| 摘要 | 第10-13页 |
| ABSTRACT | 第13-15页 |
| 缩略词表 | 第16-17页 |
| 第一章 猪抗病育种研究进展 | 第17-26页 |
| 1、抗病育种的意义 | 第17-18页 |
| 2、抗病机理 | 第18-19页 |
| 2.1 非特异性免疫 | 第18页 |
| 2.2 特异性免疫 | 第18-19页 |
| 2.3 细胞因子 | 第19页 |
| 3、抗病育种的遗传基础 | 第19-20页 |
| 4、抗病育种的措施 | 第20-23页 |
| 4.1 直接选择 | 第21页 |
| 4.2 间接选择 | 第21-23页 |
| 4.2.1 利用免疫应答抗病育种 | 第21-22页 |
| 4.2.2 标记辅助选择(MAS) | 第22-23页 |
| 4.3 抗病主基因的选择 | 第23页 |
| 4.4 转基因工程抗病育种 | 第23页 |
| 5、抗病育种的研究成果 | 第23-24页 |
| 6、抗病育种面临的难题和展望 | 第24-25页 |
| 7、本研究的目的和意义 | 第25-26页 |
| 第二章 抗病候选基因 | 第26-40页 |
| 1、A-(1,2)岩藻糖转移酶1(GALACTOSIDE 2-ALPHA-L-FUCOSYLTRANSFERASE,FUT1)基因研究进展 | 第26-27页 |
| 1.1 FUT1基因结构 | 第26页 |
| 1.2 FUT1基因与抗病性关系的研究现状 | 第26-27页 |
| 1.3 FUT1基因多态性效应的研究 | 第27页 |
| 2、HLA-B ASSOCIATED TRANSCRIPT 2(HLA-B2)基因研究进展 | 第27-32页 |
| 2.1 SLA基因结构 | 第27-29页 |
| 2.2 SLA基因功能 | 第29-30页 |
| 2.2.1 参与T细胞应答 | 第29-30页 |
| 2.2.2 参与免疫应答的遗传控制 | 第30页 |
| 2.2.3 约束免疫细胞间的相互作用 | 第30页 |
| 2.2.4 参与抗原处理 | 第30页 |
| 2.2.5 参与免疫调节 | 第30页 |
| 2.2.6 参与免疫细胞分化 | 第30页 |
| 2.3 SLA基因在动物抗病原微生物感染中可能作用及机制 | 第30-31页 |
| 2.4 SLA基因与抗病性关系的研究现状 | 第31页 |
| 2.5 SLA基因多态性效应的研究 | 第31-32页 |
| 3、抗粘液病毒(MYXO-VIRUS RESISTANCE 1,Mx1)基因研究进展 | 第32-36页 |
| 3.1 Mx1基因结构 | 第32-34页 |
| 3.2 Mx1基因功能 | 第34-35页 |
| 3.3 Mx1基因在动物抗病原微生物感染中可能作用及机制 | 第35页 |
| 3.4 Mx1基因与抗病性关系的研究现状 | 第35页 |
| 3.5 Mx1基因多态性效应的研究 | 第35-36页 |
| 4、趋化因子12(CHEMOKINE(C-X-C MOTIF)LIGAND 12,CXCL12)基因研究进展 | 第36-39页 |
| 4.1 CXCL12基因结构 | 第36-37页 |
| 4.2 CXCL12基因功能 | 第37-38页 |
| 4.2.1 对免疫细胞的趋化作用 | 第37页 |
| 4.2.2 调节血细胞发育 | 第37-38页 |
| 4.2.3 参与胚胎期器官的发育 | 第38页 |
| 4.2.4 在肿瘤的转移过程的趋化作用 | 第38页 |
| 4.3 CXCL12基因信号通路 | 第38页 |
| 4.4 CXCL12基因与疾病关系的研究现状 | 第38-39页 |
