团头鲂胚胎发育的转录组分析
| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-17页 |
| 1.1 鱼类远缘杂交 | 第10-12页 |
| 1.1.1 鱼类远缘杂交的研究进展 | 第10-11页 |
| 1.1.2 团头鲂的生物学特性 | 第11-12页 |
| 1.1.3 鲂鲫和鲫鲂远缘杂交实验 | 第12页 |
| 1.2 生物信息学 | 第12-16页 |
| 1.2.1 生物信息学的发展 | 第12-13页 |
| 1.2.2 第二代测序技术 | 第13-15页 |
| 1.2.3 转录组 | 第15页 |
| 1.2.4 团头鲂转录组的相关研究 | 第15-16页 |
| 1.3 本研究的目的和意义 | 第16-17页 |
| 第二章 材料与方法 | 第17-25页 |
| 2.1 实验材料 | 第17-18页 |
| 2.1.1 胚胎材料的获取 | 第17-18页 |
| 2.2 转录组测序 | 第18-23页 |
| 2.2.1 转录组从头测序 | 第18-19页 |
| 2.2.2 Unigene组装 | 第19页 |
| 2.2.3 SSR分析 | 第19-20页 |
| 2.2.4 Unigene的SNP分析 | 第20-21页 |
| 2.2.5 Unigene功能注释 | 第21-22页 |
| 2.2.6 Unigene名称注释 | 第22-23页 |
| 2.3 差异表达基因分析 | 第23-25页 |
| 2.3.1 表达量注释 | 第23页 |
| 2.3.2 差异表达基因的筛选及功能分析 | 第23-25页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第25-42页 |
| 3.1 实验结果 | 第25-40页 |
| 3.1.1 测序产量统计 | 第25-26页 |
| 3.1.2 组装质量统计 | 第26页 |
| 3.1.3 数据注释 | 第26-30页 |
| 3.1.4 SSR分析 | 第30-32页 |
| 3.1.5 SNP分析 | 第32-33页 |
| 3.1.6 CDS预测和统计 | 第33-35页 |
| 3.1.7 基因名字注释 | 第35页 |
| 3.1.8 基因表达差异分析 | 第35-40页 |
| 3.2 讨论 | 第40-42页 |
| 3.2.1 测序质量 | 第40页 |
| 3.2.2 基因表达差异 | 第40-42页 |
| 参考文献 | 第42-48页 |
| 致谢 | 第48-50页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第50页 |
