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水稻粒宽基因GS5的调控与分子机理研究

摘要第8-11页
Abstract第11-14页
缩略语表第15-16页
1. 前言第16-39页
    1.1 调控水稻粒形与粒重的基因第16-21页
        1.1.1 水稻粒形与粒重QTL的克隆第16-19页
        1.1.2 油菜素内酯对粒形粒重的影响第19-21页
    1.2 植物器官大小的决定第21-29页
        1.2.1 植物器官的构成和形成第21-22页
        1.2.2 细胞行为与器官大小第22-27页
        1.2.3 有限生长——度的把握第27-29页
    1.3 丝氨酸羧肽酶类蛋白的研究进展第29-32页
        1.3.1 丝氨酸羧肽酶类蛋白的特点第29-30页
        1.3.2 丝氨酸羧肽酶类蛋白的功能第30-32页
    1.4 植物BR信号转导研究进展第32-37页
        1.4.1 细胞膜表面受体BRI1第32-33页
        1.4.2 BRI1 的互作蛋白第33-34页
            1.4.2.1 BRI1 辅助受体BAK1第33页
            1.4.2.2 BRI1 抑制子BKI1第33-34页
            1.4.2.3 BSKs与下游信号转导第34页
        1.4.3 恢复bri1 突变表型的其它基因第34-36页
            1.4.3.1 丝氨酸羧肽酶BRS1第34-36页
            1.4.3.2 内质网系统相关基因第36页
        1.4.4 BRI1 与BAK1 的内吞第36-37页
    1.5 工作基础与研究内容第37-39页
        1.5.1 前人的研究基础第37-38页
        1.5.2 本研究拟解决的问题第38-39页
2. 材料与方法第39-49页
    2.1 材料来源第39页
    2.2 序列分析第39-40页
    2.3 载体构建与测序第40-41页
    2.4 水稻遗传转化与表型鉴定第41-44页
        2.4.1 农杆菌介导的水稻遗传转化第41页
        2.4.2 转基因植株的阳性检测第41-44页
        2.4.3 植株表型考查第44页
    2.5 外源基因的瞬时表达第44-45页
        2.5.1 农杆菌介导的烟草叶片瞬时表达第44页
        2.5.2 烟草BY-2 原生质体转化第44-45页
    2.6 目标基因的表达检测第45-47页
        2.6.1 RNA的抽提、反转录与Real-time PCR第45页
        2.6.2 激光共聚焦显微镜检测荧光蛋白第45-46页
        2.6.3 总蛋白的抽提与GUS活性定量测定第46页
        2.6.4 Western blot检测目标蛋白第46-47页
    2.7 目标蛋白的异源表达第47-48页
        2.7.1 原核表达第47页
        2.7.2 毕赤酵母表达第47-48页
    2.8 酵母双杂交筛选互作蛋白第48-49页
3. 结果与分析第49-115页
    3.1 GS5 的表达模式分析第49-52页
        3.2.1 GS5 的全生育期表达谱第49-51页
        3.2.2 GS5 在颖壳和胚乳发育过程中的表达模式第51-52页
        3.2.3 GS5 在叶片中的表达模式第52页
    3.2 GS5 表达的调控因素第52-63页
        3.2.1 启动子顺式作用元件分析第52-55页
        3.2.2 光照对GS5 表达的影响第55-58页
        3.2.3 造成幼穗中GS5 差异表达的关键位点第58-61页
        3.2.4 激素对GS5 表达的影响第61-63页
    3.3 GS5 蛋白的性质分析第63-73页
        3.3.1 GS5 蛋白氨基酸序列的分析第63-67页
        3.3.2 GS5 蛋白的异源表达第67-68页
            3.3.2.1 GS5 蛋白的原核表达第67页
            3.3.2.2 GS5 蛋白的毕赤酵母表达第67-68页
        3.3.3 水稻中超表达GS5-FLAG第68-71页
            3.3.3.1 GS5-FLAG蛋白的纯化与分析第68页
            3.3.3.2 GS5-H94 蛋白和GS5-ZS97 蛋白的功能比较第68-69页
            3.3.3.3 GS5 发挥功能可能不需要活性的发挥第69页
            3.3.3.4 GS5 特异控制粒宽第69-71页
        3.3.4 GS5 蛋白的亚细胞定位第71-73页
            3.3.4.1 超表达植株的GS5-GFP定位第71页
            3.3.4.2 烟草叶片瞬时表达GS5-GFP第71-73页
            3.3.4.3 BY-2 原生质体瞬时表达GS5-GFP第73页