| 5、常染色质组蛋白赖氨酸甲基化转移酶2(EUCHROMATIC HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE2,EHMT2)基因研究进展 | 第39-40页 |
| 5.1 EHMT2结构 | 第39页 |
| 5.2 EHMT2基因功能 | 第39-40页 |
| 第三章 材料和方法 | 第40-52页 |
| 1、材料 | 第40-43页 |
| 1.1 实验猪群与性状记录 | 第40-41页 |
| 1.1.1 耳组织样品 | 第40页 |
| 1.1.2 毛囊样品 | 第40页 |
| 1.1.3 血液样品 | 第40页 |
| 1.1.4 性状记录 | 第40-41页 |
| 1.2 主要仪器设备 | 第41页 |
| 1.3 主要试剂及配置 | 第41-43页 |
| 1.3.1 用于基因组DNA提取的溶液的配制 | 第41-42页 |
| 1.3.2 用于琼脂糖凝胶电泳及检测的溶液配制 | 第42页 |
| 1.3.3 用于聚丙烯酸胺凝胶电泳和银染的溶液配制 | 第42页 |
| 1.3.4 酶及其它试剂 | 第42-43页 |
| 1.4 主要分子生物学软件和数据统计分析软件 | 第43页 |
| 2、研究方法 | 第43-46页 |
| 2.1 猪基因组DNA提取 | 第43-44页 |
| 2.1.1 从血液中提取DNA的方法 | 第43-44页 |
| 2.1.2 从耳组织中提取DNA的方法 | 第44页 |
| 2.1.3 从毛囊中提取DNA的方法 | 第44页 |
| 2.2 基因组DNA质量和浓度的检测 | 第44页 |
| 2.3 PCR反应程序和产物检测 | 第44-45页 |
| 2.3.1 PCR反应程序 | 第44页 |
| 2.3.2 PCR产物检测的琼脂糖凝胶电泳检测 | 第44-45页 |
| 2.4 PCR产物的回收测序 | 第45页 |
| 2.4.1 从低熔点琼脂糖凝胶中回收纯化PCR产物 | 第45页 |
| 2.4.2 序列测定 | 第45页 |
| 2.5 PCR产物的酶切分型 | 第45页 |
| 2.6 酶切产物的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测 | 第45-46页 |
| 2.6.1 丙烯酰胺凝胶的配制 | 第45-46页 |
| 2.6.2 丙烯酰胺凝胶的灌制、上样、电泳 | 第46页 |
| 2.6.3 凝胶染色 | 第46页 |
| 3、五个候选基因SNP筛选及其检测 | 第46-52页 |
| 3.1 猪FUT1基因SNP位点检测 | 第46-47页 |
| 3.2 猪HLA-B2基因SNP位点筛选及其SNP位点检测 | 第47-48页 |
| 3.3 猪Mx1基因SNP位点筛选及其SNP位点检测 | 第48-49页 |
| 3.4 猪CXCL12基因SNP位点筛选及其SNP位点检测 | 第49-50页 |
| 3.5 猪EHMT2基因SNP位点筛选及其SNP位点检测 | 第50-52页 |
| 第四章 结果与分析 | 第52-96页 |
| 1、猪FUT1基因变异及其抗病的遗传效应分析 | 第52-57页 |
| 1.1 猪FUT1基因PCR产物的检测 | 第52页 |
| 1.2 猪FUT1基因Hin6Ⅰ多态性检测 | 第52-53页 |
| 1.3 猪FUT1基因Hin6Ⅰ多态位点在不同猪群中的分布 | 第53-54页 |
| 1.4 猪FUT1基因变异在不同猪群中分布的χ2检验 | 第54-55页 |
| 1.5 猪FUT1基因变异对健康及发病猪群的遗传效应分析 | 第55-56页 |
