| 符号说明与缩写词 | 第6-7页 |
| 摘要 | 第7-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 第一章 研究背景和立题依据 | 第13-27页 |
| 1.1 研究背景 | 第13-25页 |
| 1.1.1 假交替单胞菌属分类学特点 | 第13页 |
| 1.1.2 假交替单胞菌属生理生化性质研究概况 | 第13-23页 |
| 1.1.3 假交替单胞菌属基因组学和转录组学研究概况 | 第23-25页 |
| 1.2 立题依据与研究内容 | 第25-27页 |
| 1.2.1 立题依据 | 第25页 |
| 1.2.2 研究内容 | 第25-27页 |
| 第二章 假交替单胞菌属模式菌株生理生化性质的研究 | 第27-43页 |
| 2.1 引言 | 第27页 |
| 2.2 材料与方法 | 第27-35页 |
| 2.2.1 菌株 | 第27-28页 |
| 2.2.2 培养基配制 | 第28-29页 |
| 2.2.3 主要试剂、药品和试剂盒 | 第29-30页 |
| 2.2.4 主要仪器设备 | 第30-31页 |
| 2.2.5 数据库及分析软件 | 第31页 |
| 2.2.6 菌株的鉴定与培养 | 第31-34页 |
| 2.2.7 菌株碳源利用的分析 | 第34页 |
| 2.2.8 菌株生长曲线的测定 | 第34-35页 |
| 2.2.9 菌株生长速率的分析 | 第35页 |
| 2.3 结果与分析 | 第35-41页 |
| 2.3.1 菌株的菌落特征分析 | 第35-37页 |
| 2.3.2 菌株的碳源利用分析 | 第37-38页 |
| 2.3.3 菌株生长速率的结果分析 | 第38-41页 |
| 2.4 讨论 | 第41-43页 |
| 第三章 假交替单胞菌属模式菌株的基因组学分析 | 第43-58页 |
| 3.1 引言 | 第43页 |
| 3.2 材料与方法 | 第43-46页 |
| 3.2.1 菌株 | 第43页 |
| 3.2.2 培养基配制 | 第43页 |
| 3.2.3 主要试剂、药品和试剂盒 | 第43-44页 |
| 3.2.4 主要仪器设备 | 第44-45页 |
| 3.2.5 数据库 | 第45页 |
| 3.2.6 基因组的提取与测序 | 第45页 |
| 3.2.7 碳源代谢相关的基因位点分析 | 第45页 |
| 3.2.8 基于希瓦氏属细菌碳源代谢通路的假交替单胞菌属基因组的研究 | 第45-46页 |
| 3.3 结果与分析 | 第46-57页 |
| 3.4 讨论 | 第57-58页 |
| 第四章 假交替单胞菌属模式菌株的转录组学分析 | 第58-74页 |
| 4.1 引言 | 第58页 |
| 4.2 材料与方法 | 第58-61页 |
| 4.2.1 菌株 | 第58页 |
| 4.2.2 培养基配制 | 第58页 |
| 4.2.3 主要试剂、药品和试剂盒 | 第58-59页 |
| 4.2.4 主要仪器设备 | 第59-60页 |
| 4.2.5 细菌生长曲线的测定 | 第60页 |
| 4.2.6 转录组的提取与测序 | 第60-61页 |
| 4.2.7 基因表达分析 | 第61页 |
| 4.3 结果与分析 | 第61-73页 |
| 4.3.1 菌株生长曲线的结果分析 | 第61-62页 |
| 4.3.2 RNA提取结果分析 | 第62-64页 |
| 4.3.3 糖代谢中心途径相关基因的表达分析 | 第64-73页 |
| 4.4 讨论 | 第73-74页 |
| 全文总结与展望 | 第74-76页 |
| 参考文献 | 第76-89页 |
| 在读期间参与发表的论文 | 第89-90页 |
| 致谢 | 第90-91页 |
| 附件 | 第91页 |