东亚针刺菝葜的系统发育学及亲缘地理学研究
| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-15页 |
| 第一章 引言 | 第15-26页 |
| ·针刺菝葜复合群概述 | 第15-20页 |
| ·形态学概述 | 第15-17页 |
| ·种群分布 | 第17-18页 |
| ·研究现状 | 第18-20页 |
| ·亲缘地理学 | 第20-24页 |
| ·简介 | 第20页 |
| ·亲缘地理学研究及相关理论 | 第20-23页 |
| ·常用研究标记 | 第23-24页 |
| ·东亚针刺菝葜复合群研究内容及目的 | 第24-26页 |
| ·存在问题 | 第24页 |
| ·研究的内容与目的 | 第24-26页 |
| 第二章 东亚针刺菝葜复合群野外资源调查及取样 | 第26-33页 |
| ·东亚针刺菝葜复合群野外调查 | 第26页 |
| ·野外调查与取样方法 | 第26页 |
| ·群体样本取样结果 | 第26-33页 |
| ·种群信息 | 第26-27页 |
| ·种群形态与生态信息 | 第27-33页 |
| 第三章 材料与方法 | 第33-50页 |
| ·仪器、试剂及其来源 | 第33页 |
| ·DNA提取 | 第33-34页 |
| ·引物筛选 | 第34-36页 |
| ·遗传多样性的检测 | 第36-37页 |
| ·中性检验 | 第37-38页 |
| ·系统发育树构建 | 第38-41页 |
| ·最大简约法分析 | 第38-39页 |
| ·最大似然法分析 | 第39-40页 |
| ·贝叶斯法分析 | 第40-41页 |
| ·谱系分化系数(GSI)检测 | 第41-42页 |
| ·单倍型网络图分析 | 第42页 |
| ·BEAST分歧时间计算 | 第42-45页 |
| ·群体遗传结构分析 | 第45-48页 |
| ·群体动态历史分析 | 第48页 |
| ·生态位模型 | 第48-50页 |
| 第四章 结果与分析 | 第50-76页 |
| ·系统发育分析结果 | 第50-54页 |
| ·系统发育树构建 | 第50-53页 |
| ·分歧时间计算 | 第53-54页 |
| ·核基因组(nDNA)序列分析 | 第54-64页 |
| ·序列特征 | 第54-55页 |
| ·单倍型分布与亲缘地理关系 | 第55页 |
| ·遗传结构和亲缘地理学结构分析 | 第55-56页 |
| ·群体动态历史分析 | 第56-64页 |
| ·叶绿体基因组(cpDNA)序列分析 | 第64-72页 |
| ·序列特征 | 第64-65页 |
| ·单倍型分布与亲缘地理关系 | 第65-68页 |
| ·遗传结构和亲缘地理学结构分析 | 第68-71页 |
| ·群体动态历史分析 | 第71-72页 |
| ·形态学分析 | 第72-74页 |
| ·生态位模型 | 第74-76页 |
| 第五章 讨论 | 第76-83页 |
| ·东亚两种针刺菝葜的界定及其系统地位 | 第76-78页 |
| ·东亚针刺菝葜复合群的种的界定 | 第76页 |
| ·东亚针刺菝葜的地理分布 | 第76-77页 |
| ·两个东亚针刺菝葜种的系统地位 | 第77-78页 |
| ·东亚两种针刺菝葜的遗传结构 | 第78-79页 |
| ·群体动态历史分析 | 第79-81页 |
| ·短梗菝葜群体动态历史分析 | 第79-80页 |
| ·华东菝葜群体动态历史分析 | 第80-81页 |
| ·东亚两种针刺菝葜间的基因交流 | 第81-83页 |
| 第六章 小结与展望 | 第83-85页 |
| ·结论 | 第83页 |
| ·展望 | 第83-85页 |
| 参考文献 | 第85-93页 |
| 附录 | 第93-94页 |
| 致谢 | 第94页 |
