| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 英文缩略词表(Abbreviation) | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-19页 |
| 1 骨骼肌的肌纤维类型、结构及特征 | 第10-11页 |
| 2 肌原纤维蛋白的分类 | 第11-15页 |
| ·肌球蛋白的分类 | 第11-13页 |
| ·肌原纤维中其它蛋白的分类 | 第13-15页 |
| 3 快肌和慢肌的不同分布和相互转化 | 第15-16页 |
| 4 肌纤维类型与肉质 | 第16-19页 |
| 第二章 本研究的目的和意义 | 第19-20页 |
| 第三章 材料和方法 | 第20-27页 |
| 1 试验材料 | 第20-22页 |
| ·试验样品 | 第20页 |
| ·主要仪器和设备 | 第20页 |
| ·主要药品和试剂 | 第20-21页 |
| ·缓冲液和常用试剂的配制 | 第21页 |
| ·六张Affymetrix AFF-900623猪基因组芯片 | 第21页 |
| ·主要软件和数据库 | 第21-22页 |
| 2 试验方法 | 第22-27页 |
| ·比目鱼肌和背最长肌组织的芯片杂交实验与数据分析 | 第22页 |
| ·猪肌肉组织总RNA的提取、检测及cDNA第一链的合成 | 第22-23页 |
| ·猪肌肉组织总RNA的提取 | 第22-23页 |
| ·总RNA浓度的测定和质量检测 | 第23页 |
| ·cDNA第一链的合成 | 第23页 |
| ·应用Q RT-PCR验证比目鱼肌和背最长肌中mRNA的差异表达 | 第23-27页 |
| ·Q RT-PCR引物设计 | 第23-25页 |
| ·Q RT-PCR反应体系和扩增条件 | 第25-26页 |
| ·Q RT-PCR检测和验证和差异表达基因 | 第26页 |
| ·基因差异表达分析 | 第26页 |
| ·Q RT-PCR结果和基因芯片结果的相关系数和显著性分析 | 第26-27页 |
| 第四章 结果与分析 | 第27-42页 |
| 1 差异表达基因结果 | 第27页 |
| 2 背最长肌和比目鱼肌MHC亚型的表达分析 | 第27-28页 |
| 3 Q RT-PCR和基因芯片两种结果的相关性分析 | 第28-33页 |
| 4 差异表达基因生物信息学分析 | 第33-42页 |
| ·基因通路分析 | 第33-36页 |
| ·部分差异基因的转录因子分析 | 第36-38页 |
| ·已筛选的基因通路中的基因进行相互关系分析 | 第38页 |
| ·差异表达基因Gene ontology(GO)分析 | 第38-42页 |
| 第五章 讨论 | 第42-51页 |
| 1 利用基因芯片检测差异表达基因的优势 | 第42页 |
| 2 比目鱼肌和背最长肌肌纤维类型的差异 | 第42-43页 |
| 3 不同类型差异基因的生物学功能分析 | 第43-50页 |
| ·代谢酶类基因 | 第43-44页 |
| ·收缩结构蛋白和细胞骨架蛋白基因 | 第44页 |
| ·转录因子GATA-6基因 | 第44-46页 |
| ·肌细胞增强因子2C和LIM蛋白基因 | 第46-47页 |
| ·热激动蛋白基因 | 第47-48页 |
| ·转化生长因子β1和β3基因 | 第48-49页 |
| ·同源异型框蛋白A10基因 | 第49-50页 |
| 4 下一步工作 | 第50-51页 |
| 小结 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 附图 | 第62-65页 |
