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利用高密度SNP图谱定位甘蓝型油菜含油量及角粒相关性状QTL

摘要第7-9页
Abstract第9-11页
缩略词表第12-13页
1 前言第13-39页
    1.1 植物数量性状的遗传研究第13-22页
        1.1.1 数量性状与数量性状位点第13-14页
        1.1.2 甘蓝型油菜作图群体及遗传图谱的研究进展第14-17页
        1.1.3 QTL定位原理和方法第17-21页
        1.1.4 上位性分析第21-22页
    1.2 RAD测序技术及序列分析方法进展第22-31页
        1.2.1 RAD测序的应用及特点第23-24页
        1.2.2 RAD测序的技术方法简介第24-25页
        1.2.3 测序数据的分析方法进展第25-30页
        1.2.4 RAD测序的应用第30-31页
    1.3 油菜含油量及产量性状的研究进展第31-37页
        1.3.1 含油量及产量相关性状的遗传研究第32-34页
        1.3.2 含油量及产量性状的QTL定位第34-37页
    1.4 本研究的内容、目的与意义第37-39页
        1.4.1 研究内容第37-38页
        1.4.2 本研究的意义和目的第38-39页
2 材料和方法第39-46页
    2.1 RIL群体的构建第39页
    2.2 实验设计第39页
    2.3 性状表型鉴定第39页
    2.4 性状遗传分析第39-40页
    2.5 DNA提取、PCR扩增和凝胶电脉第40页
    2.6 测序文库的构建第40-41页
    2.7 SNP开发及基因型分析第41-43页
        2.7.1 模拟参考序列的拼接第41-42页
        2.7.2 SNP开发第42页
        2.7.3 同源序列中区分等位SNP差异第42-43页
    2.8 SSR和InDel标记来源第43页
    2.9 遗传图谱的构建第43页
    2.10 同源染色体交换的鉴定第43-44页
    2.11 QTL定位第44页
    2.12 上位性分析第44-45页
    2.13 连锁图标记位点和油菜染色体比较第45-46页
3 结果与分析第46-65页
    3.1 亲本材料含油量、角果长、每角果粒数和千粒重的遗传变异第46-48页
        3.1.1 亲本的表型分析第46-47页
        3.1.2 RIL群体四个考察性状的遗传变异第47-48页
    3.2 RIL群体的RAD测序与基因型分析第48-50页
    3.3 甘蓝型油菜遗传连锁图谱构建第50-55页
        3.3.1 遗传连锁图的构建第50-51页
        3.3.2 部分同源染色体之间发生交换第51-54页
        3.3.3 遗传连锁图与油菜基因组的共线性分析第54页
        3.3.4 标记偏分离分析第54页
        3.3.5 RIL群体基因型组成第54-55页
    3.4 甘蓝型油菜含油量、角果长、每角果粒数和千粒重的QTL定位第55-65页
        3.4.1 RIL群体含油量QTL的定位第57-59页
        3.4.2 RIL群体角果长的QTL定位第59-61页
        3.4.3 RIL群体每角果粒数的QTL定位第61页
        3.4.4 RIL群体千粒重的QTL定位第61页
        3.4.5 Unique QTL的整合第61-62页
        3.4.6 RIL群体中cqOCA10b在各个环境中对含油量的效应第62-63页
        3.4.7 RIL群体含油量和三个产量相关性状的上位性分析第63-65页
4 讨论第65-71页
    4.1 甘蓝型油菜含油量和三个产量性状QTL的定位比较第65-66页
    4.2 甘蓝型油菜QTL定位及性状间相关分析第66-67页
    4.3 cqOCA10b所在的染色体区段对油菜含油量有重要影响第67页
    4.4 cqOCA10b的候选基因预测第67-69页
    4.5 本研究定位的QTL在油菜育种中的意义第69-71页
5 结论和展望第71-72页
参考文献第72-92页
致谢第92-93页
附录第93-103页
    附录1 DNA提取流程第93-94页
    附录2 在A10上定位的cqOCA10b的基因定位信息第94-102页
    附录3 作者简历及研究生阶段发表论文第102-103页

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