| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 上篇 文献综述 | 第10-22页 |
| 1. 马铃薯Y病毒属研究进展 | 第10-16页 |
| ·Potyviruses及其引起的病害 | 第10-11页 |
| ·Potyviruses生物学特征 | 第11-12页 |
| ·Potyviruses基因组结构特征 | 第12-13页 |
| ·检测及鉴定技术 | 第13-15页 |
| ·ELISA检测技术 | 第13-14页 |
| ·PCR检测技术 | 第14-15页 |
| ·Potyvirus定种标准 | 第15-16页 |
| 2. RNA病毒全基因组获取技术 | 第16-20页 |
| ·基因组测序手段 | 第16-18页 |
| ·一步法全基因组测序 | 第16-17页 |
| ·分段测序 | 第17页 |
| ·基于NGS的全基因组组装 | 第17-18页 |
| ·RACE技术 | 第18-20页 |
| ·3'RACE技术 | 第18页 |
| ·RLM-RACE | 第18页 |
| ·Template-switching RACE | 第18-19页 |
| ·环形RACE | 第19-20页 |
| 3. 本研究的目的及意义 | 第20-21页 |
| 4. 技术路线 | 第21-22页 |
| 下篇 研究内容 | 第22-65页 |
| 1. 材料 | 第22-24页 |
| ·植物材料 | 第22-23页 |
| ·主要仪器 | 第23页 |
| ·主要试剂 | 第23页 |
| ·数据分析软件 | 第23-24页 |
| 2. 方法 | 第24-36页 |
| ·Potyvirus通用RT-PCR检测方法的建立及运用 | 第24-31页 |
| ·引物设计 | 第24页 |
| ·RT-PCR检测方法初步建立 | 第24-26页 |
| ·PCR检测方法优化 | 第26-28页 |
| ·检测方法评估 | 第28页 |
| ·疑似样品检测 | 第28-29页 |
| ·目的片段克隆及鉴定 | 第29-31页 |
| ·ChiRSV重组鉴定 | 第31页 |
| ·三种Potyvirus全基因组克隆及分析 | 第31-36页 |
| ·保守序列克隆 | 第32-33页 |
| ·3’RACE | 第33页 |
| ·5’RACE | 第33-34页 |
| ·Gap序列克隆 | 第34-35页 |
| ·生物信息学分析 | 第35-36页 |
| 3. 结果与分析 | 第36-62页 |
| ·Potyvirus通用PCR检测方法的建立及运用 | 第36-41页 |
| ·Potyvirus保守序列 | 第36页 |
| ·初步建立RT-PCR检测方法 | 第36-37页 |
| ·检测方法优化结果 | 第37-39页 |
| ·检测方法评估结果 | 第39-40页 |
| ·疑似样品检测 | 第40-41页 |
| ·病毒鉴定结果 | 第41-62页 |
| ·水茄花叶病毒(WTMV)澄迈分离物的鉴定 | 第41-43页 |
| ·烟草脉带花叶病毒(TVbMV)贵州分离物的鉴定 | 第43-44页 |
| ·曼陀罗上发现辣椒环斑病毒(ChiRSV)重组产生的新株系 | 第44-47页 |
| ·曼陀罗上发现辣椒脉斑驳病毒(ChiVMV)新株系 | 第47-52页 |
| ·茉莉T病毒(JaVT)鉴定及其部分基因组序列 | 第52-57页 |
| ·长春花上一种新病毒(CaVMV)的发现及其部分基因组序列 | 第57-62页 |
| 4. 讨论 | 第62-65页 |
| ·热区植物病毒多态性 | 第62页 |
| ·Potyvirus检测方法的应用及改进 | 第62-63页 |
| ·Potyvirus复合侵染及其鉴定 | 第63-65页 |
| 结论 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-73页 |
| 缩略词 | 第73-75页 |
| 附录 | 第75-77页 |
| 致谢 | 第77页 |
