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甘蓝型油菜矮秆基因定位、克隆及功能分析

摘要第8-10页
Abstract第10-12页
缩略语表第13-14页
1 文献综述第14-37页
    1.1 油菜研究的意义和应用价值第14-15页
    1.2 油菜株高与其菜籽产量和生物学产量密切相关第15页
    1.3 作物矮秆突变体的遗传研究和应用现状第15-21页
        1.3.1 水稻矮秆突变体的遗传研究和应用第16页
        1.3.2 小麦矮秆突变体的遗传研究和应用第16-17页
        1.3.3 甘蓝型油菜矮秆突变体的遗传研究以及矮化育种中的探索第17-21页
    1.4 甘蓝型油菜矮秆基因的定位克隆研究进展第21-23页
    1.5 甘蓝型油菜及其祖先种与拟南芥基因组的比较研究第23-26页
    1.6 植物矮秆基因的生物学功能和矮化机理研究第26-36页
        1.6.1 赤霉素与植物矮化第26-33页
            1.6.1.1 赤霉素的合成代谢与植物株矮化第26-28页
            1.6.1.2 赤霉素的信号传递与植物矮化第28-33页
                1.6.1.2.1 赤霉素信号传导第28-29页
                1.6.1.2.2 GA受体状态与植物矮化第29-30页
                1.6.1.2.3 DELLA蛋白状态与植物矮化第30-33页
        1.6.2 生长素信号转导与植物矮化第33-35页
        1.6.3 其他与株高相关因子第35-36页
    1.7 本研究的目的和意义第36-37页
2 甘蓝型油菜矮秆基因DS-3 的克隆和功能分析第37-77页
    2.1 引言第37页
    2.2 材料与方法第37-51页
        2.2.1 试验材料及来源第37-38页
        2.2.2 下胚轴的伸长与测量试验第38页
        2.2.3 群体构建以及性状调查第38-39页
        2.2.4 目标基因DS-3 的遗传定位第39-41页
            2.2.4.1 DNA的提取和基因池的构建第39页
            2.2.4.2 连锁SSR标记的筛选和开发第39-40页
            2.2.4.3 连锁图谱的构建以及比较作图第40-41页
        2.2.5 候选基因的比较测序第41-43页
            2.2.5.1 编码序列的扩增第41页
            2.2.5.2 DNA片段的回收与TA克隆第41-42页
            2.2.5.3 感受态的电击转化第42-43页
            2.2.5.4 质粒的提取、检测及测序第43页
        2.2.6 候选基因的转化验证第43-46页
            2.2.6.1 转化载体的构建第43-45页
            2.2.6.2 拟南芥的遗传转化第45页
            2.2.6.3 阳性植株的筛选和鉴定第45-46页
        2.2.7 RGA基因家族分析第46-48页
            2.2.7.1 RGA基因序列比对和亲缘关系分析第46页
            2.2.7.2 总RNA的提取和cDNA的合成第46-47页
            2.2.7.3 BnaRGAs的表达分析第47-48页
        2.2.8 位点特异性dCAPS标记的开发及多态性检测第48-49页
        2.2.9 BnaC07.RGA与BnaA06.RGA位点互作分析第49页
        2.2.10 酵母双杂交第49-51页
            2.2.10.1 酵母双杂交载体构建第49-50页
            2.2.10.2 酿酒酵母感受态细胞的制备(LiAc Method)第50页
            2.2.10.3 酵母菌的转化第50-51页
    2.3 结果与分析第51-71页
        2.3.1 甘蓝型油菜矮秆突变体ds-3 矮秆性状的鉴定第51-53页
        2.3.2 突变体ds-3 矮秆性状的遗传分析第53-55页
        2.3.3 DS-3 基因的定位第55-58页
            2.3.3.1 DS-3 连锁标记的筛选第55-56页
            2.3.3.2 DS-3 目标区间连锁图的构建和比较作图第56-58页
        2.3.4 DS-3 候选基因的克隆和比较测序第58-61页
            2.3.4.1 DS-3 候选基因的克隆和测序第58-61页
        2.3.5 BnaC07.rga-ds转化野生型拟南芥第61-63页
        2.3.6 白菜、甘蓝及甘蓝型油菜RGA基因家族成员分析第63-69页
            2.3.6.1 白菜、甘蓝及甘蓝型油菜种RGA基因的拷贝数和亲缘关系第63-67页
            2.3.6.2 BnaRGAs的表达分析以及其功能发挥与GA的关系第67-69页
        2.3.7 DS-3 对株高的调控力弱于DS-1第69-71页
    2.4 讨论第71-77页
        2.4.1 矮秆突变体ds-3 在油菜杂交育种中的应用价值第71页
        2.4.2 VHYNP基序中的P残基对于GA介导的DELLA蛋白降解的重要性第71-73页
        2.4.3 油菜RGA功能的冗余和潜在的分化第73-74页
        2.4.4 油菜RGA作为创制优良矮秆资源靶点的可操作性第74-77页
3 甘蓝型油菜矮秆基因DS-4 的精细定位第77-96页
    3.1 引言第77页
    3.2 材料与方法第77-81页
        3.2.1 试验材料及来源第77-78页
        3.2.2 群体构建以及性状调查第78页
        3.2.3 目标基因DS-4 的遗传定位第78-79页
            3.2.3.1 DNA的提取和基因池的构建第78页
            3.2.3.2 连锁InDel标记的筛选第78-79页
            3.2.3.3 目标基因遗传连锁图的构建第79页
        3.2.4 目标区域InDel标记和SNP标记的开发第79-81页
            3.2.4.1 重测序样品准备第79-80页
            3.2.4.2 测序文库的构建第80页
            3.2.4.3 InDel、SNP变异位点的鉴定,引物设计和基因型分析第80-81页
    3.3 结果与分析第81-91页
        3.3.1 甘蓝型油菜矮秆突变体ds-4 表型鉴定第81-83页
        3.3.2 突变体ds-4 矮秆性状的遗传分析第83-84页
        3.3.3 DS-4 的初级定位第84-86页
        3.3.4 DS-4 的精细定位第86-91页
            3.3.4.1 目标区间SNP2CAPS标记开发及其基因型分析第86-88页
            3.3.4.2 目标区间SNP位点基因型分析第88-91页
    3.4 讨论第91-96页
        3.4.1 ds-4 研究的意义第91页
        3.4.2 高通量测序加速基因图位克隆的进程第91-92页
        3.4.3 作图亲本于目标基因图位克隆的重要性第92-93页
        3.4.4 ds-4 矮化机理的探究第93-96页
参考文献第96-114页
附录Ⅰ第114-116页
附录Ⅱ第116-119页
附录Ⅲ第119-120页
    个人简介第119页
    发表文章第119-120页
致谢第120-122页

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