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蛋白质结构域重组构建新功能酶

摘要第1-7页
Abstract第7-14页
第一章 前言第14-38页
     ·蛋白质的合理设计第14-20页
       ·定点突变(site-directed mutation)第15-16页
       ·蛋白质的结构域重组(domain recombination)第16-19页
       ·全新的蛋白质设计(de novo design)第19-20页
     ·蛋白质的序列基序(sequence motif)和结构基序(structuremotif)第20-22页
       ·蛋白质的序列基序第20-21页
       ·蛋白质的结构基序第21-22页
     ·α/β水解酶超家族第22-28页
       ·嗜热酯酶 AFEST第24-25页
       ·嗜热酯酶 apAPH第25-26页
       ·中温脂肪酶 Lip1第26-28页
     ·立题依据和实验设计第28-29页
     ·参考文献第29-38页
第二章 结构域交换及界面优化改变酶底物特异性第38-66页
     ·引言第38-39页
     ·材料与方法第39-46页
       ·主要仪器和试剂第39页
       ·实验用菌株及质粒第39-40页
       ·实验方法第40-46页
         ·同源模建构建嵌合酶的结构模型第40页
         ·嵌合酶基因的克隆第40-42页
         ·嵌合酶的表达、纯化、性质表征及动力学测定第42-45页
         ·圆二色谱的测定第45页
         ·非变性电泳和活力染色第45-46页
     ·实验结果第46-63页
       ·嵌合酶 PA,AA 的设计第46-50页
       ·分析和优化嵌合酶的结构域界面第50-57页
       ·嵌合酶 PAR 和 AAM7 的表达和纯化第57-58页
       ·嵌合酶的性质表征第58-63页
         ·温度对嵌合酶的活力影响第58-59页
         ·pH 对嵌合酶的活力影响第59-60页
         ·嵌合酶的热稳定性第60-61页
         ·嵌合酶的底物特异性第61-63页
     ·讨论第63-64页
     ·小结第64页
     ·参考文献第64-66页
第三章 关键基序指导的结构域重组构建嗜热脂肪酶第66-96页
     ·引言第66页
     ·材料与方法第66-69页
       ·使用的数据库及软件第66-67页
       ·实验方法第67-69页
         ·关键基序查找第67-68页
         ·同源模建构建嵌合酶的结构模型第68页
         ·进化树的构建第68页
         ·嵌合酶基因的克隆第68-69页
         ·嵌合酶的表达、纯化、性质表征及动力学测定第69页
         ·圆二色谱的测定第69页
         ·分子表面静电势的计算第69页
     ·实验结果第69-90页
       ·关键基序指导的结构域重组方法(KMDR)第69-73页
       ·用 KMDR 方法设计和构建嵌合酶 LAf第73-82页
       ·嵌合酶 LAf 的基因构建,表达和纯化第82-84页
       ·嵌合酶 LAf 的性质表征第84-87页
         ·嵌合酶 LAf 的最适温度和热稳定性第84-85页
         ·嵌合酶 LAf 的最适 pH第85-87页
       ·嵌合酶 LAf 的底物特异性第87-90页
     ·讨论第90-93页
     ·小结第93页
     ·参考文献第93-96页
第四章 关键基序指导的结构域重组方法的普适性第96-116页
     ·引言第96-98页
     ·实验方法第98-100页
       ·同源模建构建嵌合酶 LAp 的结构模型第98页
       ·嵌合酶 LAp 基因的克隆第98-99页
       ·嵌合酶 LAp 的表达、纯化、性质表征及动力学测定第99页
       ·圆二色谱的测定第99页
       ·分子表面静电势的计算第99-100页
     ·实验结果第100-112页
       ·嵌合酶 LAp 的设计第100-103页
       ·嵌合酶 LAp 的构建、表达和纯化第103-104页
       ·嵌合酶 LAp 的性质表征第104-108页
         ·嵌合酶 LAp 的最适温度和热稳定性第104-106页
         ·嵌合酶 LAp 的最适 pH第106-108页
       ·嵌合酶 LAp 的底物特异性第108-109页
       ·通过定点突变提高嵌合酶 LAp 的活力第109-112页
     ·讨论第112-114页
     ·小结第114页
     ·参考文献第114-116页
创新点第116-118页
展望第118-120页
作者简介及攻读博士期间科研成果第120-122页
参与的研究课题第122-124页
致谢第124页

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