| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 本文所用英文缩略词表 | 第12-13页 |
| 第1章 绪论 | 第13-26页 |
| 1.1 引言 | 第13页 |
| 1.2 转录组学及其在药用植物中的作用 | 第13-19页 |
| 1.2.1 转录组和转录组学概述 | 第13-14页 |
| 1.2.2 新型测序技术 | 第14-18页 |
| 1.2.3 新型转录组测序技术 | 第18页 |
| 1.2.4 转录组测序技术在药用植物上的应用 | 第18-19页 |
| 1.3 高效液相色谱法在药用植物上的应用 | 第19-22页 |
| 1.3.1 生物碱类成分含量测定 | 第19-20页 |
| 1.3.2 中药甙类成分含量测定 | 第20页 |
| 1.3.3 黄酮类成分含量测定 | 第20页 |
| 1.3.4 蒽醌类成分含量测定 | 第20-21页 |
| 1.3.5 萜类成分含量测定 | 第21页 |
| 1.3.6 香豆素类成分含量测定 | 第21页 |
| 1.3.7 有机酸类成分含量测定 | 第21-22页 |
| 1.3.8 甾酮、甾醇类成分含量测定 | 第22页 |
| 1.4 蓼蓝的研究进展 | 第22-24页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第24-25页 |
| 1.6 本研究技术路线 | 第25-26页 |
| 第2章 HPLC检测不同采摘阶段蓼蓝叶片中靛蓝靛玉红的含量 | 第26-32页 |
| 2.1 实验材料 | 第26-27页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第26页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第26页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第26-27页 |
| 2.2 实验方法 | 第27页 |
| 2.2.1 色谱条件 | 第27页 |
| 2.2.2 标准曲线的绘制 | 第27页 |
| 2.2.3 蓼蓝中有效成分靛蓝和靛玉红的检测 | 第27页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第27-31页 |
| 2.3.1 检测波长的选择 | 第27-28页 |
| 2.3.2 提取方法的确定 | 第28页 |
| 2.3.3 流动相的选择 | 第28页 |
| 2.3.4 靛蓝标准品和靛玉红标准品线性回归方程 | 第28-29页 |
| 2.3.5 蓼蓝中靛蓝和靛玉红的定量分析 | 第29-31页 |
| 2.3.6 稳定性试验 | 第31页 |
| 2.3.7 精密度试验 | 第31页 |
| 2.4 小结 | 第31-32页 |
| 第3章 不同采摘阶段蓼蓝转录组测序 | 第32-43页 |
| 3.1 材料与方法 | 第32-38页 |
| 3.1.1 实验试剂 | 第32页 |
| 3.1.2 实验仪器 | 第32-33页 |
| 3.1.3 上机测序准备 | 第33-38页 |
| 3.1.3.1 蓼蓝叶片总RNA提取 | 第33页 |
| 3.1.3.2 RNA浓度及纯度的检验 | 第33页 |
| 3.1.3.3 RNA完整度检验 | 第33-34页 |
| 3.1.3.4 mRNA提取及片段化 | 第34-35页 |
| 3.1.3.5 测序文库的构建 | 第35-36页 |
| 3.1.3.6 文库质量的检验 | 第36-37页 |
| 3.1.3.7 文库浓度的测定 | 第37页 |
| 3.1.3.8 上机测序 | 第37-38页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第38-42页 |
| 3.2.1 蓼蓝叶片总RNA浓度与质量的检测 | 第38页 |
| 3.2.2 测序文库质量及浓度的检测 | 第38-39页 |
| 3.2.3 上机测序结果分析 | 第39-42页 |
| 3.3 小结 | 第42-43页 |
| 第4章 不同采摘阶段蓼蓝转录组测序数据分析 | 第43-60页 |
| 4.1 转录组数据处理方法 | 第43-46页 |
| 4.1.1 序列处理、拼接与组装 | 第43-44页 |
| 4.1.1.1 数据预处理 | 第43-44页 |
| 4.1.1.2 转录本拼接 | 第44页 |
| 4.1.1.3 BUSCO评价转录本拼接质量 | 第44页 |
| 4.1.2 表达定量 | 第44页 |
| 4.1.3 组装后序列功能注释 | 第44-45页 |
| 4.1.3.1 GO功能注释 | 第45页 |
| 4.1.3.2 KEGG功能注释 | 第45页 |
| 4.1.4 样品相关系数与相关性分析 | 第45-46页 |
| 4.1.5 差异表达基因分析 | 第46页 |
| 4.1.6 GO与KEGG功能富集 | 第46页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第46-59页 |
| 4.2.1 序列处理、拼接与组装结果 | 第46-48页 |
| 4.2.1.1 转录本拼接 | 第46-47页 |
| 4.2.1.2 转录本拼接质量评估 | 第47-48页 |
| 4.2.2 表达定量 | 第48-49页 |
| 4.2.2 组装后功能注释 | 第49-50页 |
| 4.2.3 样品相关系数与相关性分析 | 第50页 |
| 4.2.4 差异表达分析 | 第50-52页 |
| 4.2.5 差异基因富集分析 | 第52-55页 |
| 4.2.5.1 GO富集分析 | 第52-53页 |
| 4.2.5.2 KEGG富集分析 | 第53-55页 |
| 4.2.6 差异基因调控靛蓝、靛玉红的生物合成 | 第55-59页 |
| 4.3 小结 | 第59-60页 |
| 结论与展望 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-68页 |
| 附录 攻读硕士期间所发表的学术论文 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |