| 中文摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-33页 |
| ·植物光合作用、卡尔文循环与光呼吸 | 第11-12页 |
| ·植物光合作用与卡尔文循环 | 第11页 |
| ·光呼吸 | 第11-12页 |
| ·C_4植物光合作用 | 第12-26页 |
| ·C_4核心循环与Kranz结构 | 第12-14页 |
| ·C_4植物光合作用 | 第14-18页 |
| ·C_4植物与氮素利用 | 第14-15页 |
| ·C_4植物的分布 | 第15-16页 |
| ·C_4植物的进化原因及历程 | 第16-18页 |
| ·C_4高光效育种 | 第18-25页 |
| ·RuBisCO的优化 | 第20-21页 |
| ·C_4核心酶的特性及其转基因 | 第21-25页 |
| ·目前C_4研究的缺陷及新进展 | 第25-26页 |
| ·C_4植物研究的主要模式生物及其优缺点 | 第25页 |
| ·C_4植物研究的新进展 | 第25-26页 |
| ·抑制差减杂交(Suppression Subtractive Hybridization,SSH) | 第26-27页 |
| ·第二代测序技术及其在C_4研究中的运用 | 第27-32页 |
| ·第二代测序技术 | 第27-30页 |
| ·第二代测序在C_4研究中的运用 | 第30-32页 |
| ·Eleocharis baldwinii | 第32页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第32-33页 |
| 2 材料与方法 | 第33-38页 |
| ·实验材料 | 第33页 |
| ·实验方法 | 第33-38页 |
| ·植物材料的培养 | 第33页 |
| ·解剖结构观察 | 第33-34页 |
| ·石蜡切片 | 第33-34页 |
| ·透射电镜观察 | 第34页 |
| ·叶绿素与ABA含量测定 | 第34页 |
| ·RNA提取 | 第34页 |
| ·陆生特异表达基因差减文库的构建 | 第34-35页 |
| ·差减文库的构建 | 第34-35页 |
| ·斑点杂交 | 第35页 |
| ·序列分析 | 第35页 |
| ·转录组测序 | 第35-36页 |
| ·文库制备 | 第35页 |
| ·测序与序列拼接 | 第35-36页 |
| ·序列分析 | 第36页 |
| ·基本统计学分析 | 第36页 |
| ·基本生物信息学分析 | 第36页 |
| ·差异表达分析 | 第36页 |
| ·Real-time PCR定量分析 | 第36-37页 |
| ·DNA抽提及甲基化敏感-限制性内切酶PCR分析(Methylation-Sensitive Restriction Enzyme PCR, MSRE-PCR) | 第37-38页 |
| 3 结果与分析 | 第38-71页 |
| ·解剖学结构观察与检测 | 第38页 |
| ·RNA的提取 | 第38-41页 |
| ·陆生特异表达基因差减文库的构建 | 第41-52页 |
| ·文库的构建与检测 | 第41页 |
| ·序列描述与Real-time PCR表达量检测 | 第41-42页 |
| ·克隆功能分析 | 第42-52页 |
| ·转运子 | 第44-49页 |
| ·C_4基因 | 第49页 |
| ·光系统相关蛋白 | 第49-50页 |
| ·转录因子与调控蛋白 | 第50-52页 |
| ·转录组测序基本统计与分析 | 第52-71页 |
| ·转录组测序基本统计 | 第52页 |
| ·序列比对 | 第52-53页 |
| ·序列比对与材料分子鉴定 | 第52-53页 |
| ·序列注释 | 第53页 |
| ·表达量的统计与验证 | 第53-55页 |
| ·差异表达基因的筛选与表达谱聚类 | 第55页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第55页 |
| ·差异表达基因的表达谱聚类 | 第55页 |
| ·C_3/C_4差异表达基因的功能分析 | 第55-71页 |
| ·NAD-ME型C_4核心循环 | 第55-56页 |
| ·C_4上调表达的转运子 | 第56-62页 |
| ·卡尔文循环,柠檬酸循环与糖酵解相关基因的差异分析 | 第62-63页 |
| ·核糖体复合体与氮利用 | 第63页 |
| ·光吸收及光敏色素与C_2循环 | 第63-65页 |
| ·叶绿体的分裂与积累 | 第65页 |
| ·ABA合成与代谢 | 第65-66页 |
| ·转录因子与蛋白激酶等调控类基因 | 第66-67页 |
| ·表观修饰调控 | 第67-71页 |
| 4 讨论 | 第71-75页 |
| ·未来C_4光合作用调控研究的主要方向 | 第72-74页 |
| ·二态叶绿体的分化,定位与能量代谢 | 第72-73页 |
| ·其他与结构相关方面研究 | 第73页 |
| ·C_4核心循环基因的表达,调控与定位 | 第73-74页 |
| ·转基因光合作用改良的新思路 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-93页 |
| 附录 | 第93-94页 |
| 作者简介 | 第94-95页 |
| 致谢 | 第95页 |
