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猪ATGL基因和FATP1基因5调控区的多态性及其与胴体和肉质性状的相关分析

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
缩略词表第10-15页
第一章 文献综述第15-35页
 1 动物脂肪代谢及其调控机理的研究进展第15-18页
   ·脂肪组织概述第15-16页
   ·脂肪的动员和分解调节第16-17页
   ·脂肪酸的转运及其调控第17-18页
 2 脂肪甘油三酯水解酶(ATGL)基因研究进展第18-23页
   ·ATGL的结构特征第19-20页
     ·ATGL的基因结构第19页
     ·ATGL的蛋白质结构第19-20页
   ·ATGL的组织表达变化第20页
   ·ATGL的生物学功能第20-21页
   ·ATGL的作用机制及其调控第21-22页
   ·小结和展望第22-23页
 3 脂肪酸转运蛋白1(FATP1)基因研究进展第23-26页
   ·FATP家族的成员和分布第23页
   ·FATP1的分子结构第23-24页
   ·FATP1的生物学功能第24-25页
   ·FATP1的作用机制及其表达调节第25-26页
 4 单核苷酸多态性第26-27页
 5 PCR-RFLP技术第27-28页
   ·PCR-RFLP标记分类第27页
   ·PCR-RFLP标记的特点第27页
   ·错配PCR-RFLP技术第27-28页
 6 四引物ARMS-PCR技术第28-30页
   ·四引物ARMS-PCR的技术原理第28-29页
   ·引物设计原则和方法第29-30页
   ·分型方法第30页
   ·应用前景第30页
 7 生物信息学及其在动物遗传育种中的应用第30-33页
   ·生物信息学的产生和发展第31页
   ·生物信息学的主要研究内容第31-32页
     ·序列比对第31-32页
     ·序列分析第32页
     ·蛋白质结构预测第32页
   ·前景与展望第32-33页
 8 本研究所涉及猪种的介绍第33-34页
   ·金华猪第33页
   ·岔路黑猪第33页
   ·皮特兰猪第33-34页
   ·杜洛克猪第34页
   ·大约克猪第34页
 9 本研究的目的和意义第34-35页
第二章 材料与方法第35-44页
 1 实验材料第35-37页
   ·实验动物第35页
   ·试验试剂第35-36页
     ·基因组DNA提取试剂第35页
     ·PCR试剂第35页
     ·酶切和电泳试剂第35-36页
   ·溶液的配制第36-37页
   ·琼脂糖凝胶的制备第37页
   ·仪器设备第37页
 2 试验方法第37-43页
   ·基因组DNA的提取与检测第37-38页
     ·基因组DNA的抽提第37-38页
     ·基因组DNA的检测第38页
   ·测序引物设计和PCR反应体系第38-40页
     ·测序引物设计第38-39页
     ·引物的溶解、稀释第39页
     ·PCR反应体系第39-40页
     ·琼脂糖电泳检测分析第40页
   ·生物信息学分析第40页
     ·多态座位的寻找第40页
     ·序列分析第40页
   ·PCR-RFLP和四引物ARMS-PCR反应条件第40-43页
     ·基因分型引物设计第40-41页
     ·PCR反应体系第41-42页
     ·限制性内切酶的设计第42页
     ·酶切反应条件第42-43页
 3 统计分析第43-44页
   ·基因型频率和基因频率计算第43页
   ·Hardy-Weinberg平衡检验第43页
   ·基因效应的统计分析第43-44页
第三章 结果与分析第44-66页
 1 基因组DNA提取结果第44页
 2 候选基因目的序列第44-46页
   ·ATGL基因5'调控区目的序列第44-45页
   ·FATP1基因5'调控区目的序列第45-46页
 3 测序引物PCR扩增结果第46-47页
 4 生物信息学分析结果第47-55页
   ·多态座位的寻找第47-49页
     ·ATGL基因5'调控区的SNP座位第47-48页
     ·FATP1基因5'调控区的SNP座位第48-49页
   ·序列分析第49-50页
     ·ATGL基因5'调控区序列分析第49页
     ·FATP1基因5'调控区序列分析第49-50页
   ·多态座位的转录因子结合位点预测第50-55页
     ·ATGL基因SNP座位转录因子结合位点预测第50-52页
     ·FATP1基因SNP座位转录因子结合位点预测第52-55页
 5 多态性座位检测结果第55-57页
   ·ATGL基因的多态座位检测结果第55-56页
     ·A-253C→T多态座位检测结果第55页
     ·A-845G→C多态座位检测结果第55-56页
   ·FATP1基因的多态座位检测结果第56-57页
     ·F-586T→C多态座位检测结果第56页
     ·F-1026G→A多态座位检测结果第56-57页
     ·F-1240C→A多态座位检测结果第57页
 6 SNP与猪脂肪性状的相关分析第57-66页
   ·ATGL基因多态座位对猪脂肪性状的影响第57-61页
     ·ATGL基因各多态座位在不同猪种中的分布情况第57-59页
     ·ATGL基因各多态座位与猪脂肪及其它性状的相关分析第59-61页
   ·FATP1基因多态座位对猪脂肪性状的影响第61-66页
     ·FATP1基因各多态座位在不同猪种中的分布情况第61-63页
     ·FATP1基因各多态座位与猪脂肪及其它性状的相关分析第63-66页
第四章 讨论第66-73页
 1 候选基因的选择第66-67页
 2 四引物ARMS-PCR分析方法的优化第67-68页
 3 ATGL基因和FATP1基因5'调控区的多态性第68-70页
 4 ATGL基因5'调控区多态性与猪脂肪性状等的相关分析第70-71页
 5 FATP1基因5'调控区多态性与猪脂肪性状等的相关分析第71-73页
第五章 小结第73-75页
 1 本研究的主要结论第73-74页
 2 本研究的特色与创新点第74页
 3 本研究的不足之处第74-75页
参考文献第75-80页
致谢第80页

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