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基于DNA条形码技术对山茶属植物物种鉴别的探讨

致谢第4-8页
缩略词表Abbreviation第8-9页
摘要第9-10页
1 文献综述第10-20页
    1.1 植物分子鉴定理论及研究进展第10-13页
        1.1.1 第1代分子标记第10-11页
            1.1.1.1 RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphisms)标记技术第10页
            1.1.1.2 RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)标记技术第10-11页
            1.1.1.3 AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphisms)标记技术第11页
        1.1.2 第2代分子标记第11-12页
            1.1.2.1 SSR(Simple Sequence Repeats)标记技术第11页
            1.1.2.2 ISSR(Inter-simple sequence repeats)标记技术第11-12页
        1.1.3 第3代分子标记第12页
            1.1.3.1 SNP(Single Nucleotide Polymorphism)标记技术第12页
            1.1.3.2 EST(Expressed sequence Tag)表达序列标签第12页
        1.1.4 分子标记在山茶属研究中的应用第12-13页
    1.2 DNA条形码技术的发展概况第13-17页
        1.2.1 植物DNA条形码候选片段及组合第14-15页
        1.2.2 植物DNA条形码研究现状第15-16页
            1.2.2.1 matK第15-16页
            1.2.2.2 rbcL第16页
            1.2.2.3 trnH-psbA第16页
        1.2.3 植物DNA条形码技术研究展望第16-17页
    1.3 山茶属分类研究概况第17-20页
2 山茶属植物DNA条形码初步筛选第20-37页
    2.1 引言第20-21页
    2.2 山茶属植物总DNA提取第21-27页
        2.2.1 试验样品第21-24页
        2.2.2 试验仪器第24-25页
        2.2.3 试验试剂第25页
        2.2.4 溶液的配置第25-26页
        2.2.5 植物DNA提取第26-27页
    2.3 目的片段PCR扩增第27-29页
        2.3.1 引物序列第27页
        2.3.2 PCR扩增体系第27-29页
        2.3.3 琼脂糖凝胶电泳及测序第29页
            2.3.3.1 琼脂糖凝胶的制备第29页
            2.3.3.2 电泳检测及测序第29页
    2.4 结果与分析第29-35页
        2.4.1 山茶属植物DNA提取结果分析第29-30页
        2.4.2 目的片段PCR扩增结果第30-32页
        2.4.3 序列特征分析第32-35页
            2.4.3.1 rbcL序列特征分析第33页
            2.4.3.2 matK序列特征分析第33-34页
            2.4.3.3 trnH-psbA序列特征分析第34-35页
    2.5 小结与讨论第35-37页
3 山茶属植物DNA条形码鉴定研究第37-49页
    3.1 材料第37页
        3.1.1 试验材料第37页
        3.1.2 试剂与仪器第37页
    3.2 方法第37-38页
        3.2.1 基因组DNA提取方法第37页
        3.2.2 PCR扩增与测序第37-38页
        3.2.3 数据处理方法第38页
            3.2.3.1 序列数据分析第38页
            3.2.3.2 相似性搜索(BLAST)鉴定第38页
            3.2.3.3 建树方法第38页
    3.3 结果与分析第38-48页
        3.3.1 rbcL序列第38-42页
            3.3.1.1 遗传距离分析第38-40页
            3.3.1.2 系统发育树的构建第40-42页
        3.3.2 matK序列第42-45页
            3.3.2.1 遗传距离分析第42-43页
            3.3.2.2 系统发育树的构建第43-45页
        3.3.3 trnH-psb A序列第45-48页
            3.3.3.1 遗传距离分析第45-46页
            3.3.3.2 系统发育树的构建第46-48页
    3.4 小结与讨论第48-49页
4 山茶属DNA条形码组合片段分析第49-59页
    4.1 组合片段序列特征第49页
    4.2 序列遗传距离分析第49-52页
    4.3 组合片段系统发育树的构建第52-58页
        4.3.1 matK + rbcL组合序列第52-54页
        4.3.2 matK + trnH-psbA组合序列第54页
        4.3.3 rbcL + trnH-psbA组合序列第54页
        4.3.4 matK + rbcL + trnH-psbA组合序列第54-58页
    4.4 小结与讨论第58-59页
5 讨论与结论第59-62页
    5.1 PCR扩增和测序第59页
    5.2 物种鉴别效率第59-60页
    5.3 DNA条形码在山茶属中的分类学意义第60-62页
附表第62-63页
附图第63-66页
参考文献第66-72页
ABSTRACT第72-73页

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