    3.4 GS5 蛋白的作用途径初探第73-96页
        3.4.1 利用GS5-BD融合载体筛选酵母双杂交文库第73-80页
            3.4.1.1 GS5-BD融合载体的自激活活性检测与酵母毒性检测第73-74页
            3.4.1.2 GS5 分子内的点对点实验第74-75页
            3.4.1.3 GAL4 AD融合文库筛选第75页
            3.4.1.4 BKA筛库结果分析第75页
            3.4.1.5 互作候选基因的点对点验证第75-77页
            3.4.1.6 互作候选基因的表达谱分析第77-80页
            3.4.1.7 互作候选基因的亚细胞定位预测第80页
        3.4.2 GS5 与OsBAK1 的互作分析第80-85页
            3.4.2.1 OsBAK1 序列分析与点对点验证第80-82页
            3.4.2.2 GS5 和OsMSBP1 对OsBAK1 亚细胞定位的影响第82-85页
        3.4.3 OsBAK1 和OsMSBP1 的功能初探第85-89页
            3.4.3.1 OsBAK1 和Os MSBP1 的表达谱分析第85页
            3.4.3.2 OsBAK1 的遗传材料表型考查第85-88页
            3.4.3.3 OsMSBP1 突变体表型考查第88-89页
        3.4.4 水稻中超表达AtBRS1第89-92页
            3.4.4.1 AtBRS1 超表达材料的表型考查第89-90页
            3.4.4.2 超表达AtBRS1 和GS5 对BR合成与信号转导的影响第90页
            3.4.4.3 超表达AtBRS1 和GS5 对内质网胁迫相关基因的影响第90-92页
        3.4.5 GS5 与OsBRI1 的互作分析第92-96页
            3.4.5.1 LRR区突变的OsBRI1 蛋白的构建第92页
            3.4.5.2 GS5 与OsBRI1 的点对点实验第92-93页
            3.4.5.3 GS5 对OsBRI1 亚细胞定位的影响第93-96页
    3.5 GS5 的比较测序与进化第96-115页
        3.5.1 本室水稻核心种质材料概况第96-99页
            3.5.1.1 核心种质材料的原产地第96页
            3.5.1.2 核心种质材料的群体结构第96页
            3.5.1.3 核心种质材料的粒形多样性第96-99页
        3.5.2 GS5 的核酸多态性与中性检测第99-105页
        3.5.3 GS5 的单倍型分析第105-108页
        3.5.4 qSW5/GW5 的单倍型鉴定第108-109页
        3.5.5 GS5 与qSW5/GW5 的关系第109-112页
        3.5.6 GS5 的进化模式第112-114页
        3.5.7 qsw5/gw5 突变的分布第114-115页
4. 讨论第115-125页
    4.1 GS5 的表达调控第115-116页
    4.2 GS5 是微效基因第116-117页
    4.3 GS5 的作用机理第117-120页
    4.4 GS5 的进化模式第120-121页
    4.5 粒长和粒宽的调控第121-123页
    4.6 后续研究的着手点第123-125页
参考文献第125-136页
附录第136-176页
    附录Ⅰ:部分实验操作步骤第136-153页
        Protocol 1:感受态细胞的制备第136-137页
        Protocol 2:测序反应与产物纯化第137页
        Protocol 3:农杆菌介导的水稻遗传转化(粳稻)第137-142页
        Protocol 4:小样DNA的抽提第142页
        Protocol 5:烟草BY-2 原生质体转化第142-144页
        Protocol 6:CsCl密度梯度离心纯化质粒DNA第144-146页
        Protocol 7:植物总RNA的抽提与反转录第146页
        Protocol 8:Real-time PCR与结果的分析第146-147页
        Protocol 9:Bradford法测定蛋白质浓度与GUS活性的定量测定第147-149页
        Protocol 10:SDS-PAGE与Western blot第149-150页
        Protocol 11:酵母双杂交相关实验第150-153页
    附录Ⅱ:533 份水稻核心种质清单第153-169页
    附录Ⅲ:17 份野生稻材料清单第169-170页
    附录Ⅳ:研究中涉及的引物清单第170-175页
    附录Ⅴ:作者简介第175-176页
致谢第176-178页

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