| 目录 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-23页 |
| ·DNA测序基础上的土壤微生物多样性的研究进展及趋势 | 第11-17页 |
| ·DNA测序技术的发展历史和现状 | 第11-12页 |
| ·454高通量测序的原理 | 第12-14页 |
| ·土壤微生物多样性及其研究方法 | 第14页 |
| ·454测序技术在微生物研究方面的应用 | 第14-17页 |
| ·土壤氨氧化微生物的研究进展 | 第17-20页 |
| ·土壤氨氧化过程 | 第17-18页 |
| ·土壤氨氧化细菌和亚硝化细菌 | 第18页 |
| ·土壤氨氧化古菌 | 第18-19页 |
| ·环境中氨氧化作用的研究进展 | 第19-20页 |
| ·研究思路和主要内容 | 第20-23页 |
| ·研究思路与目标 | 第20-21页 |
| ·研究内容 | 第21-22页 |
| ·技术路线图 | 第22-23页 |
| 第二章 材料和方法 | 第23-33页 |
| ·材料 | 第23-25页 |
| ·供试土壤 | 第23-25页 |
| ·分子实验中用到的主要的仪器 | 第25页 |
| ·方法 | 第25-33页 |
| ·土壤含水量的测定方法 | 第25页 |
| ·土壤pH测定方法 | 第25页 |
| ·土壤铵态氮和硝态氮的测定方法 | 第25-26页 |
| ·土壤全氮的测定方法 | 第26页 |
| ·土壤有机碳的测定方法 | 第26页 |
| ·所需试剂 | 第26-28页 |
| ·土壤DNA的提取和纯化方法 | 第28-29页 |
| ·PCR扩增(Polymerase Chain Reaction) | 第29页 |
| ·聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳PCR-DGGE(Denaturing Gradient Ge Electrophoresis) | 第29-30页 |
| ·克隆文库构建以及系统发育分析 | 第30页 |
| ·定量PCR(Real-Time Polymerase Chain Reaction) | 第30-31页 |
| ·454高通量测序准备工作 | 第31-32页 |
| ·采用的统计分析软件 | 第32-33页 |
| 第三章 不同土地利用方式对土壤微生物群落结构的影响 | 第33-47页 |
| ·摘要 | 第33页 |
| ·土地利用方式变化过程中土地管理利用情况 | 第33-35页 |
| ·方法 | 第35页 |
| ·土壤理化性质测定 | 第35页 |
| ·土壤DNA提取 | 第35页 |
| ·PCR扩增 | 第35页 |
| ·定量PCR | 第35页 |
| ·454高通量测序 | 第35页 |
| ·数据分析 | 第35页 |
| ·结果 | 第35-43页 |
| ·土壤理化性质 | 第35-36页 |
| ·不同土地利用方式土壤样品高通量测序分类总结 | 第36-38页 |
| ·不同土地利用类型土壤样品土壤微生物的变化规律 | 第38-39页 |
| ·不同土地利用类型土壤微生物多样性 | 第39-41页 |
| ·不同土地利用类型土壤微生物群落结构变化影响因素 | 第41-42页 |
| ·土壤中微生物的丰度 | 第42-43页 |
| ·讨论 | 第43-47页 |
| 第四章 不同海拔土壤微生物群落结构的变化及影响因素 | 第47-69页 |
| ·摘要 | 第47页 |
| ·方法 | 第47-48页 |
| ·土壤理化性质测定 | 第47页 |
| ·土壤DNA提取 | 第47页 |
| ·PCR | 第47页 |
| ·定量PCR | 第47-48页 |
| ·454高通量测序 | 第48页 |
| ·数据分析 | 第48页 |
| ·结果 | 第48-66页 |
| ·不同海拔高度土壤样品理化性质 | 第48-49页 |
| ·土壤高通量测序结果初步分析 | 第49-50页 |
| ·土壤微生物多样性分析 | 第50-53页 |
| ·土壤微生物群落结构变化 | 第53-56页 |
| ·土壤微生物群落结构变化影响因素 | 第56-59页 |
| ·土壤AOA和AOB丰度 | 第59-60页 |
| ·土壤AOA、AOB与理化性质之间的相关性 | 第60-61页 |
| ·土壤AOA、AOB微生物群落结构 | 第61-65页 |
| ·土壤AOA、AOB群落结构影响因素 | 第65-66页 |
| ·讨论 | 第66-69页 |
| ·土壤微生物群落结构变化及影响因素 | 第66页 |
| ·氨氧化细菌和古菌的丰度的变化 | 第66-67页 |
| ·氨氧化细菌和古菌微生物群落结构的变化及影响因素 | 第67-69页 |
| 第五章 封丘潮土氨氧化作用驱动机制的研究 | 第69-81页 |
| ·摘要 | 第69页 |
| ·方法 | 第69页 |
| ·土壤DNA提取 | 第69页 |
| ·PCR(Polymerase Chain Reaction) | 第69页 |
| ·454 高通量测序 | 第69页 |
| ·数据分析 | 第69页 |
| ·结果 | 第69-78页 |
| ·高通量测序结果总结 | 第69-72页 |
| ·土壤硝化微生物的变化规律 | 第72-78页 |
| ·讨论 | 第78-81页 |
| 第六章 结论与展望 | 第81-83页 |
| ·主要结论 | 第81页 |
| ·本研究创新点 | 第81-82页 |
| ·研究展望 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-91页 |
| 致谢 | 第91-93页 |
| 作者简介 | 第93页 |