| 1.5.1 FUT1基因三种基因型在健康猪、康复猪、正发病猪和死亡四个猪群中的频率分布及发病相对危险度分析 | 第55页 |
| 1.5.2 FUT1基因三种基因型在健康猪、发病猪(康复猪、正发病猪和死亡)两个猪群中的分布、发病相对危险度分析 | 第55-56页 |
| 1.6 猪FUT1基因不同基因型与免疫性状的关联分析 | 第56页 |
| 1.7 FUT1基因不同基因型与血常规指标的关联分析 | 第56-57页 |
| 2、猪HLA-B2基因变异及其抗病的遗传效应分析 | 第57-64页 |
| 2.1 猪HLA-B2基因PCR产物的检测 | 第57页 |
| 2.2 猪HLA-B2基因SNP的检测 | 第57-58页 |
| 2.3 猪HLA-B2基因在不同猪群中SNP多态性检测 | 第58页 |
| 2.4 猪HLA-B2基因变异在不同猪群中分布的效应分析 | 第58-59页 |
| 2.5 猪HLA-B2基因变异在不同猪群中分布的χ2检验 | 第59-60页 |
| 2.6 猪HLA-B2基因变异对健康及发病猪群的遗传效应分析 | 第60-62页 |
| 2.6.1 HLA-B2基因三种基因型在健康猪、康复猪、正发病猪和死亡四个猪群中的频率分布、发病相对危险度分析 | 第60-61页 |
| 2.6.2 HLA-B2基因三种基因型在健康猪、发病猪(康复猪、正发病猪和死亡)两个猪群中的分布、发病相对危险度分析 | 第61-62页 |
| 2.7 猪HLA-B2基因不同基因型与免疫性状和血常规指标的关联分析 | 第62-64页 |
| 3、猪Mxl基因变异及其抗病的遗传效应分析 | 第64-71页 |
| 3.1 猪Mx1基因PCR产物的检测 | 第64页 |
| 3.2 猪Mx1基因SNP的检测 | 第64-65页 |
| 3.3 猪Mx1基因在不同猪群中SNP位点的多态性检测 | 第65页 |
| 3.4 猪Mx1基因变异在不同猪群中分布的效应分析 | 第65-66页 |
| 3.5 猪Mx1基因变异在不同猪群中分布的χ2检验 | 第66-67页 |
| 3.6 猪Mx1基因变异对健康及发病猪群的遗传效应分析 | 第67-69页 |
| 3.6.1 Mx1基因三种基因型在健康猪、康复猪、正发病猪和死亡四个猪群中的频率分布、发病相对危险度分析 | 第67-68页 |
| 3.6.2 Mx1基因三种基因型在健康猪、发病猪(康复猪、正发病猪和死亡)两个猪群中的分布、发病相对危险度分析 | 第68-69页 |
| 3.7 猪Mx1基因不同基因型与免疫指标和血常规指标的关联分析 | 第69-71页 |
| 4、猪CXCL12基因变异及其抗病的遗传效应分析 | 第71-90页 |
| 4.1 猪CXCL12基因PCR产物的检测 | 第71页 |
| 4.2 猪CXCL12基因SNP的检测 | 第71-72页 |
| 4.3 猪CXCL12基因在不同猪群中三个SNP位点的多态性检测 | 第72-73页 |
| 4.4 猪CXCL12基因变异在不同猪群中分布的效应分析 | 第73-76页 |
| 4.5 猪CXCL12基因变异在不同猪群中分布的χ2检验 | 第76-79页 |
| 4.6 猪CXCL12基因变异对健康及发病猪群的遗传效应分析 | 第79-84页 |
| 4.6.1 猪CXCL12-BsmAI位点变异对健康及发病猪群的遗传效应分析 | 第79-81页 |
| 4.6.1.1 CXCL12-BsmAI位点三种基因型在健康猪、康复猪、正发病猪和死亡四个猪群中的频率分布、发病相对危险度分析 | 第79-80页 |
