTL 分析 | 第76-77页 |
| ·性别决定 | 第77-79页 |
| 第四章 长牡蛎野生和选育群体连锁不平衡分析 | 第79-91页 |
| 0 引言 | 第79-80页 |
| 1 材料和方法 | 第80-85页 |
| ·实验群体与 DNA 提取 | 第80-81页 |
| ·实验群体 | 第80-81页 |
| ·DNA 提取 | 第81页 |
| ·微卫星标记分析 | 第81-84页 |
| ·荧光标记 | 第81-82页 |
| ·引物序列 | 第82-83页 |
| ·PCR 扩增 | 第83-84页 |
| ·毛细管电泳及数据收集 | 第84页 |
| ·统计分析 | 第84页 |
| ·连锁不平衡的计算 | 第84-85页 |
| 2 结果 | 第85-88页 |
| ·种群多样性 | 第85-87页 |
| ·连锁不平衡 | 第87-88页 |
| 3 讨论 | 第88-91页 |
| ·种群多样性 | 第88-89页 |
| ·连锁不平衡分析 | 第89-91页 |
| 总结 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-107页 |
| 学术成果 | 第107-108页 |
| 致谢 | 第108-110页 |
| 个人简历 | 第110-111页 |