| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第12-18页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第12-13页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第13-15页 |
| 1.2.1 基于单一关系数据的功能模块识别算法研究 | 第13-15页 |
| 1.2.2 融合多源数据的功能模块识别算法研究 | 第15页 |
| 1.3 本文主要工作 | 第15-16页 |
| 1.4 本文组织结构 | 第16-18页 |
| 第2章 功能模块识别算法简述 | 第18-26页 |
| 2.1 引言 | 第18页 |
| 2.2 基于单一关系数据的功能模块识别算法 | 第18-22页 |
| 2.2.1 蛋白质功能模块识别算法 | 第18-20页 |
| 2.2.2 miRNA调控模块识别算法 | 第20-22页 |
| 2.3 融合多源数据的模块识别算法 | 第22-23页 |
| 2.4 miRNA调控模块识别算法的评价指标 | 第23-24页 |
| 2.5 小结 | 第24-26页 |
| 第3章 基于多类型数据的miRNA调控模块识别算法 | 第26-40页 |
| 3.1 引言 | 第26页 |
| 3.2 相关定义 | 第26-28页 |
| 3.2.1 蛋白质相互作用数据和miRNA调控作用数据 | 第26页 |
| 3.2.2 多源数据 | 第26-28页 |
| 3.3 算法框架 | 第28-31页 |
| 3.4 实验结果与分析 | 第31-38页 |
| 3.4.1 实验数据 | 第31-32页 |
| 3.4.2 实验结果 | 第32页 |
| 3.4.3 验证模块的共表达 | 第32-33页 |
| 3.4.4 功能富集性分析 | 第33-36页 |
| 3.4.5 案例分析 | 第36-37页 |
| 3.4.6 参数分析 | 第37-38页 |
| 3.5 小结 | 第38-40页 |
| 第4章 基于集体关系的miRNA调控模块识别算法 | 第40-52页 |
| 4.1 引言 | 第40页 |
| 4.2 算法框架 | 第40-43页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第43-51页 |
| 4.3.1 实验数据 | 第43-44页 |
| 4.3.2 实验结果 | 第44页 |
| 4.3.3 模块密度分析 | 第44-45页 |
| 4.3.4 miRNA家族富集性分析 | 第45-46页 |
| 4.3.5 功能富集性分析 | 第46-49页 |
| 4.3.6 模块共表达分析 | 第49-51页 |
| 4.4 小结 | 第51-52页 |
| 结论 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-61页 |
| 附录A 攻读学位期间发表的学术论文 | 第61-62页 |
| 附录B 攻读学位期间参加的科研项目 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
