| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4页 |
| 1 前言 | 第7-16页 |
| 1.1 软体动物中经典UPR信号通路的重要元件 | 第7-11页 |
| 1.1.1 IRE1–XBP1信号支路元件 | 第7-8页 |
| 1.1.2 PERK–eIF2α–ATF4–CHOP信号支路元件 | 第8-9页 |
| 1.1.3 ATF6信号支路元件 | 第9-10页 |
| 1.1.4 BiP(GRP78) | 第10页 |
| 1.1.5 CRT/CNX/PPI/PDI | 第10-11页 |
| 1.2 软体动物中经典UPR信号通路参与环境胁迫应答 | 第11-14页 |
| 1.2.1 热,金属和免疫刺激后IRE1-XBP1信号支路的表达模式 | 第11-12页 |
| 1.2.2 缺氧和热胁迫下的PERK–eIF2α–ATF4–CHOP信号支路 | 第12-13页 |
| 1.2.3 软体动物中ATF6信号支路的表达 | 第13-14页 |
| 1.3 软体动物中经典UPR信号通路与重要免疫通路间关系的研究进展 | 第14页 |
| 1.3.1 与软体动物UPR共表达的通路 | 第14页 |
| 1.3.2 UPR激活下游免疫应答 | 第14页 |
| 1.4 本研究的目的与意义 | 第14-16页 |
| 2 数据来源与实验方法 | 第16-20页 |
| 2.1 实验材料与转录组测序分析 | 第16-18页 |
| 2.2 UPR通路分析 | 第18-19页 |
| 2.2.1 自动检索UPR | 第18页 |
| 2.2.2 韦恩图,热图和主成分(PCA)分析 | 第18页 |
| 2.2.3 基于MATLAB的非线性拟合 | 第18-19页 |
| 2.3 基于Kappa分数的UPR及其他免疫通路间的网络分析 | 第19-20页 |
| 3 分析结果 | 第20-71页 |
| 3.1 长牡蛎UPR及其内质网相关通路的组成及其对热胁迫的响应模式分析 | 第20-38页 |
| 3.1.1 转录组测序数据分析 | 第20页 |
| 3.1.2 UPR及免疫通路的基因本体分析 | 第20-25页 |
| 3.1.3 UPR及其他内质网应激通路元件的差异表达和层级聚类分析 | 第25-29页 |
| 3.1.4 UPR及其他内质网元件的时间依赖的拟合曲线和拟合方程 | 第29-31页 |
| 3.1.5 UPR及其他内质网元件的表达模式 | 第31-38页 |
| 3.2 热胁迫下长牡蛎中重要免疫通路及其与UPR之间的网络关系 | 第38-71页 |
| 3.2.1 与UPR共表达的重要免疫通路 | 第38-63页 |
| 3.2.2 与UPR共表达的重要免疫通路的表达特点 | 第63页 |
| 3.2.3 UPR和重要免疫通路间的通信关系 | 第63-70页 |
| 3.2.4 与UPR最相关的免疫通路 | 第70-71页 |
| 4 讨论 | 第71-75页 |
| 4.1 热胁迫下长牡蛎的UPR表达模式 | 第71-73页 |
| 4.2 热胁迫下长牡蛎的重要免疫通路及其与UPR的网络关系 | 第73-75页 |
| 5 结论和展望 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-85页 |
| 攻读学位期间发表的论文目录 | 第85-91页 |
| 致谢 | 第91-93页 |
| 附表 | 第93页 |
