中文摘要 | 第3-5页 |
英文摘要 | 第5-6页 |
缩略词 | 第11-12页 |
1 绪论 | 第12-26页 |
1.1 引言 | 第12页 |
1.2 研究背景及进展 | 第12-24页 |
1.2.1 昆虫病原真菌的侵染机制 | 第12-14页 |
1.2.2 昆虫的先天性免疫反应 | 第14-19页 |
1.2.3 神经系统在免疫应答中的作用 | 第19-21页 |
1.2.4 化学感知与免疫 | 第21-24页 |
1.3 研究目的和研究意义 | 第24-25页 |
1.3.1 研究目的 | 第24页 |
1.3.2 研究意义 | 第24-25页 |
1.4 研究内容和技术路线 | 第25-26页 |
1.4.1 研究内容 | 第25页 |
1.4.2 技术路线 | 第25-26页 |
2 东亚飞蝗血细胞与脂肪体对绿僵菌侵染的应答 | 第26-60页 |
2.1 材料 | 第26-27页 |
2.1.1 供试菌株及昆虫 | 第26页 |
2.1.2 主要仪器设备 | 第26-27页 |
2.1.3 主要试剂及溶液 | 第27页 |
2.2 方法 | 第27-38页 |
2.2.1 样品准备 | 第27-28页 |
2.2.2 总RNA提取 | 第28页 |
2.2.3 总RNA中的基因组DNA的去除 | 第28页 |
2.2.4 转录组测序RNA样品的混合 | 第28页 |
2.2.5 转录组测序cDNA文库的制备 | 第28-29页 |
2.2.6 转录组数据的组装和注释 | 第29-32页 |
2.2.7 差异表达基因的筛选 | 第32-33页 |
2.2.8 差异Unigene的GO和Pathway分析 | 第33-35页 |
2.2.9 免疫相关基因分析 | 第35页 |
2.2.10 定量PCR验证差异表达基因 | 第35-38页 |
2.3 结果分析 | 第38-52页 |
2.3.1 Unigene组装 | 第38-39页 |
2.3.2 Unigne功能注释和分类 | 第39-42页 |
2.3.3 确定对绿僵菌侵染应答的差异表达基因 | 第42-49页 |
2.3.4 东亚飞蝗先天性免疫相关基因的确定 | 第49-50页 |
2.3.5 定量PCR分析免疫相关基因 | 第50-52页 |
2.4 讨论 | 第52-60页 |
2.4.1 微生物识别 | 第53-55页 |
2.4.2 免疫球蛋白样基因 | 第55页 |
2.4.3 调控 | 第55-56页 |
2.4.4 信号转导通路:Toll,Imd和JAK/STAT | 第56-58页 |
2.4.5 效应因子 | 第58-59页 |
2.4.6 其它免疫分子 | 第59-60页 |
3 东亚飞蝗中枢神经系统对绿僵菌侵染的应答反应 | 第60-106页 |
3.1 材料 | 第60页 |
3.1.1 供试菌株及昆虫 | 第60页 |
3.1.2 主要仪器设备 | 第60页 |
3.1.3 主要试剂及溶液 | 第60页 |
3.2 方法 | 第60-63页 |
3.2.1 确定侵染阶段 | 第60-61页 |
3.2.2 绿僵菌侵染昆虫后血细胞中虫菌体DNA含量测定 | 第61页 |
3.2.3 样品准备和测序 | 第61-62页 |
3.2.4 基因互作网络分析 | 第62页 |
3.2.5 神经系统通路分析 | 第62页 |
3.2.6 免疫相关基因的确定 | 第62页 |
3.2.7 实时荧光定量PCR验证高度差异表达的神经相关基因 | 第62-63页 |
3.3 结果分析 | 第63-102页 |
3.3.1 绿僵菌侵染东亚飞蝗侵染阶段的确定 | 第63-65页 |
3.3.2 样品准备、基因组装和注释 | 第65-67页 |
3.3.3 东亚飞蝗差异表达基因(DEGs)和它们对真菌侵染的变化趋势 | 第67-95页 |
