| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-18页 |
| 1.1 必要基因预测的研究现状 | 第11-12页 |
| 1.2 药物靶点的研究现状 | 第12-16页 |
| 1.3 研究内容及意义 | 第16-18页 |
| 第二章 预测必要基因的训练集筛选 | 第18-34页 |
| 2.1 材料与方法 | 第18-20页 |
| 2.1.1 获取必要基因以及其他相关的数据 | 第18页 |
| 2.1.2 收集相关特征 | 第18-20页 |
| 2.1.3 确定蛋白质是否具有同源关系的BLAST标准 | 第20页 |
| 2.2 结果与分析 | 第20-32页 |
| 2.2.1 不同的训练集预测相同的预测集的精确性有差异 | 第20-21页 |
| 2.2.2 训练集中的必要基因来源应可靠 | 第21-22页 |
| 2.2.3 训练集和预测集中的物种的生长条件应相同 | 第22-23页 |
| 2.2.4 训练集和预测集中的物种之间的进化距离应近 | 第23-25页 |
| 2.2.5 训练集与预测集中的物种的表型和生活方式应相同 | 第25-26页 |
| 2.2.6 训练集的大小应占到全基因组的 10% | 第26-29页 |
| 2.2.7 整合多个物种的训练集比单一物种的训练集的预测效果更佳 | 第29-31页 |
| 2.2.8 按照标准的整合训练集比随机的整合训练集的预测效果更优 | 第31-32页 |
| 2.3 结论与讨论 | 第32-34页 |
| 第三章 利用必要基因识别致病菌的潜在的药物靶点 | 第34-40页 |
| 3.1 材料与方法 | 第34-36页 |
| 3.1.1 选取九种细菌致病菌 | 第34-35页 |
| 3.1.2 必要基因以及基因序列的获取 | 第35页 |
| 3.1.3 获得致病菌和人类的同源基因 | 第35-36页 |
| 3.1.4 本研究的流程图 | 第36页 |
| 3.2 结果及分析 | 第36-38页 |
| 3.2.1 比较得到非人类的同源基因 | 第36-37页 |
| 3.2.2 比较得到非人类的同源必要基因 | 第37-38页 |
| 3.2.3 寻找致病菌的广谱药物靶点的小分子抑制剂 | 第38页 |
| 3.3 结论与讨论 | 第38-40页 |
| 第四章 总结与展望 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-46页 |
| 致谢 | 第46-47页 |
| 作者简介 | 第47页 |
