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肽聚糖对siRNA抑制凡纳滨对虾WSSV的强化及其转录组研究

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
1 前言第12-19页
    1.1 对虾免疫系统的研究进展第12-16页
        1.1.1 对虾的先天免疫应答第12页
        1.1.2 对虾体液免疫的研究进展第12-14页
        1.1.3 对虾细胞免疫的研究进展第14-16页
    1.2 对虾抗病毒研究第16-18页
        1.2.1 RNAi途径第16-17页
        1.2.2 RNAi途径在对虾抗病毒的研究第17-18页
    1.3 本研究的目的意义第18-19页
2 溶藻弧菌肽聚糖对凡纳滨对虾肝胰腺免疫指标的影响第19-27页
    2.1 材料第19-20页
        2.1.1 菌株第19页
        2.1.2 实验药品第19页
        2.1.3 试剂配制第19页
        2.1.4 主要仪器第19-20页
        2.1.5 实验用虾第20页
    2.2 方法第20-22页
        2.2.1 溶藻弧菌肽聚糖的提取和鉴定实验第20-21页
        2.2.2 肽聚糖溶液配制第21页
        2.2.3 溶藻弧菌肽聚糖对凡纳滨对虾作用的实验第21页
        2.2.4 肝胰腺的粗酶液摄取及浓度测定第21页
        2.2.5 酸性磷酸酶(ACP)和碱性磷酸酶(AKP)的活力测定第21-22页
        2.2.6 超氧化物歧化酶(SOD)和一氧化氮合成酶(NOS)的活力测定第22页
    2.3 结果第22-26页
        2.3.1 溶藻弧菌肽聚糖得率第22页
        2.3.2 溶菌酶消化实验结果第22页
        2.3.3 总糖含量的测定实验第22-23页
        2.3.4 溶藻弧菌肽聚糖红外光谱图第23页
        2.3.5 溶藻弧菌肽聚糖对凡纳滨对虾肝胰腺ACP活力的影响第23-24页
        2.3.6 溶藻弧菌肽聚糖对凡纳滨对虾肝胰腺AKP活力的影响第24页
        2.3.7 溶藻弧菌肽聚糖对凡纳滨对虾肝胰腺SOD活力的影响第24-25页
        2.3.8 溶藻弧菌肽聚糖对凡纳滨对虾肝胰腺NOS活力的影响第25-26页
    2.4 讨论与分析第26-27页
3 溶藻弧菌肽聚糖对凡纳滨对虾抗WSSV的影响第27-37页
    3.1 材料第27-28页
        3.1.1 肽聚糖溶液第27页
        3.1.2 试剂与药品第27-28页
        3.1.3 主要仪器第28页
        3.1.4 引物设计第28页
        3.1.5 实验用虾第28页
        3.1.6 病毒粗提液第28页
    3.2 方法第28-31页
        3.2.1 WSSV粗提液提取第28-29页
        3.2.2 WSSV毒性检测实验第29页
        3.2.3 WSSV攻毒最佳浓度确定实验第29页
        3.2.4 不同浓度肽聚糖对凡纳滨对虾抗WSSV感染实验第29-30页
        3.2.5 免疫指标测定第30页
        3.2.6 数据处理第30-31页
    3.3 结果第31-36页
        3.3.1 WSSV粗提液的提取、毒性检测及最佳攻毒浓度确定第31-32页
        3.3.2 不同浓度溶藻弧菌肽聚糖对凡纳滨对虾感染WSSV后存活率的影响第32-33页
        3.3.3 注射不同浓度溶藻弧菌肽聚糖对凡纳滨对虾血清中PO活力的影响第33页
        3.3.4 注射不同浓度溶藻弧菌肽聚糖对凡纳滨对虾肝胰腺中ACP和AKP活力的影响第33-35页
        3.3.5 注射不同浓度溶藻弧菌肽聚糖对凡纳滨对虾肝胰腺中SOD活力的影响第35页
        3.3.6 注射不同浓度溶藻弧菌肽聚糖对凡纳滨对虾肝胰腺中NOS活力的影响第35-36页
    3.4 讨论与分析第36-37页
        3.4.1 溶藻弧菌肽聚糖对凡纳滨对虾非特异性指标的影响第36页
        3.4.2 溶藻弧菌肽聚糖对凡纳滨对虾免疫保护率的影响第36-37页
4 肽聚糖和siRNA对凡纳滨对虾抗WSSV的影响第37-45页
    4.1 材料第37页
        4.1.1 实验用虾第37页
        4.1.2 实验试剂与药品第37页
        4.1.3 实验仪器第37页
        4.1.4 肽聚糖提取和溶液配制第37页
        4.1.5 病毒粗提液第37页
    4.2 方法第37-39页
        4.2.1 病毒粗提液提取第37页
        4.2.2 siRNA选择与合成第37-38页
        4.2.3 荧光定量引物设计第38页
        4.2.4 标准曲线的绘制第38页
        4.2.5 siRNA最佳浓度确定实验第38页
        4.2.6 注射 0.1μg/μL siRNA对凡纳滨对虾的抗WSSV实验第38页
        4.2.7 注射 0.1μg/mL PG和vp28-siRNA对凡纳滨对虾抗WSSV的实验第38-39页
    4.3 结果第39-43页
        4.3.1 绝对定量标准曲线绘制第39-40页
        4.3.2 siRNA最佳浓度确定第40-41页
        4.3.3 注射 0.1μg/μL vp28-siRNA对凡纳滨对虾的抗WSSV存活率及WSSV携带情况第41-42页
        4.3.4 注射 0.1μg/mL肽聚糖和vp28-siRNA对凡纳滨对虾感染WSSV存活率的影响第42-43页
    4.4 讨论与分析第43-45页
5 溶藻弧菌肽聚糖和vp28-siRNA对凡纳滨对虾抗WSSV的肝胰腺转录组分析第45-66页
    5.1 材料第45页
        5.1.1 实验用虾第45页
        5.1.2 实验试剂与药品第45页
        5.1.3 实验仪器第45页
        5.1.4 肽聚糖溶液第45页
        5.1.5 siRNA溶液第45页
        5.1.6 病毒粗提液第45页
    5.2 方法第45-47页
        5.2.1 实验分组第45-46页
        5.2.2 总RNA质量检测第46页
        5.2.3 凡纳滨对虾肝胰脏转录组文库的构建及生物信息学分析流程第46页
        5.2.4 产量统计第46页
        5.2.5 组装结果分析第46-47页
        5.2.6 Unigene功能注释及GO分类第47页
        5.2.7 Unigene表达差异分析第47页
    5.3 结果第47-64页
        5.3.1 肝胰腺总RNA质量检测第47-48页
        5.3.2 凡纳滨对虾肝胰脏转录组组装结果第48-51页
        5.3.3 Unigene功能注释第51-55页
        5.3.4 Unigene差异表达第55-56页
        5.3.5 差异表达基因的通路富集分析第56-64页
    5.4 讨论与分析第64-66页
6 结论第66-68页
参考文献第68-77页
致谢第77-78页
作者简介第78-79页
导师简介第79-80页

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