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基因组中插入与缺失的分布规律

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-10页
第一章 文献综述第10-22页
   ·突变第10-12页
     ·突变的定义第10页
     ·突变的分类第10-11页
     ·突变在进化中的作用第11页
     ·插入与缺失突变第11-12页
   ·序列比对第12-18页
     ·序列比对的进化基础第12页
     ·序列比对的分类第12-13页
     ·打分矩阵与空位罚分第13-14页
     ·序列比对的相关算法第14-16页
     ·序列比对的主要用途第16-18页
   ·简约法第18页
   ·插入与缺失的研究第18-20页
     ·缺失比插入多第18-19页
     ·单个碱基的插入与缺失最多第19页
     ·插入与缺失的理论分布和罚分公式第19-20页
     ·插入与缺失的碱基组成第20页
     ·插入与缺失在进化中的作用第20页
   ·替换的研究第20-21页
   ·研究的目的和意义第21-22页
第二章 材料和方法第22-28页
   ·材料第22-24页
     ·大鼠与小鼠同源内含子序列的获取第22-23页
     ·哺乳动物基因组的多重序列比对的获取第23-24页
   ·方法第24-28页
     ·人类、大鼠和小鼠同源内含子的多重序列比对第24页
     ·哺乳动物基因组的多重序列比对的获得第24页
     ·插入与缺失的确定第24-25页
     ·插入与缺失发生概率的计算第25页
     ·替换概率的计算第25-26页
     ·插入与缺失中重复片段的确定第26页
     ·参数估计与相关性分析第26页
     ·插入与缺失期望值的计算第26页
     ·三核苷酸插入与缺失包含的二核苷酸的Odds Ratio 的计算第26-27页
     ·图形的绘制与编辑第27-28页
第三章 结果与讨论第28-43页
   ·结果第28-40页
     ·大鼠与小鼠内含子中插入与缺失的模式第28-33页
     ·大鼠与小鼠内含子中替换的模式第33-34页
     ·哺乳动物基因组中插入与缺失的分布规律第34-40页
   ·讨论第40-43页
     ·大鼠与小鼠内含子中插入与缺失的分布规律第40页
     ·大鼠与小鼠内含子中替换的分布规律第40-41页
     ·大鼠与小鼠内含子中插入与缺失的碱基组成第41页
     ·哺乳动物基因组中插入与缺失的分布规律第41-43页
第四章 结论第43-44页
参考文献第44-50页
附录第50-67页
致谢第67-68页
作者简介第68页

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