| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 1 绪论 | 第10-42页 |
| ·引言 | 第10-13页 |
| ·配体-受体相互作用原理 | 第13-23页 |
| ·受体-配体结合的关键点 | 第13-14页 |
| ·结合过程理论模型 | 第14-17页 |
| ·配体-受体相互作用的物理学性质 | 第17-23页 |
| ·蛋白质结合位点预测研究现状 | 第23-39页 |
| ·蛋白质-蛋白质和蛋白质-配体结合位点的比较 | 第23-25页 |
| ·蛋白质-配体结合位点预测 | 第25-35页 |
| ·蛋白质-蛋白质结合位点预测 | 第35-39页 |
| ·本文的主要工作 | 第39-41页 |
| ·基于氨基酸组成偏好的配体结合口袋识别方法 | 第40页 |
| ·使用随机森林方法进行蛋白质结合位点的预测 | 第40-41页 |
| ·蛋白质结合位点预测辅助分子对接 | 第41页 |
| ·本章小结 | 第41-42页 |
| 2 基于氨基酸组成偏好的配体结合口袋识别方法 | 第42-62页 |
| ·引言 | 第42-43页 |
| ·基于全局口袋氨基酸组成偏好的配体结合口袋识别方法 | 第43-54页 |
| ·材料与方法 | 第43-49页 |
| ·结果与讨论 | 第49-54页 |
| ·基于局部口袋氨基酸组成偏好的配体结合口袋识别方法 | 第54-60页 |
| ·材料与方法 | 第55-56页 |
| ·结果与讨论 | 第56-60页 |
| ·本章小结 | 第60-62页 |
| 3 使用随机森林方法进行蛋白质结合位点的预测 | 第62-85页 |
| ·引言 | 第62-64页 |
| ·基于单块残基属性定义模型的蛋白质-配体结合位点预测 | 第64-72页 |
| ·材料与方法 | 第64-69页 |
| ·结果与讨论 | 第69-72页 |
| ·基于多块残基属性定义模型的蛋白质-蛋白质结合位点预测 | 第72-83页 |
| ·材料与方法 | 第72-76页 |
| ·结果与讨论 | 第76-83页 |
| ·本章小结 | 第83-85页 |
| 4 蛋白质结合位点预测辅助分子对接 | 第85-105页 |
| ·引言 | 第85-86页 |
| ·分子对接方法分类 | 第85-86页 |
| ·目前面临的主要问题 | 第86页 |
| ·结合位点预测信息前端使用辅助蛋白质-配体对接 | 第86-90页 |
| ·材料与方法 | 第86-89页 |
| ·结果与讨论 | 第89-90页 |
| ·结合位点预测信息后端使用辅助蛋白质-蛋白质对接 | 第90-104页 |
| ·材料与方法 | 第92-97页 |
| ·结果与讨论 | 第97-104页 |
| ·本章小结 | 第104-105页 |
| 结论 | 第105-107页 |
| 参考文献 | 第107-115页 |
| 攻读博士学位期间发表学术论文情况 | 第115-116页 |
| 创新点摘要 | 第116-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |
| 作者简介 | 第118-119页 |
