| 摘要 | 第8-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 第1章 绪论 | 第11-19页 |
| 1.1 海洋哺乳动物及其共生微生物群落的研究 | 第11-13页 |
| 1.1.1 海洋哺乳动物及其共生菌 | 第12-13页 |
| 1.1.1.1 海洋哺乳动物 | 第12页 |
| 1.1.1.2 瘤齿喙鲸 | 第12-13页 |
| 1.1.2 海洋哺乳动物微生物群落的研究 | 第13页 |
| 1.1.3 海洋动物肠道共生菌的研究 | 第13页 |
| 1.2 海洋放线菌的多样性及其应用 | 第13-14页 |
| 1.2.1 海洋放线菌的多样性 | 第14页 |
| 1.2.2 海洋放线菌的应用 | 第14页 |
| 1.3 放线菌的多相分类鉴定 | 第14-17页 |
| 1.3.1 表型分析 | 第15页 |
| 1.3.2 化学分析 | 第15-16页 |
| 1.3.3 分子分类 | 第16-17页 |
| 1.4 本文研究的意义 | 第17-19页 |
| 第2章 瘤齿喙鲸肠胃可培养放线菌的多样性研究 | 第19-45页 |
| 2.1 引言 | 第19页 |
| 2.2 材料与方法 | 第19-31页 |
| 2.2.1 材料 | 第19-23页 |
| 2.2.1.1 样品来源 | 第19页 |
| 2.2.1.2 菌株 | 第19-20页 |
| 2.2.1.3 引物与工具酶 | 第20页 |
| 2.2.1.4 主要溶液与试剂 | 第20-21页 |
| 2.2.1.5 主要仪器 | 第21-22页 |
| 2.2.1.6 分析软件及应用数据库 | 第22页 |
| 2.2.1.7 培养基 | 第22-23页 |
| 2.2.2 方法 | 第23-31页 |
| 2.2.2.1 分离放线菌 | 第24-25页 |
| 2.2.2.2 纯化菌株 | 第25页 |
| 2.2.2.3 KOH检测及形态观察 | 第25-26页 |
| 2.2.2.4 菌株基因组DNA的提取 | 第26页 |
| 2.2.2.5 BOX-PCR及琼脂糖凝胶电泳检测 | 第26-27页 |
| 2.2.2.6 16SrRNA基因扩增 | 第27页 |
| 2.2.2.7 构建系统进化树 | 第27-28页 |
| 2.2.2.8 保藏放线菌菌株 | 第28页 |
| 2.2.2.9 三种功能基因PCR扩增 | 第28-30页 |
| 2.2.2.10 菌株抑菌活性的筛选 | 第30-31页 |
| 2.3 结果和分析 | 第31-43页 |
| 2.3.1 放线菌多样性分析 | 第31-39页 |
| 2.3.1.1 放线菌分离 | 第31-32页 |
| 2.3.1.2 不同培养基分离放线菌多样性分析 | 第32-35页 |
| 2.3.1.3 不同样品分离出放线菌多样性分析 | 第35-37页 |
| 2.3.1.4 放线菌多样性分析 | 第37-39页 |
| 2.3.2 三种功能基因的筛选 | 第39-41页 |
| 2.3.3 抗菌活性菌株的筛选 | 第41-43页 |
| 2.4 总结 | 第43-45页 |
| 第3章 三株深海放线菌的多相分类鉴定 | 第45-98页 |
| 3.1 引言 | 第45页 |
| 3.2 材料及方法 | 第45-62页 |
| 3.2.1 材料 | 第45-50页 |
| 3.2.1.1 鉴定菌株及模式菌株的来源 | 第45页 |
| 3.2.1.2 引物及质粒 | 第45-46页 |
| 3.2.1.3 工具酶和试剂盒 | 第46页 |
| 3.2.1.4 培养基 | 第46-47页 |
| 3.2.1.5 主要试剂 | 第47-49页 |
| 3.2.1.6 主要仪器 | 第49-50页 |
| 3.2.1.7 软件和数据库 | 第50页 |
| 3.2.2 方法 | 第50-62页 |
| 3.2.2.1 分子系统学分类分析 | 第50-53页 |
| 3.2.2.2 表观特征分析 | 第53-54页 |
| 3.2.2.3 生理生化特征 | 第54-56页 |
| 3.2.2.4 化学分类分析 | 第56-62页 |
| 3.3 结果和分析 | 第62-98页 |
| 3.3.1 菌株GY0594~T的多相分类鉴定 | 第62-74页 |
| 3.3.1.1 16SrRNA系统发育进化树 | 第63-65页 |
| 3.3.1.2 DNA（G+C）mol %含量 | 第65页 |
| 3.3.1.3 表型特征 | 第65-66页 |
| 3.3.1.4 生理生化实验结果与分析 | 第66-69页 |
| 3.3.1.5 化学指标的实验结果及分析 | 第69-73页 |
| 3.3.1.6 菌株GY0594~T菌种描述 | 第73-74页 |
| 3.3.2 菌株GY0556~T的多相分类鉴定 | 第74-86页 |
| 3.3.2.1 16SrRNA系统发育进化树 | 第75-77页 |
| 3.2.2.2 DNA（G+C）mol %含量 | 第77页 |
| 3.2.2.3 DNA-DNA杂交结果及分析 | 第77页 |
| 3.3.2.4 表型特征 | 第77-78页 |
| 3.3.2.5 生理生化实验结果与分析 | 第78-82页 |
| 3.3.2.6 化学指标的实验结果及分析 | 第82-85页 |
| 3.3.2.7 菌种描述 | 第85-86页 |
| 3.3.3 菌株WP1~T的多相分类鉴定 | 第86-98页 |
| 3.3.3.1 16SrRNA系统发育进化树 | 第87-89页 |
| 3.3.3.2 DNA（G+C）mol %含量 | 第89页 |
| 3.3.3.3 DNA杂交结果及分析 | 第89页 |
| 3.3.3.4 表型特征 | 第89-90页 |
| 3.3.2.5 生理生化实验结果与分析 | 第90-94页 |
| 3.3.3.6 化学指标的实验结果及分析 | 第94-96页 |
| 3.3.2.7 菌种描述 | 第96-98页 |
| 第4章 总结与展望 | 第98-101页 |
| 参考文献 | 第101-109页 |
| 致谢 | 第109-111页 |
| 在学期间主要科研成果 | 第111页 |
| 一、发表学术论文 | 第111页 |
| 二、专利 | 第111页 |