3.3.4 神经通路相关的差异表达基因(DEGs)和它们对真菌侵染的变化 | 第95-98页 |
3.3.5 实时荧光定量PCR验证转录组差异表达基因结果 | 第98-99页 |
3.3.6 中枢神经系统中免疫相关的差异表达基因和它们对真菌侵染的表达变化 | 第99-101页 |
3.3.7 东亚飞蝗绿僵菌侵染后差异表达的化学感知蛋白 | 第101-102页 |
3.4 讨论 | 第102-106页 |
4 红火蚁OBP基因表达特征分析 | 第106-130页 |
4.1 材料 | 第106页 |
4.1.1 供试昆虫 | 第106页 |
4.1.2 主要仪器设备 | 第106页 |
4.1.3 主要试剂及溶液 | 第106页 |
4.2 方法 | 第106-111页 |
4.2.1 样品准备 | 第106页 |
4.2.2 RNA提取 | 第106-107页 |
4.2.3 基因组DNA的去除 | 第107页 |
4.2.4 cDNA合成 | 第107-108页 |
4.2.5 cDNAs绝对定量 | 第108-110页 |
4.2.6 数据分析 | 第110页 |
4.2.7 进化树和结构基元分析 | 第110-111页 |
4.3 结果与分析 | 第111-126页 |
4.3.1 红火蚁气味结合蛋白进化与连锁分析 | 第111-114页 |
4.3.2 SiOBPs在红火蚁工蚁中的表达模式 | 第114-117页 |
4.3.3 红火蚁SiOBPs在雄蚁中的表达模式 | 第117-119页 |
4.3.4 红火蚁SiOBPs在雌蚁中的表达模式 | 第119-121页 |
4.3.5 SiOBPs在红火蚁不同发育阶段的表达模式 | 第121-123页 |
4.3.6 SiOBPs进化与表达模式之间的关系 | 第123-126页 |
4.4 讨论 | 第126-130页 |
5 红火蚁CSP基因表达特征分析 | 第130-144页 |
5.1 材料 | 第130页 |
5.1.1 供试菌株及昆虫 | 第130页 |
5.1.2 主要仪器设备 | 第130页 |
5.1.3 主要试剂及溶液 | 第130页 |
5.2 方法 | 第130-131页 |
5.2.1 进化分析 | 第130页 |
5.2.2 cDNA样品准备与绝对定量 | 第130-131页 |
5.3 结果和分析 | 第131-143页 |
5.3.1 红火蚁化学感知蛋白进化与连锁分析 | 第131-135页 |
5.3.2 SiCSP在红火蚁工蚁中的表达 | 第135-137页 |
5.3.3 SiCSP在红火蚁雄蚁中的表达 | 第137-139页 |
5.3.4 SiCSP在红火蚁雌蚁中的表达 | 第139-141页 |
5.3.5 SiCSP在红火蚁不同发育阶段的表达 | 第141-143页 |
5.4 讨论 | 第143-144页 |
6 全文小结与后续工作建议 | 第144-148页 |
6.1 主要研究结果 | 第144-146页 |
6.1.1 东亚飞蝗血细胞与脂肪体对绿僵菌侵染的比较转录组研究 | 第144页 |
6.1.2 东亚飞蝗中枢神经系统对绿僵菌侵染的免疫与神经应答反应 | 第144-145页 |
6.1.3 红火蚁气味结合蛋白(OBP)的表达特征 | 第145页 |
6.1.4 红火蚁化学感知蛋白(CSP)的表达特征 | 第145-146页 |
6.2 本论文创新点 | 第146页 |
6.3 后续工作建议 | 第146-148页 |
致谢 | 第148-150页 |
参考文献 | 第150-172页 |
附录 | 第172-220页 |
A. 附表 | 第172-220页 |
B. 作者在攻读博士学位期间发表的论文目录 | 第220页 |