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猪O3FAR1基因启动子的克隆及转录调控分析

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-13页
中英文缩写对照表第13-14页
第一章 文献综述第14-25页
 1 前言第14页
 2 真核生物启动子研究概述第14-19页
   ·真核启动子的结构第14-15页
   ·转录因子与启动子第15-17页
   ·启动子的研究热点第17-19页
 3 游离脂肪酸的研究进展第19-22页
   ·游离脂肪酸第19-21页
   ·游离脂肪酸受体第21-22页
 4 O3FAR1基因的研究概述第22-24页
 5 本试验研究的目的与意义第24-25页
第二章 材料与方法第25-53页
 1 试验材料与试剂第25-29页
   ·主要的生化试剂和药品第25页
   ·细胞、菌株和载体及猪基因组DNA第25-26页
   ·试剂盒第26页
   ·主要的仪器及设备第26-27页
   ·缓冲液和常用试剂的配制第27-28页
   ·主要的生物学软件和网站第28页
   ·所用载体第28-29页
 2 试验方法与步骤第29-53页
   ·猪不同组织总RNA的提取及cDNA的合成第29页
   ·猪O3FAR1基因组织表达谱分析第29-30页
   ·猪O3FAR1基因5'端上游调控区域的克隆和分析第30-34页
     ·克隆基因5'端上游调控区域第31-34页
     ·猪O3FAR1基因5'端上游调控区域的生物信息学分析第34页
   ·猪O3FAR1基因5'端上游调控区域的缺失分析第34-39页
     ·基因5端上游调控区域缺失载体的构建第34-37页
     ·启动子在三种不同真核细胞中的活性分析第37-39页
   ·猪O3FAR1基因核心启动子区的寻找及转录因子分析第39页
   ·定点突变的验证试验第39-40页
     ·构建野生型和突变型的荧光报告载体质粒第39-40页
     ·野生型和突变型的荧光报告载体质粒的瞬时转染第40页
     ·构建转录因子C/EBPβ第40页
     ·野生型荧光报告载体质粒与转录因子的共转染第40页
   ·转录因子的超表达与RNA干扰第40-45页
     ·超表达与RNA干扰定量引物的设计第40-41页
     ·转录因子的超表达第41-44页
     ·转录因子的RNA干扰试验第44-45页
   ·EMSA验证试验第45-50页
     ·EMSA探针的设计第45页
     ·核蛋白的抽提第45-47页
     ·结合反应第47-48页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳第48页
     ·电转移第48-49页
     ·交联固定与化学发光反应第49-50页
     ·化学发光图像显示第50页
   ·猪O3FAR1基因的超表达试验第50-53页
     ·猪O3FAR1基因CDS区的获取第50-51页
     ·pcDNA3.1-CDS真核表达载体的构建第51页
     ·pcDNA3.1-CDS真核表达载体的瞬时转染实验第51-52页
     ·细胞RNA的提取与cDNA第一链的合成第52页
     ·荧光定量PCR检测第52-53页
第三章 结果分析第53-68页
 1 猪O3FAR1基因启动子克隆与功能分析第53-65页
   ·猪O3FAR1基因的组织表达谱分析第53页
   ·猪O3FAR1基因启动子上游调控区域的克隆及分析第53-56页
     ·猪O3FAR1基因5'上游调控序列的获取第53-54页
     ·猪O3FAR1基因启动子的生物信息学分析第54-56页
     ·猪O3FAR1基因5'上游调控序列的克隆第56页
   ·猪O3FAR1启动子缺失载体的构建第56-58页
     ·扩增缺失片段第56-57页
     ·构建双荧光素酶报告基因载体第57-58页
   ·猪O3FAR1启动子活性的检测第58-60页
   ·点突变试验验证第60-62页
   ·转录因子的超表达试验第62-63页
   ·转录因子的RNA干扰试验第63-64页
   ·EMSA试验验证结果第64-65页
 2 猪O3FAR1基因的超表达试验第65-68页
   ·不同物种O3FAR1基因的生物信息学比对第65页
   ·猪O3FAR1基因超表达载体的构建第65-66页
   ·超表达载体转染细胞后RNA的获取第66页
   ·荧光定量PCR检测猪O3FAR1基因超表达结果第66-68页
第四章 讨论第68-75页
 1 猪O3FAR1基因的生物信息学与表达谱分析第68-69页
   ·猪O3FAR1基因的生物信息学分析第68-69页
   ·猪O3FAR1基因的表达谱分析第69页
 2 启动子的活性分析第69-70页
 3 转录因子CEBPβ与猪O3FAR1基因关系的讨论第70-72页
   ·超表达结果第70-71页
   ·RNA干扰结果第71页
   ·转录因子CEBPβ与脂肪组织发育的关系第71-72页
 4 本试验中一些试验技术的讨论第72-75页
   ·关于siRNA干扰技术第72-73页
   ·关于EMSA试验技术第73-75页
第五章 小结第75-76页
 1 本研究的主要成果第75页
 2 本研究的不足之处及下一步计划第75-76页
参考文献第76-82页
致谢第82-83页
附录第83-85页

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