| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 第一章 前言 | 第15-27页 |
| 1 海洋微生物的多样性 | 第15-17页 |
| 1.1 海洋微生物的生存环境多样性 | 第15-16页 |
| 1.2 海洋微生物的物种多样性 | 第16-17页 |
| 2 海洋微生物多样性研究概况 | 第17-21页 |
| 2.1 海洋微生物研究的传统方法与其局限性 | 第17-18页 |
| 2.2 海洋微生物研究的非培养技术 | 第18页 |
| 2.3 海洋微生物培养新方法 | 第18-21页 |
| 2.3.1 传统培养法的改进 | 第18-19页 |
| 2.3.2 新型培养方法 | 第19-21页 |
| 3 海洋新菌的分类鉴定 | 第21-25页 |
| 3.1 基于遗传学的分类鉴定 | 第21-23页 |
| 3.1.1 16S rRNA 基因序列分析 | 第21-22页 |
| 3.1.2 G+C 含量 | 第22页 |
| 3.1.3 DNA-DNA 杂交 | 第22页 |
| 3.1.4 其他基因分析 | 第22-23页 |
| 3.1.5 核酸指纹识别 | 第23页 |
| 3.1.6 全基因组序列 | 第23页 |
| 3.2 表型特征鉴定与描述 | 第23-25页 |
| 3.2.1 形态学、生理学与生物化学特征描述 | 第23-24页 |
| 3.2.2 化学特征描述 | 第24-25页 |
| 3.3 快速鉴定系统 | 第25页 |
| 4 本论文研究的目的和意义 | 第25-27页 |
| 第二章 南海深海微生物的分离培养 | 第27-40页 |
| 1 实验材料与仪器 | 第27-28页 |
| 1.1 培养基 | 第27页 |
| 1.2 主要仪器 | 第27-28页 |
| 2 实验方法 | 第28-31页 |
| 2.1 样品采集 | 第28页 |
| 2.2 传统方法分离培养 | 第28页 |
| 2.3 高通量法分离培养 | 第28-31页 |
| 2.3.1 微生物的包埋 | 第28-29页 |
| 2.3.2 模拟原位环境培养 | 第29-30页 |
| 2.3.3 光学和荧光显微镜观察 | 第30页 |
| 2.3.4 流式细胞仪分选 | 第30页 |
| 2.3.5 富集培养、分离纯化与菌种保藏 | 第30页 |
| 2.3.6 16S rDNA 序列分析 | 第30页 |
| 2.3.7 序列比对及系统树的构建 | 第30-31页 |
| 3 实验结果 | 第31-37页 |
| 3.1 平板法分离菌株结果 | 第31-36页 |
| 3.2 微球光镜及荧光显微镜观察结果 | 第36-37页 |
| 3.3 高通量筛选及测序结果 | 第37页 |
| 4 讨论 | 第37-40页 |
| 第三章 三株海洋新菌新种—狭长海水菌（Aquimarina longa sp. nov.），太平洋海水菌（Aquimarina pacifica sp. nov.），巨大海水菌（Aquimarina megaterium sp. nov.）的分类鉴定 | 第40-72页 |
| 1. 实验材料与仪器 | 第41-42页 |
| 1.1 菌株 | 第41页 |
| 1.2 主要仪器 | 第41页 |
| 1.3 试剂及培养基 | 第41-42页 |
| 2. 实验方法 | 第42-53页 |
| 2.1 菌株的分离、纯化及保藏 | 第42-43页 |
| 2.2 基于遗传学的分类鉴定 | 第43-45页 |
| 2.2.1 实验菌株 16S rDNA 序列测定 | 第43-45页 |
| 2.2.2 DNA G+C 含量测定 | 第45页 |
| 2.3 表型特征鉴定 | 第45-53页 |
| 2.3.1 实验菌株菌落、菌体形态及运动性鉴定 | 第45-46页 |
| 2.3.2 实验菌株经典生理生化鉴定 | 第46-50页 |
| 2.3.3 实验菌株 API 快速鉴定系统 | 第50-51页 |
| 2.3.4 化学分类特征 | 第51-53页 |
| 3. 结果与分析 | 第53-71页 |
| 3.1 基于遗传学的分析结果 | 第53-56页 |
| 3.1.1 SW024~T、SW150~T和 XH134~T16S rDNA 测序结果、分析及系统发生树 | 第53-56页 |
| 3.1.2 G+C mol%含量 | 第56页 |
| 3.2 基于表型特征的鉴定结果 | 第56-71页 |
| 3.2.1 菌落形态及菌体形态 | 第56-58页 |
| 3.2.2 生理生化特征 | 第58-65页 |
| 3.2.3 化学分类特征 | 第65-71页 |
| 4. 结论 | 第71-72页 |
| 第四章 海洋新种-青岛大洋杆菌（Oceanobacter qingdaonensis sp. nov.）的初步鉴定 | 第72-81页 |
| 1. 实验材料与仪器 | 第73-74页 |
| 1.1 菌株 | 第73页 |
| 1.2 主要仪器 | 第73页 |
| 1.3 试剂及培养基 | 第73-74页 |
| 2. 实验方法 | 第74-75页 |
| 2.1 菌株的分离、纯化及保藏 | 第74页 |
| 2.2 基于遗传学的分类鉴定 | 第74页 |
| 2.2.1 实验菌株 16S rDNA 序列测定 | 第74页 |
| 2.2.2 DNA G+C 含量 | 第74页 |
| 2.3 表型特征鉴定 | 第74-75页 |
| 2.3.1 菌落、菌体形态及鉴定 | 第74页 |
| 2.3.2 经典生理生化鉴定 | 第74页 |
| 2.3.3 API 鉴定系统 | 第74页 |
| 2.3.4 脂肪酸含量测定 | 第74-75页 |
| 3. 结果与分析 | 第75-80页 |
| 3.1 基于遗传学的分析结果 | 第75-77页 |
| 3.1.1 H61~T16S rDNA 测序结果、分析及系统发生树 | 第75-77页 |
| 3.1.2 G+C mol%含量 | 第77页 |
| 3.2 基于表型特征的鉴定结果 | 第77-80页 |
| 3.2.1 H61~T菌落形态及菌体形态 | 第77-78页 |
| 3.2.2 H61~T生理生化特征 | 第78-79页 |
| 3.2.3 脂肪酸含量 | 第79-80页 |
| 4. 结论 | 第80-81页 |
| 小结 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-90页 |
| 附录 | 第90-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 个人简历 | 第92页 |
| 发表的或正在撰写的学术论文 | 第92-93页 |
