| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第11-19页 |
| 1 环形RNA | 第11-14页 |
| 1.1 环形RNA的发现 | 第11页 |
| 1.2 国内外研究现状和发展趋势 | 第11-13页 |
| 1.3 环形RNA生成和功能 | 第13-14页 |
| 2 RNA可变剪切与环形RNA生成 | 第14-16页 |
| 2.1 可变剪切调控人类基因表达 | 第15页 |
| 2.2 可变剪切调控植物基因表达 | 第15页 |
| 2.3 可变剪切生成环形RNA | 第15-16页 |
| 3 家蚕非编码基因调控 | 第16-17页 |
| 3.1 miRNA调控家蚕基因研究 | 第16页 |
| 3.2 piRNA调控家蚕基因研究 | 第16-17页 |
| 3.3 siRNA调控家蚕基因研究 | 第17页 |
| 3.4 可变剪切调控家蚕基因研究 | 第17页 |
| 4 展望 | 第17-19页 |
| 第二章 研究内容和技术路线 | 第19-21页 |
| 1 研究内容 | 第19-20页 |
| 2 技术路线 | 第20-21页 |
| 第三章 家蚕环形RNA高通量测序与分析 | 第21-33页 |
| 1 材料、试剂与仪器 | 第21页 |
| 1.1 主要材料与试剂 | 第21页 |
| 1.2 主要仪器 | 第21页 |
| 2 方法 | 第21-28页 |
| 2.1 总RNA提取 | 第21-22页 |
| 2.2 测序文库构建 | 第22-23页 |
| 2.3 测序数据评估 | 第23页 |
| 2.4 环形RNA预测和筛选 | 第23-24页 |
| 2.5 环形RNA靶miRNA预测 | 第24页 |
| 2.6 引物设计 | 第24-28页 |
| 3 结果 | 第28-32页 |
| 3.1 碱基质量分布统计 | 第28页 |
| 3.2 碱基含量分布统计 | 第28-29页 |
| 3.3 数据过滤及统计 | 第29-30页 |
| 3.4 环形RNA预测结果 | 第30-32页 |
| 3.5 环形RNA靶miRNA预测结果 | 第32页 |
| 4 讨论 | 第32-33页 |
| 第四章 家蚕环形RNA的鉴定与分析 | 第33-42页 |
| 1 材料、试剂及仪器 | 第33页 |
| 1.1 主要试剂盒材料 | 第33页 |
| 1.2 主要仪器 | 第33页 |
| 1.3 试剂配置 | 第33页 |
| 2 方法 | 第33-36页 |
| 2.1 总RNA提取 | 第33页 |
| 2.2 PCR扩增 | 第33-35页 |
| 2.3 琼脂糖凝胶电泳鉴定 | 第35-36页 |
| 3 结果 | 第36-41页 |
| 3.1 17个环形RNA的PCR扩增结果 | 第36-39页 |
| 3.2 11个环形RNA的PCR扩增结果 | 第39-41页 |
| 4 讨论 | 第41-42页 |
| 第五章 家蚕环形RNA的生物信息学预测与鉴定分析 | 第42-59页 |
| 1 材料、试剂及仪器 | 第42-43页 |
| 1.1 主要试剂盒材料 | 第42页 |
| 1.2 主要仪器 | 第42页 |
| 1.3 试剂配置 | 第42-43页 |
| 2 方法 | 第43-50页 |
| 2.1 家蚕环形RNA的生物信息学预测原理 | 第43页 |
| 2.2 家蚕环形RNA预测软件CircRNApredictor.pl的编写 | 第43-44页 |
| 2.3 生物信息学预测流程 | 第44-45页 |
| 2.4 预测环形RNA的匹配分析 | 第45页 |
| 2.5 基因组多拷贝环形RNA BmCirc2091935的序列分析 | 第45页 |
| 2.6 BmCirc2091935的正反向PCR鉴定 | 第45-47页 |
| 2.7 BmCirc2091935的Northern Blot鉴定 | 第47-50页 |
| 3 结果 | 第50-57页 |
| 3.1 家蚕环形RNA的预测结果与分析 | 第50-52页 |
| 3.2 BmCirc2091935生物信息学分析 | 第52-53页 |
| 3.3 BmCirc2091935基因组多拷贝分析 | 第53-55页 |
| 3.4 BmCirc2091935正反向PCR鉴定 | 第55页 |
| 3.5 BmCirc2091935基因组PCR鉴定 | 第55-57页 |
| 3.6 BmCirc2091935的Northern Blot鉴定 | 第57页 |
| 4 讨论 | 第57-59页 |
| 结论 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 附件 | 第66-79页 |
