细丽外担菌感染油茶的形态特征和转录组学研究
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-18页 |
| 1.1 油茶简介 | 第11-12页 |
| 1.1.1 油茶的营养价值 | 第11页 |
| 1.1.2 油茶的种植现况 | 第11-12页 |
| 1.2 油茶病害 | 第12-15页 |
| 1.2.1 油茶叶肿病的发病特征 | 第12页 |
| 1.2.2 油茶叶肿病病原菌 | 第12-14页 |
| 1.2.3 油茶叶肿病的研究进展 | 第14-15页 |
| 1.3 转录组学研究概况 | 第15-17页 |
| 1.3.1 转录组研究方法 | 第15-16页 |
| 1.3.2 转录组测序的应用 | 第16-17页 |
| 1.4 研究的目的和意义 | 第17-18页 |
| 第二章 油茶叶肿病的形态特征 | 第18-27页 |
| 2.1 试验材料 | 第18页 |
| 2.1.1 油茶叶片来源 | 第18页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第18页 |
| 2.2 试验方法 | 第18-20页 |
| 2.2.1 快速冷冻切片的制备与观察 | 第18页 |
| 2.2.2 扫描电镜样品的制备与观察 | 第18-19页 |
| 2.2.3 超微结构的观察 | 第19-20页 |
| 2.3 结果与分析 | 第20-26页 |
| 2.3.1 变态叶的外部形态特征 | 第20-21页 |
| 2.3.2 变态叶片的冷冻切片观察 | 第21页 |
| 2.3.3 油茶叶肿病的扫描电镜观察 | 第21-24页 |
| 2.3.4 变态叶的超微结构特征 | 第24-26页 |
| 2.4 结论与讨论 | 第26-27页 |
| 第三章 细丽外担菌侵染油茶的转录组分析 | 第27-58页 |
| 3.1 试验材料与仪器 | 第27页 |
| 3.1.1 油茶叶片 | 第27页 |
| 3.1.2 试验仪器 | 第27页 |
| 3.2 试验方法 | 第27-33页 |
| 3.2.1 总RNA提取与检测 | 第27-28页 |
| 3.2.2 转录组文库构建及测序 | 第28-29页 |
| 3.2.3 测序数据质量评估 | 第29页 |
| 3.2.4 转录本拼接 | 第29-30页 |
| 3.2.5 基因功能注释 | 第30页 |
| 3.2.6 CDS预测 | 第30-31页 |
| 3.2.7 SNP、InDel及SSR分析 | 第31页 |
| 3.2.8 基因表达水平分析 | 第31页 |
| 3.2.9 RNA-seq整体质量评估 | 第31页 |
| 3.2.10 差异表达分析和富集 | 第31-32页 |
| 3.2.11 实时定量PCR验证 | 第32-33页 |
| 3.3 结果与分析 | 第33-55页 |
| 3.3.1 测序数据质量分析 | 第33-34页 |
| 3.3.2 转录本拼接结果统计 | 第34-37页 |
| 3.3.3 基因功能注释 | 第37-41页 |
| 3.3.4 CDS预测 | 第41-43页 |
| 3.3.5 SNP、InDel和SSR分析 | 第43页 |
| 3.3.6 基因表达分析 | 第43-46页 |
| 3.3.7 差异表达分析 | 第46-54页 |
| 3.3.8 差异表达基因的qRT-PCR验证 | 第54-55页 |
| 3.4 结论与讨论 | 第55-58页 |
| 3.4.1 物理防御途径 | 第55页 |
| 3.4.2 化学防御途径 | 第55-58页 |
| 第四章 结论 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-64页 |
| 附录 | 第64-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 作者简介 | 第69页 |
