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黑腹果蝇种组Hsp23和Hsp27基因的分子系统学与内含子得失的相关研究

摘要第1-6页
Abstract第6-9页
第一章 前言第9-18页
 1. 分子标记第9-13页
   ·限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)第9-10页
   ·随机扩增多态性DNA(Random Amplified PolymorphismDNA,RAPD)第10页
   ·扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)第10-11页
   ·简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR)第11页
   ·简单序列重复区间扩增多态性(Inter Simple Sequence Repeat DNA,ISSR)第11页
   ·序列标志位点(Sequence Tagged Sites,STS)第11-13页
 2. 内含子的丢失与获得第13-14页
 3. 黑腹果蝇种组的分子系统学研究进展第14-15页
   ·种亚组之间的分化问题第14-15页
   ·种亚组内的分化问题第15页
 4. 果蝇热激蛋白第15-17页
 5. 本研究的目的及意义第17-18页
第二章 材料与方法第18-28页
 1. 实验材料第18-19页
 2. 试剂和仪器第19-22页
   ·试剂第19页
   ·仪器第19-20页
   ·溶液及其配方第20-22页
 3. 实验方法第22-28页
   ·果蝇基因组DNA提取第22页
   ·PCR扩增第22-23页
   ·PCR产物回收第23-24页
   ·感受态细胞的制备第24页
   ·连接转化第24-25页
   ·筛选第25页
   ·质粒的抽提第25-26页
   ·重组子的鉴定及测序第26页
   ·内含子的验证第26-28页
第三章 数据处理第28-30页
 1. 序列编辑及排序第28页
 2. 检验分析第28页
   ·碱基替换饱和检验(Substitution Saturation)第28页
   ·碱基总组成频率卡方检验(Chi-Square-test)第28页
   ·选择压力检验(Neutrality Tests)第28页
   ·AU检验(Approximately Unbiased Test)第28页
 3. 序列特征分析第28页
 4. 系统发育分析第28-30页
第四章 结果与分析第30-55页
 1. 总DNA和总RNA的提取第30-31页
 2. 目的片段的获得第31-32页
 3. 检验分析第32-33页
   ·碱基替换饱和检验第32页
   ·碱基总组成频率卡方检验第32-33页
   ·选择压力检验第33页
 4. 结果分析第33-55页
   ·Hsp23基因的核酸序列分析第33-41页
   ·Hsp27基因的核酸序列分析第41-51页
   ·联合构树第51-55页
第五章 讨论第55-60页
 1. HSP23与HSP27基因的进化分析第55页
 2. 系统发育关系第55-56页
 3. 内含子的得失第56-60页
   ·剪接位点附近的突变第57-58页
   ·内含子相位第58页
   ·内含子功能第58-60页
参考文献第60-67页
攻读硕士学位期间发表的学术论文及其他成果第67-68页
致谢第68页

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