| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第一章 综述：水产经济动物的SNP研究进展 | 第10-32页 |
| 前言 | 第10页 |
| 1. SNP的检测方法 | 第10-14页 |
| ·直接测序法 | 第10-11页 |
| ·以分子杂交为基础的方法 | 第11-13页 |
| ·以构象为基础的方法 | 第13-14页 |
| ·以酶或PCR为基础的方法 | 第14页 |
| ·以化学为基础的方法 | 第14页 |
| 2. 水产动物ITS序列的研究及其应用 | 第14-19页 |
| ·鱼类ITS序列的研究及其应用 | 第14-15页 |
| ·虾蟹类ITS序列的研究及其应用 | 第15-16页 |
| ·贝类ITS序列的研究及其应用 | 第16-19页 |
| 3. 水产动物SNP的研究及其应用 | 第19-22页 |
| ·鱼类SNP的研究及其应用 | 第19-21页 |
| ·虾蟹类SNP的研究及其应用 | 第21页 |
| ·贝类SNP的研究及其应用 | 第21-22页 |
| 4. 沼虾类分子遗传学研究 | 第22-26页 |
| 5. 分子标记在水产动物杂交遗传分析中的应用 | 第26-31页 |
| 结束语 | 第31-32页 |
| 第二章 青虾ITS1序列分析及SNP位点的筛选 | 第32-47页 |
| 摘要 | 第32页 |
| 前言 | 第32-33页 |
| 1. 材料和方法 | 第33-35页 |
| ·材料 | 第33页 |
| ·基因组DNA提取 | 第33页 |
| ·扩增引物 | 第33页 |
| ·PCR扩增 | 第33-34页 |
| ·PCR产物纯化、克隆及测序 | 第34-35页 |
| ·数据处理 | 第35页 |
| 2. 结果 | 第35-43页 |
| ·青虾ITS1扩增引物的筛选 | 第35-36页 |
| ·青虾ITS1序列的碱基组成 | 第36-37页 |
| ·青虾ITS1的全序列 | 第37-38页 |
| ·青虾ITS1序列中的SNP位点 | 第38-40页 |
| ·青虾ITS1序列中的微卫星位点 | 第40页 |
| ·青虾ITS1序列中的缺失和插入 | 第40-43页 |
| 3. 讨论 | 第43-46页 |
| 4. 结论 | 第46-47页 |
| 第三章 SNP分子标记在青虾杂交遗传分析中的应用 | 第47-63页 |
| 摘要 | 第47页 |
| 前言 | 第47-48页 |
| 1. 材料和方法 | 第48-50页 |
| ·材料 | 第48页 |
| ·基因组DNA提取 | 第48页 |
| ·扩增引物 | 第48页 |
| ·PCR扩增 | 第48-49页 |
| ·PCR产物纯化、克隆及测序 | 第49页 |
| ·数据处理 | 第49-50页 |
| 2. 结果 | 第50-61页 |
| ·太湖青虾、选育青虾及其杂种ITS1序列测定 | 第50-51页 |
| ·太湖青虾、选育青虾及其杂种ITS1序列中的SNP位点 | 第51-54页 |
| ·三个群体的SNP个数、遗传杂合度 | 第54-55页 |
| ·遗传距离 | 第55-56页 |
| ·太湖青虾、选育青虾及其杂种ITS1序列中的微卫星位点 | 第56-57页 |
| ·太湖青虾、选育青虾及其杂种ITS1序列中的缺失和插入 | 第57-61页 |
| 3. 讨论 | 第61-62页 |
| 4. 结论 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-69页 |
| 附录Ⅰ：青虾32个样本ITS1序列比对 | 第69-87页 |
| 附录Ⅱ：太湖青虾、“选育青虾”及其杂种ITS1序列比对 | 第87-104页 |
| 致谢 | 第104-105页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第105页 |
