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猪不同品种或发育阶段肌肉组织中差异表达EST的分离、鉴定和定位

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
第1章 文献综述第11-33页
 1 猪生长等产肉性状相关基因研究进展第11-14页
   ·猪生长和胴体性状基因研究进展第11-13页
   ·猪肉质性状基因研究进展第13-14页
 2 中国地方猪种与国外引进猪种生长等产肉性状的差异及研究现状第14-17页
 3 利用差异表达分析技术发现差异表达基因和EST第17-23页
   ·概述第17页
   ·mRNA差异显示技术(mRNA Differential Display,DD)第17-23页
     ·DD的原理第17-19页
     ·DD的改进第19-20页
     ·DD的应用第20-23页
   ·cDNA宏阵列分析技术(cDNA macroarray analysis)第23-26页
     ·cDNA宏阵列分析技术的原理第24-25页
     ·cDNA宏阵列分析技术的应用与前景第25-26页
 4 获得全长cDNA方法的研究进展第26-33页
   ·cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA end,RACE)第26-31页
     ·RACE的原理和技术改进第27-28页
     ·RACE的应用与前景第28-31页
   ·电脑克隆(In silico cloning)第31-33页
     ·电脑克隆的原理第31页
     ·电脑克隆的应用和展望第31-33页
第2章 研究目的和意义第33-34页
第3章 mRNA差异显示技术分析中外猪种眼肌组织差异表达EST第34-64页
 1 前言第34页
 2 材料和方法第34-45页
   ·材料第34-39页
     ·眼肌等组织样品第34页
     ·差异显示引物第34页
     ·定位用杂种克隆板第34-36页
     ·菌株和质粒第36-37页
     ·主要试剂来源与配制第37-39页
     ·主要仪器设备第39页
   ·试验方法第39-45页
     ·总RNA的提取、检测和DNase-Ⅰ处理第39-40页
     ·反转录、扩增及差异显示EST的检测第40-41页
     ·差异显示EST的重扩增第41页
     ·重扩增产物的回收纯化第41-42页
     ·差异表达EST与质粒载体的连接第42页
     ·DH5α感受态细胞的制备和连接产物转化DH5α第42页
     ·差异显示EST克隆后重组质粒的酶切鉴定第42-43页
     ·差异显示EST的反Northern blot鉴定第43-44页
     ·差异显示EST的Northern blot鉴定第44页
     ·猪肌肉组织新EST的组织表达谱研究第44-45页
     ·猪肌肉组织新EST的染色体定位第45页
 3 结果第45-56页
   ·总RNA的提取与检测结果第45-46页
   ·差异显示锚定引物的筛选第46页
   ·不同电泳条件对差异显示的影响第46-47页
   ·性别对差异显示的影响第47页
   ·差异显示结果第47-48页
   ·差异显示EST的重复性第48页
   ·差异显示EST的回收和重扩增第48-50页
   ·差异显示EST克隆后的酶切鉴定第50页
   ·差异显示EST序列的同源性比对第50页
   ·反Northern blot鉴定差异显示EST第50-52页
   ·Northern blot鉴定差异显示EST第52-53页
   ·猪肌肉组织新EST的组织表达谱分析第53-54页
   ·猪肌肉组织新EST的染色体定位结果第54-56页
 4 讨论第56-64页
   ·关于差异显示技术第56-59页
     ·总RNA的质量第56页
     ·差异显示引物第56-57页
     ·差异显示EST的检测和重扩增第57页
     ·差异显示EST的鉴定第57-59页
   ·关于两品种眼肌组织的差异表达EST第59-60页
   ·关于EST技术在猪基因组研究中的应用第60页
   ·关于SCHP和RH第60-62页
   ·关于下一步的工作第62-64页
第4章 中外猪种肌肉组织差异表达EST的cDNA宏阵列分析第64-72页
 1 前言第64页
 2 材料和方法第64-67页
   ·材料第64-65页
     ·眼肌组织样品第64页
     ·cDNA宏阵列尼龙膜第64页
     ·主要试剂第64-65页
   ·试验方法第65-67页
     ·总RNA的提取与检测第65页
     ·探针的制备和纯化第65页
     ·探针标记效率的检测第65页
     ·cDNA宏阵列分析杂交第65页
     ·杂交信号的收集、量化、标准化与分析第65-66页
     ·尼龙膜上探针的洗脱第66页
     ·Northern blot探针的扩增第66页
     ·Northern blot分析第66-67页
 3 结果第67-69页
   ·总RNA质量对杂交的影响第67页
   ·宏阵列分析的重复性第67页
   ·cDNA宏阵列分析两品种间眼肌基因表达的结果第67-69页
   ·Northern blot分析结果第69页
 4 讨论第69-72页
   ·关于cDNA宏阵列分析技术第69-70页
     ·RNA的质量第69-70页
     ·非特异杂交的消除第70页
     ·杂交信号的标准化第70页
   ·关于cDNA宏阵列分析技术在本研究中的可行性第70-71页
   ·关于cDNA宏阵列分析在猪基因组研究中的应用前景第71-72页
第5章 一个在不同发育阶段肌肉组织中差异表达的新EST的全长cDNA分离、定位和组织表达谱研究第72-92页
 1 前言第72页
 2 材料和方法第72-75页
   ·材料第72页
     ·组织样品第72页
     ·主要试剂第72页
   ·试验方法第72-75页
     ·新EST的获得第72-73页
     ·新EST的RACE第73-74页
     ·新EST的电脑克隆和验证第74-75页
     ·新EST的物理定位第75页
     ·新EST的组织表达谱研究第75页
 3 结果第75-90页
   ·新EST的RACE结果第75-76页
   ·新EST的3′ RACE产物的克隆、酶切结果第76页
   ·新EST的3′ RACE产物序列测定与同源性比对结果第76-80页
   ·新EST的电脑克隆结果第80-82页
   ·新EST的5′-末端电子延伸的实验验证结果第82-87页
   ·新EST的物理定位结果第87-89页
   ·新EST的组织表达谱分析第89-90页
 4 讨论第90-92页
   ·关于RACE第90页
   ·关于电脑克隆第90-91页
   ·关于新EST-M223第91-92页
第6章 小结第92-93页
参考文献第93-106页
缩略词表第106-108页
在读期间发表论文第108-109页
致谢第109页

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