| 中文摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 引言 | 第7-12页 |
| ·选题背景和意义 | 第7-9页 |
| ·生物学背景知识 | 第7-8页 |
| ·转录因子结合位点识别的研究意义 | 第8-9页 |
| ·转录因子结合位点识别的研究现状 | 第9-10页 |
| ·转录因子结合位点的概念 | 第9页 |
| ·转录因子结合位点识别的研究问题 | 第9页 |
| ·转录因子结合位点识别的研究方法 | 第9-10页 |
| ·本文研究内容和方法 | 第10-12页 |
| ·研究内容 | 第11页 |
| ·研究方法 | 第11-12页 |
| 第二章 遗传算法与位置特异性得分矩阵基本原理 | 第12-24页 |
| ·遗传算法原理 | 第12-16页 |
| ·遗传算法简介 | 第12页 |
| ·遗传算法的基本思想 | 第12-13页 |
| ·遗传算法的流程 | 第13-14页 |
| ·应用遗传算法进行转录因子结合位点识别 | 第14-16页 |
| ·位置特异性得分矩阵原理 | 第16-24页 |
| ·转录因子结合位点的建模方法 | 第16-18页 |
| ·位置特异性得分矩阵模型 | 第18-20页 |
| ·应用位置特异性得分矩阵进行转录因子结合位点识别 | 第20-24页 |
| 第三章 基于遗传算法和位置特异性得分矩阵的动态转录因子结合位点识别方法 | 第24-31页 |
| ·算法基本思想 | 第24-25页 |
| ·算法流程 | 第25-26页 |
| ·算法分析与设计 | 第26-31页 |
| ·用基本遗传算法进行转录因子结合位点识别 | 第26-29页 |
| ·建立位置特异性得分矩阵模型 | 第29-30页 |
| ·用PSSM 模型动态识别剩余序列的motif | 第30-31页 |
| 第四章 实验结果与算法评价 | 第31-40页 |
| ·实验数据 | 第31页 |
| ·控制参数 | 第31-32页 |
| ·实验结果 | 第32-37页 |
| ·与其他算法比较 | 第37-40页 |
| 第五章 结束语 | 第40-42页 |
| ·总结 | 第40-41页 |
| ·展望 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-45页 |
| 致谢 | 第45页 |