| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-24页 |
| ·基因及其表达调控 | 第10-12页 |
| ·基因表达 | 第10-11页 |
| ·基因表达调控 | 第11-12页 |
| ·真核基因转录调控的研究进展 | 第12-15页 |
| ·转录水平调控的特点 | 第12-13页 |
| ·顺式作用元件 | 第13-14页 |
| ·反式作用因子 | 第14-15页 |
| ·转录因子结合位点预测的研究现状 | 第15-21页 |
| ·转录因子结合位点的研究意义 | 第15-16页 |
| ·转录因子结合位点理论预测方法 | 第16-20页 |
| ·酵母基因转录调控网络的研究现状 | 第20-21页 |
| ·本研究所用数据库及网站介绍 | 第21-23页 |
| ·酵母基因组数据库SGD | 第21-22页 |
| ·基因本体论GO | 第22页 |
| ·真核转录因子数据库TRANSFAC | 第22页 |
| ·蛋白质结构分类数据库SCOP | 第22-23页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第23-24页 |
| 第二章 酵母基因上游转录因子结合位点分布的统计分析 | 第24-33页 |
| ·材料与方法 | 第24-26页 |
| ·数据来源 | 第24页 |
| ·转录因子的聚类 | 第24-26页 |
| ·转录因子结合位点统计与分析 | 第26页 |
| ·结果与分析 | 第26-30页 |
| ·转录因子结合位点的分布 | 第26-28页 |
| ·转录因子结构与结合位点的关系 | 第28-30页 |
| ·讨论 | 第30-33页 |
| ·结合位点分布规律 | 第30-31页 |
| ·因子结构的选择 | 第31页 |
| ·不同结构因子结合位点分布的差异 | 第31-33页 |
| 第三章 转录因子结合位点在不同功能基因间分布的统计分析 | 第33-41页 |
| ·材料与方法 | 第33页 |
| ·数据提取 | 第33页 |
| ·基因功能聚类 | 第33页 |
| ·基因提取程序及数据统计分析 | 第33页 |
| ·结果与分析 | 第33-39页 |
| ·聚类结果 | 第33-35页 |
| ·结合位点的分布 | 第35-36页 |
| ·因子基因聚类结果差异比较分析 | 第36-39页 |
| ·讨论 | 第39-41页 |
| 第四章 结合位点保守性分析 | 第41-52页 |
| ·数据提取 | 第41-42页 |
| ·转录因子的选取 | 第41页 |
| ·结合序列及距离的提取 | 第41-42页 |
| ·算法过程 | 第42-46页 |
| ·一致性序列选取 | 第42页 |
| ·研究参量介绍 | 第42-45页 |
| ·分析参量随位置变化规律 | 第45-46页 |
| ·结果与分析 | 第46-50页 |
| ·不同区域位置权重矩阵打分结果变化 | 第46-47页 |
| ·不同区域保守性变化 | 第47-49页 |
| ·不同区域综合打分结果分析 | 第49-50页 |
| ·讨论 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 作者简介 | 第63页 |