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猪脂肪诱导转录基因FIT的分子生物学基础研究

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-12页
第一章 文献综述第12-21页
 1 前言第12页
 2 猪基因组计划研究进展第12-13页
 3 参与脂肪代谢的重要基因第13-17页
 4 脂滴第17-19页
   ·胞内脂滴的结构第18页
   ·参与脂滴代谢的调控网络第18-19页
 5 猪FIT基因的研究进展第19-21页
第二章 研究目的和意义第21-22页
第三章 材料与方法第22-34页
 1 引言第22页
 2 试验材料第22-25页
   ·试验样品和性状测定第22页
     ·DNA样品第22页
     ·组织样品第22页
     ·性状测定第22页
   ·主要仪器和设备第22-23页
   ·载体和菌株第23-24页
   ·缓冲液和常用试剂的配制第24页
   ·主要药品及试剂第24-25页
 3 试验方法第25-34页
   ·猪血液基因组DNA的提取第25页
   ·基因组DNA的浓度测定和质量检测第25页
   ·猪组织总RNA的提取及cDNA的制备第25-26页
     ·总RNA的提取第25-26页
     ·RNA的琼脂糖凝胶电泳检测第26页
     ·反转录反应第26页
   ·猪FIT基因基因组序列的克隆、测序及SNPs研究第26-31页
     ·引物设计第26页
     ·PCR反应第26-27页
     ·PCR产物的回收、纯化和克隆测序第27-28页
     ·DNA序列的生物信息学分析及相应的软件第28页
     ·猪FIT基因部分SNP位点的PCR-RFLP,PCR-SSCP检测第28-30页
     ·SNP的统计分析第30-31页
   ·猪FIT1基因转录水平组织表达谱分析第31页
     ·总RNA的提取及RNA质量的检测第31页
     ·RT-PCR扩增体系第31页
   ·融合表达载体的构建第31-33页
     ·目的片段的获得第31-32页
     ·目的片段与载体的连接第32页
     ·重组质粒的转化和鉴定第32页
     ·重组质粒的提取第32-33页
   ·细胞培养和瞬时转染第33-34页
     ·细胞培养与传代第33页
     ·细胞瞬时转染第33-34页
第四章 实验结果第34-55页
 1 总RNA的提取第34页
 2 猪FIT2基因第34-37页
   ·猪FIT2基因的基因组序列的克隆、测序及序列分析第34-35页
   ·猪FIT2基因编码区序列及其推导的氨基酸序列分析第35页
   ·猪FIT2基因的SNP分析第35-37页
     ·猪FIT2基因的SNP检测第35页
     ·不同猪种中T559C多态性分布的检测结果第35-36页
     ·猪FIT2基因的PCR-BcnⅠ-RFLP基因型与性状的关联分析第36-37页
   ·利用半定量RT-PCR对猪FIT2基因进行组织表达谱分析第37页
 3 猪FIT1基因第37-55页
   ·猪FIT1基因的基因组序列克隆、测序及序列分析第37页
   ·猪FIT1基因编码区序列及其推导的氨基酸的序列分析第37-38页
   ·猪FIT1基因的SNP分析第38-48页
     ·猪FIT1基因的SNP检测第38-40页
     ·猪FIT1基因生物信息学分析第40-44页
     ·第一外显子G72A位点分析第44-46页
     ·猪FIT1基因外显子2插入/缺失和C581A位点分析第46-48页
   ·单倍型分析第48-49页
   ·利用半定量RT-PCR对猪FIT1基因进行组织表达谱分析第49-50页
   ·猪FIT1蛋白进化树分析第50-52页
   ·猪FIT1基因启动子的生物信息学预测第52-53页
     ·启动子顺式元件的预测第52页
     ·转录因子结合位点的预测第52-53页
   ·猪FIT1基因融合蛋白的体外表达第53-55页
     ·真核表达载体的构建第53-54页
     ·融合蛋白的体外表达第54-55页
第五章 讨论第55-59页
 1 关于猪7号染色体第55-56页
 2 关于SNPs的检测第56-57页
 3 关于基因与部分经济性状的关联分析第57页
 4 关于单倍型分析第57-58页
 5 关于融合表达载体选择及引物设计第58-59页
第六章 小结第59-61页
 1 本研究获得的结果及创新点第59页
 2 本研究的不足之处第59-60页
 3 下一步研究计划第60-61页
参考文献第61-67页
致谢第67页

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