谷子与狗尾草基因组比较及落粒相关基因PT2的鉴定与分析
| 缩略词表 | 第6-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| 1 研究背景 | 第9-15页 |
| 1.1 谷子简介 | 第9页 |
| 1.2 比较基因组学 | 第9-12页 |
| 1.2.1 比较基因组学概述 | 第9-10页 |
| 1.2.2 基因组比对基础 | 第10页 |
| 1.2.3 比较基因组学常用的研究方法与工具 | 第10-11页 |
| 1.2.4 基因组变异分析 | 第11-12页 |
| 1.3 植物的落粒性及其调控 | 第12-15页 |
| 1.3.1 植物落粒性的解剖学机理 | 第12页 |
| 1.3.2 激素对植物落粒性的作用 | 第12-13页 |
| 1.3.3 拟南芥落粒机理 | 第13-14页 |
| 1.3.4 水稻落粒机理 | 第14-15页 |
| 1.4 本课题研究的目的和意义 | 第15页 |
| 2 材料与方法 | 第15-21页 |
| 2.1 材料 | 第15-17页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第15-17页 |
| 2.2 方法 | 第17-21页 |
| 2.2.1 基因组比对 | 第17页 |
| 2.2.2 重复序列注释 | 第17页 |
| 2.2.3 SNP和In Del的识别和注释 | 第17页 |
| 2.2.4 Unigene的SNP分析 | 第17页 |
| 2.2.5 PT2基因及其启动子的生物信息学分析 | 第17-18页 |
| 2.2.6 总RNA提取与PT2基因的检测 | 第18-20页 |
| 2.2.7 植物基因组DNA的提取 | 第20页 |
| 2.2.8 PT2基因外显子的扩增及序列分析 | 第20-21页 |
| 3 结果 | 第21-30页 |
| 3.1 比较基因组学分析 | 第21-24页 |
| 3.1.1 谷子和狗尾草基因组分析 | 第21-22页 |
| 3.1.2 谷子和狗尾草转录本变异结果统计 | 第22-23页 |
| 3.1.3 谷子和狗尾草氨基酸变异结果统计 | 第23-24页 |
| 3.2 PT2基因的分析与验证 | 第24-30页 |
| 3.2.1 谷子PT2候选基因的筛选与分析 | 第24-26页 |
| 3.2.2 谷子PT2基因启动子元件分析 | 第26-28页 |
| 3.2.3 谷子PT2家族基因表达部位分析 | 第28页 |
| 3.2.4 PT2基因保守性分析 | 第28-30页 |
| 4 讨论 | 第30-33页 |
| 5 结论 | 第33-35页 |
| 参考文献 | 第35-39页 |
| Abstract | 第39-40页 |
| 致谢 | 第41页 |
