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假盘菌诱导下紫花苜蓿不同株系的转录组测序与抗病相关基因差异表达研究

摘要第2-4页
Summary第4-5页
第一章 引言第8-21页
    1.1 苜蓿褐斑病研究概况第8-11页
        1.1.1 苜蓿褐斑病的分布与危害第9-10页
        1.1.2 苜蓿褐斑病的发生及流行第10-11页
    1.2 植物抗病性第11-18页
        1.2.1 植物抗病机制第11-13页
        1.2.2 植物诱导抗病性的生理生化机制第13-14页
        1.2.3 植物抗病基因类型第14-16页
        1.2.4 植物抗病基因克隆研究进展第16-18页
    1.3 高通量转录组测序研究进展第18-20页
        1.3.1 高通量测序技术第18-19页
        1.3.2 高通量转录组测序及应用第19-20页
    1.4 研究目的和意义第20-21页
第二章 苜蓿假盘菌诱导下苜蓿抗、感褐斑病株系中几种酶活性变化的研究第21-29页
    2.1 材料和方法第21-23页
        2.1.1 试验材料第21页
        2.1.2 接种和取样第21-22页
        2.1.3 PAO和DAO测定方法第22页
        2.1.4 CAT测定方法第22-23页
        2.1.5 SOD测定方法第23页
        2.1.6 相对酶活性的计算第23页
        2.1.7 数据处理第23页
    2.2 结果与分析第23-26页
        2.2.1 相对PAO的活性变化第23-24页
        2.2.2 相对DAO的活性变化第24-25页
        2.2.3 相对CAT的活性变化第25-26页
        2.2.4 相对SOD的活性变化第26页
    2.3 讨论第26-29页
第三章 苜蓿假盘菌诱导下苜蓿抗、感褐斑病株系叶片转录组测序分析第29-44页
    3.1 材料与方法第29-33页
        3.1.1 试验材料第29页
        3.1.2 总RNA的提取第29-30页
        3.1.3 总RNA质量检测第30-31页
        3.1.4 总RNA浓度检测第31页
        3.1.5 cDNA文库的准备和转录组测序第31页
        3.1.6 数据过滤和de novo组装第31-32页
        3.1.7 功能注释第32-33页
    3.2 结果与分析第33-43页
        3.2.1 总RNA质量分析第33-34页
        3.2.2 转录组测序、de novo组装和序列分析第34-37页
        3.2.3 功能注释第37-40页
        3.2.4 GO注释第40-41页
        3.2.5 COG注释结果第41页
        3.2.6 KEGG注释结果第41-43页
    3.3 讨论第43-44页
第四章 苜蓿抗、感褐斑病株系中基因差异表达分析第44-58页
    4.1 材料与方法第44-47页
        4.1.1 材料第44页
        4.1.2 差异基因分析方法第44-45页
        4.1.3 引物设计方法第45-46页
        4.1.4 差异表达的8个抗病相关基因在时间上的表达模式分析方法第46-47页
    4.2 结果与分析第47-54页
        4.2.1 苜蓿抗、感褐斑病株系中显著差异表达转录本分析结果第47-48页
        4.2.2 GO功能和KEGG通路显著性富集分析结果第48-49页
        4.2.3 实时荧光定量验证结果第49-50页
        4.2.4 苜蓿抗褐斑病相关基因qReal Time-PCR分析结果第50-52页
        4.2.5 参与抗病信号途径的差异表达基因第52页
        4.2.6 差异表达的转录因子第52-53页
        4.2.7 差异表达的抗病相关基因第53页
        4.2.8 植物抗病基因和抗氧化相关基因第53-54页
    4.3 讨论第54-58页
第五章 结论第58-60页
    5.1 抗、感苜蓿株系叶片感染Pseudopeziza medicaginis病菌后几种酶活性变化第58页
    5.2 苜蓿抗褐斑病转录组分析第58-59页
    5.3 苜蓿抗褐斑病相关基因差异表达分析第59-60页
参考文献第60-68页
附图第68-72页
附表第72-90页
致谢第90-91页
第一导师简介第91-92页
第二导师简介第92-93页
作者简介第93-94页

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