基于代谢网络的系统发生树的构建
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-11页 |
| ·研究背景 | 第7-8页 |
| ·构建系统发生树的研究历史和现状 | 第8-9页 |
| ·本文的主要研究内容和论文结构 | 第9-11页 |
| 第二章 系统发生树的简介 | 第11-13页 |
| ·系统发生树的定义和分类 | 第11-12页 |
| ·系统发生树的性质 | 第12-13页 |
| 第三章 构建系统发生树的方法 | 第13-26页 |
| ·问题描述和分子数据 | 第13页 |
| ·基于距离的系统发生树构建算法 | 第13-20页 |
| ·最小二乘法 | 第14-15页 |
| ·连锁聚类方法及非加权分组平均法 | 第15-18页 |
| ·距离变换法 | 第18页 |
| ·邻近归并法 | 第18-20页 |
| ·基于特征的系统发生树构建算法 | 第20-24页 |
| ·最大简约法 | 第20-23页 |
| ·最大似然法 | 第23-24页 |
| ·系统发生树的可靠性 | 第24-26页 |
| ·自举检验 | 第24页 |
| ·参数检验 | 第24-26页 |
| 第四章 基于代谢网络的系统发生树的构建 | 第26-40页 |
| ·基本概念及问题描述 | 第26-27页 |
| ·从代谢网络中提取酶图 | 第27-29页 |
| ·顶点相似性计算 | 第29-35页 |
| ·任意两个顶点间相似性 | 第29-32页 |
| ·二分图匹配 | 第32-34页 |
| ·匹配顶点间相似性 | 第34-35页 |
| ·图相似性计算 | 第35页 |
| ·改进的图相似性计算 | 第35-36页 |
| ·基于距离矩阵构建系统发生树 | 第36页 |
| ·结果分析与比较 | 第36-40页 |
| 第五章 总结与期望 | 第40-41页 |
| 致谢 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-46页 |
| 攻读硕士期间发表的文章 | 第46-47页 |
