摘要 | 第7-9页 |
Abstract | 第9-11页 |
缩略词表 | 第12-13页 |
1 前言 | 第13-39页 |
1.1 植物数量性状的遗传研究 | 第13-22页 |
1.1.1 数量性状与数量性状位点 | 第13-14页 |
1.1.2 甘蓝型油菜作图群体及遗传图谱的研究进展 | 第14-17页 |
1.1.3 QTL定位原理和方法 | 第17-21页 |
1.1.4 上位性分析 | 第21-22页 |
1.2 RAD测序技术及序列分析方法进展 | 第22-31页 |
1.2.1 RAD测序的应用及特点 | 第23-24页 |
1.2.2 RAD测序的技术方法简介 | 第24-25页 |
1.2.3 测序数据的分析方法进展 | 第25-30页 |
1.2.4 RAD测序的应用 | 第30-31页 |
1.3 油菜含油量及产量性状的研究进展 | 第31-37页 |
1.3.1 含油量及产量相关性状的遗传研究 | 第32-34页 |
1.3.2 含油量及产量性状的QTL定位 | 第34-37页 |
1.4 本研究的内容、目的与意义 | 第37-39页 |
1.4.1 研究内容 | 第37-38页 |
1.4.2 本研究的意义和目的 | 第38-39页 |
2 材料和方法 | 第39-46页 |
2.1 RIL群体的构建 | 第39页 |
2.2 实验设计 | 第39页 |
2.3 性状表型鉴定 | 第39页 |
2.4 性状遗传分析 | 第39-40页 |
2.5 DNA提取、PCR扩增和凝胶电脉 | 第40页 |
2.6 测序文库的构建 | 第40-41页 |
2.7 SNP开发及基因型分析 | 第41-43页 |
2.7.1 模拟参考序列的拼接 | 第41-42页 |
2.7.2 SNP开发 | 第42页 |
2.7.3 同源序列中区分等位SNP差异 | 第42-43页 |
2.8 SSR和InDel标记来源 | 第43页 |
2.9 遗传图谱的构建 | 第43页 |
2.10 同源染色体交换的鉴定 | 第43-44页 |
2.11 QTL定位 | 第44页 |
2.12 上位性分析 | 第44-45页 |
2.13 连锁图标记位点和油菜染色体比较 | 第45-46页 |
3 结果与分析 | 第46-65页 |
3.1 亲本材料含油量、角果长、每角果粒数和千粒重的遗传变异 | 第46-48页 |
3.1.1 亲本的表型分析 | 第46-47页 |
3.1.2 RIL群体四个考察性状的遗传变异 | 第47-48页 |
3.2 RIL群体的RAD测序与基因型分析 | 第48-50页 |
3.3 甘蓝型油菜遗传连锁图谱构建 | 第50-55页 |
3.3.1 遗传连锁图的构建 | 第50-51页 |
3.3.2 部分同源染色体之间发生交换 | 第51-54页 |
3.3.3 遗传连锁图与油菜基因组的共线性分析 | 第54页 |
3.3.4 标记偏分离分析 | 第54页 |
3.3.5 RIL群体基因型组成 | 第54-55页 |
3.4 甘蓝型油菜含油量、角果长、每角果粒数和千粒重的QTL定位 | 第55-65页 |
3.4.1 RIL群体含油量QTL的定位 | 第57-59页 |
3.4.2 RIL群体角果长的QTL定位 | 第59-61页 |
3.4.3 RIL群体每角果粒数的QTL定位 | 第61页 |
3.4.4 RIL群体千粒重的QTL定位 | 第61页 |
3.4.5 Unique QTL的整合 | 第61-62页 |
3.4.6 RIL群体中cqOCA10b在各个环境中对含油量的效应 | 第62-63页 |
3.4.7 RIL群体含油量和三个产量相关性状的上位性分析 | 第63-65页 |
4 讨论 | 第65-71页 |
4.1 甘蓝型油菜含油量和三个产量性状QTL的定位比较 | 第65-66页 |
4.2 甘蓝型油菜QTL定位及性状间相关分析 | 第66-67页 |
4.3 cqOCA10b所在的染色体区段对油菜含油量有重要影响 | 第67页 |
4.4 cqOCA10b的候选基因预测 | 第67-69页 |
4.5 本研究定位的QTL在油菜育种中的意义 | 第69-71页 |
5 结论和展望 | 第71-72页 |
参考文献 | 第72-92页 |
致谢 | 第92-93页 |
附录 | 第93-103页 |
附录1 DNA提取流程 | 第93-94页 |
附录2 在A10上定位的cqOCA10b的基因定位信息 | 第94-102页 |
附录3 作者简历及研究生阶段发表论文 | 第102-103页 |