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贾第虫无义介导的mRNA降解途径激活机制的研究

中文摘要第11-13页
ABSTRACT第13-15页
第一章 文献综述第16-27页
    1.1 无义介导的mRNA降解途径第16-18页
        1.1.1 翻译的正常终止与异常终止第16-17页
        1.1.2 NMD途径的几种底物第17-18页
    1.2 NMD途径中的作用因子第18-22页
        1.2.1 UPF1是NMD途径中核心的因子第18-20页
        1.2.2 UPF2的多种功能第20页
        1.2.3 UPF3介导降解元件和NMD因子第20-21页
        1.2.4 其他SMG蛋白第21页
        1.2.5 肽链释放因子第21-22页
        1.2.6 其他NMD因子第22页
    1.3 NMD途径的分子机制第22-25页
        1.3.1 EJC模型第22-23页
        1.3.2 DSE模型第23-24页
        1.3.3 伪3'-UTR模型(The faux 3'UTR model)第24-25页
        1.3.4 目前NMD研究未解决的问题第25页
    1.4 NMD途径与疾病的关系第25页
    1.5 原生生物蓝氏贾第虫NMD途径研究现状和本课题的研究意义第25-27页
第二章 贾第虫肽链释放因子与UPF1之间的关系第27-44页
    2.1 引言第27页
    2.2 实验材料第27-30页
        2.2.1 菌株与质粒第27-28页
        2.2.2 主要酶、生化试剂、引物合成和测序第28页
        2.2.3 主要实验试剂配制第28-29页
        2.2.4 实验仪器第29-30页
    2.3 实验方法第30-38页
        2.3.1 双分子荧光互补实验(BiFC)、酵母双杂交实验以及体外pull-down实验的质粒构建第30-35页
        2.3.2 BiFC实验验证GleRF1、GleRF3与GlUPF1的相互作用第35-36页
        2.3.3 酵母双杂交实验验证GleRF1、GleRF3与GlUPF1及其截短体的相互作用第36-37页
        2.3.4 体外pull-down实验及Western blotting分析验证GleRF3与GlUPF1截短体的相互作用第37-38页
    2.4 实验结果第38-43页
        2.4.1 BiFC、酵母双杂交实验以及体外pull-down实验质粒构建结果第38-41页
        2.4.2 BiFC实验验证GleRF1、GleRF3与GlUPF1的相互作用第41页
        2.4.3 酵母双杂交验证贾第虫eRF1、eRF3与UPF1具体作用结构域第41-42页
        2.4.4 体外pull-down实验补充验证贾第虫eRF3与UPF1的相互作用第42-43页
    2.5 讨论第43-44页
第三章 贾第虫SMG1与UPF1之间的相互作用第44-57页
    3.1 引言第44页
    3.2 实验材料第44-46页
        3.2.1 菌株和质粒第44页
        3.2.2 主要酶、生化试剂、引物合成和测序第44-45页
        3.2.3 主要实验试剂配制第45-46页
        3.2.4 实验仪器第46页
    3.3 实验方法第46-51页
        3.3.1 BiFC实验、酵母双杂交实验以及体外pull-down实验的质粒构建第46-48页
        3.3.2 BIFC实验验证GlSMG1各结构域与GlUPF1的相互作用第48-49页
        3.3.3 酵母双杂交实验验证GlSMG1各结构域与GlUPF1的相互作用和GlPIKK与GlUPF1各截短体的相互作用第49-50页
        3.3.4 体外pull-down实验及Western blotting分析第50-51页
    3.4 实验结果第51-55页
        3.4.1 BiFC实验、酵母双杂交实验以及体外pull-down实验的质粒构建结果第51-52页
        3.4.2 BiFC实验验证贾第虫SMG1各结构域与UPF1的相互作用第52-53页
        3.4.3 酵母双杂交验证GlSMG1与GlUPF1的相互作用第53-55页
        3.4.4 体外pull-down实验补充验证GlPIKK与GlUPF1截短体的相互作用第55页
    3.5 讨论第55-57页
第四章 贾第虫SMG1对UPF1的磷酸化修饰第57-67页
    4.1 引言第57页
    4.2 实验材料第57-58页
        4.2.1 菌株和质粒第57页
        4.2.2 主要酶、生化试剂、引物合成和测序第57页
        4.2.3 主要实验试剂配制第57-58页
        4.2.4 实验仪器第58页
    4.3 实验方法第58-62页
        4.3.1 重组质粒构建第58-59页
        4.3.2 磷酸化位点预测第59页
        4.3.3 定点突变第59-61页
        4.3.4 融合蛋白大量诱导表达第61页
        4.3.5 体外磷酸化实验第61-62页
    4.4 实验结果第62-65页
        4.4.1 重组质粒构建结果第62-63页
        4.4.2 GlUPF1截短体磷酸化位点预测与定点突变第63页
        4.4.3 融合蛋白的大量诱导表达第63-64页
        4.4.4 GlUPF1截短体及其突变体的体外磷酸化反应第64-65页
    4.5 讨论第65-67页
总结与展望第67-69页
    总结第67-68页
    展望第68-69页
参考文献第69-74页
附录1 英文缩略表第74-75页
附录2 主要仪器设备第75-76页
攻读硕士期间取得的研究成果第76-77页
致谢第77-78页
个人简介及联系方式第78-81页

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