| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4页 |
| 主要英文缩略词对照表 | 第9-10页 |
| 第1章 前言 | 第10-30页 |
| 1.1 酵母核糖体发生概述 | 第10-15页 |
| 1.2 核糖体与核糖体前体结构研究基础 | 第15-18页 |
| 1.3 透射电子显微镜成像原理 | 第18-29页 |
| 1.3.1 电子显微镜概述 | 第18-20页 |
| 1.3.2 衬度(contrast) | 第20页 |
| 1.3.3 衬度转移函数(CTF) | 第20-21页 |
| 1.3.4 信封效应和部分一致效应 | 第21-22页 |
| 1.3.5 胶片、CCD探测器和直接电子探测器 | 第22-24页 |
| 1.3.6 单颗粒重构原理 | 第24-26页 |
| 1.3.7 算法的优化 | 第26-29页 |
| 1.4 本课题的研究目的与意义 | 第29-30页 |
| 第2章 材料与方法 | 第30-46页 |
| 2.1 实验仪器 | 第30-31页 |
| 2.1.1 纯化部分 | 第30页 |
| 2.1.2 电镜部分 | 第30页 |
| 2.1.3 计算部分 | 第30-31页 |
| 2.2 试剂与耗材 | 第31-32页 |
| 2.3 菌株 | 第32页 |
| 2.4 90S颗粒的纯化 | 第32-35页 |
| 2.4.1 TAP亲和纯化 | 第33页 |
| 2.4.2 甘油密度梯度离心 | 第33-34页 |
| 2.4.3 其他90S突变体的纯化 | 第34页 |
| 2.4.4 Ig-G亲和纯化磁珠的制备 | 第34-35页 |
| 2.5 电镜样品的制备 | 第35-37页 |
| 2.5.1 负染流程 | 第36页 |
| 2.5.2 连续碳膜的制备 | 第36-37页 |
| 2.5.3 冷冻电镜制样流程 | 第37页 |
| 2.6 数据收集 | 第37-41页 |
| 2.6.1 负染数据收集 | 第37-38页 |
| 2.6.2 冷冻数据收集 | 第38-41页 |
| 2.7 数据处理 | 第41-45页 |
| 2.8 模型搭建 | 第45页 |
| 2.9 质谱与化学交联质谱 | 第45-46页 |
| 第3章 90S纯化与结构计算 | 第46-63页 |
| 3.1 90S颗粒的纯化 | 第46-47页 |
| 3.2 90S的电镜样品准备 | 第47-48页 |
| 3.3 90S的结构计算 | 第48-59页 |
| 3.3.1 负染与初始模型 | 第48-50页 |
| 3.3.2 Noc4-TAP样品计算 | 第50-52页 |
| 3.3.3 ΔDhr1/Enp1-TAP样品计算 | 第52-53页 |
| 3.3.4 ΔMtr4/Enp1-TAP样品计算 | 第53-55页 |
| 3.3.5 ΔDhr1/ΔMtr4/Enp1-TAP样品计算 | 第55-56页 |
| 3.3.6 以ΔMtr4/Enp1-TAP样品为例讨论结构计算收敛情况 | 第56-57页 |
| 3.3.7 以ΔMtr4/Enp1-TAP样品为例讨论movie文件处理结果 | 第57-59页 |
| 3.4 小结 | 第59-63页 |
| 第4章 90S结构描述 | 第63-89页 |
| 4.1 90S的结构框架 | 第63-65页 |
| 4.2 UTP-B | 第65页 |
| 4.3 UTP-A | 第65-67页 |
| 4.4 U3-snoRNP | 第67-70页 |
| 4.5 其他5’ETS蛋白 | 第70页 |
| 4.6 5’ETSRNA与U3-snoRNA5’端 | 第70-75页 |
| 4.7 5’结构域 | 第75-77页 |
| 4.8 central结构域 | 第77-78页 |
| 4.9 3’major结构域 | 第78-79页 |
| 4.10 3’minor结构域 | 第79-87页 |
| 4.11 小结 | 第87-89页 |
| 第5章 5’ETSRNA的降解机制 | 第89-97页 |
| 5.1 ΔDhr1/Enp1-TAP纯化出的90S的三个状态 | 第89-92页 |
| 5.2 5’ETSRNA是由Mtr4介导降解的 | 第92-97页 |
| 第6章 总结与展望 | 第97-105页 |
| 6.1 核糖体小亚基加工体90S结构研究的讨论与总结 | 第97-99页 |
| 6.2 已发表90S结构的讨论与比较 | 第99-102页 |
| 6.3 核糖体发生领域和电镜领域的展望 | 第102-105页 |
| 参考文献 | 第105-114页 |
| 致谢 | 第114-117页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第117页 |