| 4.6.1.2 CXCL12-BsmAI位点三种基因型在健康猪群、发病猪群(康复猪、正发病猪和死亡)两个猪群中的分布、发病相对危险度分析 | 第80-81页 |
| 4.6.2 猪CXCL12-BSTN1位点变异对健康及发病猪群的遗传效应分析 | 第81-82页 |
| 4.6.2.1 猪CXCL12-BSTN1位点三种基因型在健康猪、康复猪、正发病猪和死亡四个猪群中的频率分布、发病相对危险度分析 | 第81页 |
| 4.6.2.1 猪CXCL12-BSTN1位点三种基因型在健康猪、发病猪(康复猪、正发病猪和死亡)两个猪群中的分布、发病相对危险度分析 | 第81-82页 |
| 4.6.3 猪CXCL12-Bsr1位点变异对健康及发病猪群的遗传效应分析 | 第82-84页 |
| 4.6.3.1 猪CXCL12-Bsr1位点三种基因型在健康猪、康复猪、正发病猪和死亡四个猪群中的频率分布、发病相对危险度分析 | 第82-83页 |
| 4.6.3.2 猪CXCL12-Bsr1位点三种基因型在健康猪群、发病猪群(康复猪、正发病猪和死亡)两个猪群中的分布、发病相对危险度分析 | 第83-84页 |
| 4.7 猪CXCL12基因不同基因型与免疫性状和血常规指标的关联分析 | 第84-90页 |
| 4.7.1 猪CXCL12-BsmAI位点多态性与免疫指标和血常规指标的关联分析 | 第84-86页 |
| 4.7.2 猪CXCL12-BSTN1位点多态性与免疫性状和血常规指标的关联分析 | 第86-88页 |
| 4.7.3 猪CXCL12-Bsr1位点多态性与免疫指标和血常规指标的关联分析 | 第88-90页 |
| 5、猪EHMT2基因变异及其抗病的遗传效应分析 | 第90-96页 |
| 5.1 猪EHMT2基因PCR产物的检测 | 第90页 |
| 5.2 猪EHMT2基因SNP的检测 | 第90-91页 |
| 5.3 猪EHMT2基因在不同猪群中SNP位点的多态性检测 | 第91页 |
| 5.4 猪EHMT2基因变异在不同猪群中分布的效应分析 | 第91-92页 |
| 5.5 猪EHMT2基因变异在不同猪群中分布的χ2检验 | 第92-93页 |
| 5.6 猪EHMT2基因变异对健康及发病猪群的遗传效应分析 | 第93-95页 |
| 5.6.1 猪EHMT2基因三种基因型在健康猪、康复猪、正发病猪和死亡四个猪群中的频率分布、发病相对危险度分析 | 第93-94页 |
| 5.6.2 猪EHMT2基因三种基因型在健康猪群、发病猪群(康复猪、正发病猪和死亡)两个猪群中的频率分布、发病相对危险度分析 | 第94-95页 |
| 5.7 猪EHMT2基因变异位点多态性与免疫指标的关联分析 | 第95-96页 |
| 第五章 讨论 | 第96-103页 |
| 1、关于FUT1基因在不同猪群的多态性分布与大肠杆菌抗性的研究 | 第96页 |
| 2、候选基因多态性与杜长大猪群发病相对危险度关联性研究 | 第96-98页 |
| 3、候选基因多态性与杜长大三元杂交猪免疫指标的关联分析 | 第98-99页 |
| 4、血常规指标在免疫中的作用 | 第99-100页 |
| 5、候选基因多态性与长白猪的免疫及血常规指标的关联分析 | 第100-101页 |
| 6、关于数据分析的讨论 | 第101-103页 |
| 第六章 结论 | 第103-105页 |
| 1、本研究的主要结论 | 第103页 |
| 2、本研究的特色和创新 | 第103页 |
| 3、本研究的不足之处和下一步的工作 | 第103-105页 |
| 参考文献 | 第105-112页 |
| 附录 | 第112-113页 |
| 致谢 | 第113页 |
