| 中文摘要 | 第1-9页 |
| 英文摘要 | 第9-11页 |
| 1 前言 | 第11-33页 |
| ·荔枝的经济意义 | 第11-12页 |
| ·中国是荔枝的发源地，种质资源非常丰富 | 第12-13页 |
| ·研究荔枝SSR标记的目的及意义 | 第13页 |
| ·国内外研究动态 | 第13-30页 |
| ·荔枝种质分析研究现状 | 第13-14页 |
| ·分子标记概况 | 第14-30页 |
| ·分子标记的产生、发展及分类 | 第15-16页 |
| ·常用的分子标记技术 | 第16-19页 |
| ·RFLP标记 | 第16-17页 |
| ·RAPD标记与SCAR标记 | 第17-18页 |
| ·AFLP标记 | 第18-19页 |
| ·SSR标记 | 第19页 |
| ·ISSR标记 | 第19页 |
| ·SSR标记技术的研究动态 | 第19-30页 |
| ·SSR的发现及分类 | 第19-20页 |
| ·SSR及各重复单元在植物中的发生频率 | 第20-21页 |
| ·开发SSR引物的方法 | 第21-28页 |
| ·SSR引物的转移扩增 | 第28-30页 |
| ·小结 | 第30-31页 |
| ·主要研究内容 | 第31-32页 |
| ·本研究的技术路线 | 第32-33页 |
| 2 材料与方法 | 第33-53页 |
| ·材料 | 第33-34页 |
| ·植物材料 | 第33-34页 |
| ·菌株 | 第34页 |
| ·所用试剂 | 第34页 |
| ·方法 | 第34-53页 |
| ·荔枝基因组DNA的提取与纯化 | 第34-35页 |
| ·DNA样品浓度、纯度的测定 | 第35-36页 |
| ·DNA浓度的精确测定 | 第36页 |
| ·DNA样品限制性内切酶的消化和检测 | 第36页 |
| ·无核荔枝A_4号基因组DNA样品的酶切与接头的连接 | 第36-38页 |
| ·接头退火 | 第36-37页 |
| ·DNA样品的酶切 | 第37页 |
| ·DNA酶切样品的连接 | 第37-38页 |
| ·DNA样品的Suppression PCR和检测 | 第38页 |
| ·DNA样品的预扩增和检测 | 第38-39页 |
| ·SAM扩增 | 第39-40页 |
| ·非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离SAM扩增产物 | 第40-43页 |
| ·非变性聚丙烯酰胺凝胶的制备 | 第40-43页 |
| ·玻璃板的清洗及处理 | 第40-41页 |
| ·5×TBE buffer的配制 | 第41页 |
| ·1×TBE电泳缓冲液的配制 | 第41页 |
| ·30％(29:1)Acrylamide贮存液的配制 | 第41-42页 |
| ·10％过硫酸铵的配制 | 第42页 |
| ·5％非变性胶的配制 | 第42页 |
| ·制胶装置的组装 | 第42-43页 |
| ·灌胶 | 第43页 |
| ·电泳装置的准备 | 第43页 |
| ·电泳 | 第43页 |
| ·银染 | 第43-44页 |
| ·SAM扩增产物的回收 | 第44-45页 |
| ·从聚丙烯酰胺凝胶上回收PCR产物 | 第44页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳回收二次SAM扩增产物 | 第44-45页 |
| ·SAM扩增产物的克隆 | 第45-48页 |
| ·连接反应 | 第45-46页 |
| ·E.coli XL1感受态细胞的制备 | 第46页 |
| ·转化 | 第46-47页 |
| ·质粒微量提取程序 | 第47页 |
| ·重组子的酶切鉴定 | 第47-48页 |
| ·重组子的穿刺培养 | 第48页 |
| ·克隆产物的测序 | 第48页 |
| ·测序结果的分析 | 第48页 |
| ·引物的设计与合成 | 第48-49页 |
| ·有用引物的筛选 | 第49-51页 |
| ·目标SSR标记的扩增 | 第49-50页 |
| ·变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析 | 第50-51页 |
| ·变性聚丙烯酰胺凝胶的制备 | 第50-51页 |
| ·电泳样品的准备 | 第51页 |
| ·电泳 | 第51页 |
| ·银染 | 第51页 |
| ·多态性引物的筛选 | 第51-52页 |
| ·多态性SSR引物的应用 | 第52页 |
| ·数据分析 | 第52-53页 |
| ·SSR标记分析及遗传多样性分析 | 第52页 |
| ·聚类分析 | 第52-53页 |
| 3 结果与分析 | 第53-73页 |
| ·荔枝叶片总DNA的提取 | 第53页 |
| ·DNA的酶切检测和抑制性PCR、预扩增产物的检测 | 第53-54页 |
| ·Selectively Amplified Microsatellite(SAM)扩增结果分析 | 第54-55页 |
| ·SAM扩增产物的回收与克隆 | 第55-56页 |
| ·SAM扩增产物的回收 | 第55页 |
| ·回收产物的克隆 | 第55-56页 |
| ·克隆产物的测序结果分析 | 第56-58页 |
| ·测序结果 | 第56页 |
| ·Sputnik分析结果 | 第56-58页 |
| ·NCBI、EMBL数据库搜索结果及其微卫星序列分析 | 第58-59页 |
| ·特异引物的设计 | 第59-61页 |
| ·有用引物的筛选 | 第61-63页 |
| ·多态性引物的筛选 | 第63-69页 |
| ·荔枝多态性SSR引物对无患子科龙眼属植物和野生荔枝的转移扩增 | 第69-70页 |
| ·遗传多样性分析 | 第70页 |
| ·聚类分析 | 第70-73页 |
| 4 讨论 | 第73-78页 |
| ·影响荔枝叶片基因组DNA提取质量的因素 | 第73-74页 |
| ·SAM法分离SSR标记的效率 | 第74-76页 |
| ·SAM法分离SSR序列的效率 | 第74页 |
| ·SSR序列的分析 | 第74-75页 |
| ·关于SSR引物的设计 | 第75页 |
| ·有关功能性SSR引物 | 第75-76页 |
| ·SAM法产生多态性SSR标记的效率 | 第76页 |
| ·海南地方荔枝品种与广东、广西和福建的荔枝品种的遗传多样性比较 | 第76-77页 |
| ·SSR标记检验荔枝种质间亲缘关系与嫁接砧木的选择 | 第77-78页 |
| 5 结论 | 第78-79页 |
| 参考文献 | 第79-88页 |
| 附录一: 88个克隆序列 | 第88-96页 |
| 致谢 | 第96页 |
