| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4-5页 |
| 第一章 绪论 | 第9-21页 |
| 1.1 稻曲病研究进展 | 第9-14页 |
| 1.1.1 稻曲病的发现及分类地位 | 第9页 |
| 1.1.2 稻曲病的症状与危害 | 第9-11页 |
| 1.1.3 稻曲菌毒素 | 第11页 |
| 1.1.4 稻曲病菌的侵染循环 | 第11-12页 |
| 1.1.5 稻曲病接种 | 第12-13页 |
| 1.1.6 稻曲病菌的分级标准 | 第13页 |
| 1.1.7 稻曲病综合防控技术 | 第13-14页 |
| 1.2 数量性状QTL定位研究进展 | 第14-17页 |
| 1.2.1 QTL定位作图群体 | 第14-15页 |
| 1.2.2 简单序列重复(SSR) | 第15页 |
| 1.2.3 SSR标记在水稻中开发 | 第15页 |
| 1.2.4 SSR标记在水稻基因定位中的应用 | 第15-17页 |
| 1.2.5 水稻稻曲病抗性QTL研究进展 | 第17页 |
| 1.3 RNA-SEQ测序技术 | 第17-20页 |
| 1.3.1 RNA-Seq技术原理 | 第18页 |
| 1.3.2 RNA-Seq技术优势与不足 | 第18-19页 |
| 1.3.3 数字基因表达谱升级版(RNA-seq) | 第19页 |
| 1.3.4 RNA-Seq技术在植物与病原物互作中的应用 | 第19-20页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第20-21页 |
| 第二章 水稻MR183-2抗稻曲病QTL定位 | 第21-36页 |
| 2.1 试验材料 | 第21页 |
| 2.1.1 供试水稻材料 | 第21页 |
| 2.1.2 稻曲球采集 | 第21页 |
| 2.1.3 SSR标记来源及引物 | 第21页 |
| 2.2 试验方法 | 第21-24页 |
| 2.2.1 水稻种植和管理 | 第21-22页 |
| 2.2.2 稻曲病分级标准 | 第22页 |
| 2.2.3 SSR基因型分析 | 第22-24页 |
| 2.2.4 遗传图谱的构建及QTL检测 | 第24页 |
| 2.3 结果与分析 | 第24-34页 |
| 2.3.1 表型分析 | 第24-26页 |
| 2.3.2 分子标记分析 | 第26-27页 |
| 2.3.3 遗传图谱构建 | 第27-34页 |
| 2.3.4 抗性QTL定位 | 第34页 |
| 2.4 讨论 | 第34-35页 |
| 2.4.1 自然诱发稻曲病发生 | 第34-35页 |
| 2.4.2 引物的多态性 | 第35页 |
| 2.4.3 QTL定位与前人研究结果比较 | 第35页 |
| 2.5 结论 | 第35-36页 |
| 第三章 抗/感品种响应稻曲病菌侵染的表达谱分析 | 第36-84页 |
| 3.1 材料与方法 | 第36-41页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第36页 |
| 3.1.2 试验方法 | 第36-41页 |
| 3.2 结果与分析 | 第41-81页 |
| 3.2.1 稻曲病菌接种水稻抗病IR28和感病LYP9的表型 | 第41-43页 |
| 3.2.2 水稻总RNA电泳检测 | 第43页 |
| 3.2.3 表达谱RNA测序前质量评估 | 第43-46页 |
| 3.2.4 测序评估 | 第46-49页 |
| 3.2.5 差异表达基因筛选 | 第49-50页 |
| 3.2.6 GO富集分析 | 第50-59页 |
| 3.2.7 聚类分析抗病IR28和感病LYP9被P1菌株侵染后的表达谱 | 第59-60页 |
| 3.2.8 蛋白激酶(含受体蛋白激酶)参与了水稻抗稻曲病 | 第60-66页 |
| 3.2.9 病程相关基因(PR)参与了水稻抗稻曲病 | 第66-71页 |
| 3.2.10 植保素相关基因参与了水稻抗稻曲病 | 第71-73页 |
| 3.2.11 WRKY转录因子基因参与了水稻抗稻曲病 | 第73-76页 |
| 3.2.12 顺式作用元件分析 | 第76-79页 |
| 3.2.13 qRT-PCR验证水稻抗稻曲病基因表达 | 第79-81页 |
| 3.3 讨论 | 第81-83页 |
| 3.3.1 病程相关基因蛋白(PR蛋白)可能在水稻与稻曲病菌互作中发挥重要作用 | 第81-82页 |
| 3.3.2 植保素合成相关基因在抗稻曲病中具有重要作用 | 第82页 |
| 3.3.3 抗稻曲病相关的WRKY转录因子基因 | 第82-83页 |
| 3.3.4 蛋白激酶在稻曲病菌侵染水稻早期扮演重要角色 | 第83页 |
| 3.4 结论 | 第83-84页 |
| 第四章 全文总结与研究展望 | 第84-86页 |
| 4.1 论文创新点 | 第84页 |
| 4.2 今后工作展望 | 第84-86页 |
| 参考文献 | 第86-95页 |
| 附录 荧光核酸恒温扩增技术定量检测种子和土壤中稻曲病菌 | 第95-109页 |
| 参考文献 | 第107-109页 |
| 致谢 | 第109-110页 |
| 作者简介 | 第110页 |
