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LepA调节蛋白翻译的机理研究

摘要第1-7页
Abstract第7-12页
第一章 绪论第12-41页
   ·核糖体参与的蛋白质合成过程第12-23页
     ·核糖体结构第12-18页
     ·蛋白质合成过程第18-23页
       ·起始 (Initiation)第18-19页
       ·延伸 (Elongation)第19-22页
       ·终止 (Termination)第22-23页
   ·参与翻译过程的GTP酶第23-33页
     ·起始因子IF212第23-25页
     ·延伸因子EF-Tu第25-27页
     ·延伸因子EF-G第27-29页
     ·延伸因子LepA/EF418第29-31页
     ·解离因子RF320第31-33页
   ·核糖体蛋白翻译因子结合区域第33-36页
     ·翻译因子结合区域的结构组成第33-36页
     ·翻译因子结合区域的柔性第36页
   ·L11蛋白参与的翻译调控第36-40页
     ·L11-NTD在核糖体上的运动第36-38页
     ·分子开关L1127第38-40页
   ·本课题的研究内容和意义第40-41页
第二章 材料与方法第41-66页
   ·材料第41页
   ·基因克隆第41-52页
     ·目的基因的PCR扩增第41-44页
     ·表达质粒的构建第44-45页
     ·构建点突变载体第45-46页
     ·蛋白的表达纯化第46-51页
       ·LepA蛋白的表达纯化第46-48页
       ·L11蛋白的表达纯化第48-50页
       ·其他翻译因子的表达纯化第50-51页
     ·蛋白性质分析第51-52页
   ·RNA相关的实验操作第52-57页
     ·体外T7聚合酶体系制备mRNA第52-54页
       ·T7聚合酶转录体系第52页
       ·反应体系中DNA模板的去除第52页
       ·柱纯化去除核苷酸第52-53页
       ·RNA样品的定量第53页
       ·PAGE检测纯化后的RNA样品第53-54页
     ·tRNA操作第54-57页
       ·小量分析tRNA氨基酸接受臂的活性效率第54页
       ·分析氨酰-tRNA去氨酰反应条件第54页
       ·大量制备氨酰-tRNA和乙酰化修饰第54-55页
       ·去氨酰化去除N-acetyl-aminoacyl-tRNA中的氨酰tRNA成份第55-56页
       ·反相HPLC纯化氨酰-tRNA和去氨酰tRNA第56-57页
   ·核糖体的大量制备第57-61页
     ·大规模菌的制备第57页
     ·70S核糖体的分离第57-59页
       ·制备粗70S核糖体第58页
       ·核糖体的解聚制备30S和50S第58-59页
       ·重新聚合得到纯化后的70S第59页
     ·PRE,POST态核糖体复合物的制备第59页
     ·缺失L11蛋白核糖体的制备第59-60页
     ·缺失L11蛋白核糖体的重构第60-61页
       ·缺失L11的核糖体的重构过程第60页
       ·重构后核糖体L11的western blot检测第60-61页
   ·核糖体活性检测实验方法第61-62页
     ·GTPase酶活检测第61-62页
     ·以Poly U为模板合成Poly Phe第62页
   ·蛋白-蛋白相互作用检测第62-64页
     ·非特异的化学交联第62-63页
     ·NMR第63-64页
   ·蛋白折叠动力学相关第64-65页
     ·GFP的折叠动力学第64页
     ·BCAII的复性动力学第64-65页
   ·PPIase四肽水解反应第65-66页
第三章 结果与讨论第66-89页
   ·LepA新的脯氨酰异构酶活性的确定第66-73页
     ·LepA可以帮助绿色荧光蛋白折叠第66-70页
     ·LepA可以帮助碳酸酐酶复性第70-72页
     ·脯氨酰异构酶四肽检测体系第72-73页
   ·LepA蛋白上脯氨酰键异构酶活性中心的确定第73-75页
   ·LepA蛋白在核糖体上的天然底物第75-84页
     ·crosslingking实验第75-79页
     ·NMR证实L11蛋白和LepA蛋白之间的相互作用第79-84页
   ·L11蛋白的脯氨酰键的异构第84-87页
   ·Pro21-22位点的顺反异构对蛋白合成的影响第87-89页
第四章 讨论与展望第89-92页
   ·PPIase活性是LepA独有的,还是普遍存在的第89-91页
   ·GTP酶的PPIase活性参与的调控过程第91-92页
参考文献第92-106页
致谢第106-108页
在读期间发表的学术论文与其他研究成果第108-109页

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