| 摘要 | 第5-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-39页 |
| 1 DNA 条形码技术 | 第17-25页 |
| 1.1 传统的基于形态学鉴定方法的局限性 | 第17-18页 |
| 1.2 新兴的生物分类方法— DNA 条形码技术被提出 | 第18-19页 |
| 1.3 DNA 条形码技术的操作流程及数据分析方法 | 第19-22页 |
| 1.4 DNA 条形码分析方法的优点 | 第22-23页 |
| 1.5 DNA 条形码 DNA 条形码技术在海洋生物类群中的应用 | 第23-24页 |
| 1.6 DNA 条形码研究存在的质疑 | 第24-25页 |
| 2 分子系统发育学 | 第25-30页 |
| 2.1 分子系统发育学的概念及基本原理 | 第26-27页 |
| 2.2 分子系统发育学的分析方法 | 第27-28页 |
| 2.3 DNA 序列的比对和分子系统树各种构建方法 | 第28-30页 |
| 3 异齿亚纲贝类的概况 | 第30-35页 |
| 3.1 外部形态学特征 | 第31-32页 |
| 3.2 生活习性与地理分布 | 第32页 |
| 3.3 异齿亚纲现行的分类系统 | 第32-35页 |
| 3.4 分子系统学研究与传统分类系统的矛盾之处 | 第35页 |
| 4 樱蛤总科贝类概况 | 第35-36页 |
| 4.1 外部形态学特征 | 第36页 |
| 4.2 樱蛤总科现行的分类系统 | 第36页 |
| 5 缢蛏属贝类概况 | 第36-37页 |
| 5.1 形态学特征 | 第36页 |
| 5.2 生活习性及地理分布范围 | 第36-37页 |
| 5.3 分类系统的演化 | 第37页 |
| 5.4 分子系统发育学研究进展 | 第37页 |
| 6 本研究的立题依据、研究内容及其目的意义 | 第37-39页 |
| 6.1 立题依据 | 第37-38页 |
| 6.2 研究内容及其目的意义 | 第38-39页 |
| 第二章 五种 DNA 条形码分析方法鉴定樱蛤总科贝类的比较研 | 第39-69页 |
| 0 引言 | 第39-42页 |
| 1 材料与方法 | 第42-49页 |
| 1.1 样品的采集 | 第42页 |
| 1.2 DNA 的提取，目的片段的扩增与测序 | 第42-48页 |
| 1.3 数据分析 | 第48-49页 |
| 1.3.1 距离法条形码分析 | 第48页 |
| 1.3.2 聚类法条形码分析 | 第48页 |
| 1.3.3 特征法条形码分析 | 第48-49页 |
| 2 结果 | 第49-65页 |
| 2.1 基于距离法的条形码分析结果 | 第49-53页 |
| 2.1.1 传统的距离法的分析结果 | 第49-51页 |
| 2.1.2 条形码间隙自动检索法的分析结果 | 第51-53页 |
| 2.2 聚类法分析结果 | 第53-60页 |
| 2.2.1 单系法分析结果 | 第53-57页 |
| 2.2.2 一般混合耶鲁模型分析结果 | 第57-60页 |
| 2.3 特征法分析结果 | 第60-65页 |
| 2.3.1 CAOS 法在种的水平上的鉴定效率 | 第60页 |
| 2.3.2 CAOS 法在属的水平上的鉴定效率 | 第60-65页 |
| 3 讨论 | 第65-68页 |
| 3.1 距离法 | 第65-66页 |
| 3.2 聚类法 | 第66-67页 |
| 3.3 特征法 | 第67-68页 |
| 4 结论 | 第68-69页 |
| 第三章 基于距离法的异齿亚纲近缘种 DNA 条形码研究码研究 | 第69-86页 |
| 0 引言 | 第69-70页 |
| 1 材料与方法 | 第70-71页 |
| 1.1 DNA 序列的获得 | 第70页 |
| 1.2 数据分析过程 | 第70-71页 |
| 2 结果 | 第71-84页 |
| 2.1 传统距离法分析结果 | 第71-72页 |
| 2.2 条形码自动间隙法分析结果 | 第72-84页 |
| 3 讨论 | 第84-85页 |
| 4 结论 | 第85-86页 |
| 第四章 异齿亚纲系统发生学研究 | 第86-104页 |
| 0 引言 | 第86-87页 |
| 1 材料与方法 | 第87-88页 |
| 1.1 DNA 序列的获得 | 第87页 |
| 1.2 序列编辑、排序和分析 | 第87页 |
| 1.3 模型选择和系统发生树的构建 | 第87-88页 |
| 2 结果 | 第88-100页 |
| 3 讨论 | 第100-103页 |
| 3.1 星形科总科/心蛤总科分支 | 第100页 |
| 3.2 满月蛤总科的系统发生关系 | 第100-101页 |
| 3.3 竹蛏总科的系统发生关系 | 第101页 |
| 3.4 袖扣蛤总科的系统发生学关系 | 第101页 |
| 3.5 鸟蛤总科的系统发生学关系 | 第101-102页 |
| 3.6 樱蛤总科的系统发生学关系 | 第102页 |
| 3.7 帘蛤总科的系统发生学关系 | 第102页 |
| 3.8 蛤蜊蛤总科的系统发生学关系 | 第102页 |
| 3.9 海螂总科和海笋总科的系统发生学关系 | 第102-103页 |
| 3.10 蚬科的系统发生学关系 | 第103页 |
| 4 结论 | 第103-104页 |
| 第五章 利用三种不同 DNA 条形码分析方法探究缢蛏属系统发生学关系 | 第104-119页 |
| 0 引言 | 第104-105页 |
| 1 材料与方法 | 第105-113页 |
| 1.1 样品来源 | 第105页 |
| 1.2 PCR 扩增与测序 | 第105-112页 |
| 1.3 数据分析 | 第112-113页 |
| 1.3.1 距离条形码分析 | 第112页 |
| 1.3.2 单系法条形码分析 | 第112页 |
| 1.3.3 特征法条形码分析 | 第112-113页 |
| 2 结果 | 第113-117页 |
| 2.1 基于遗传距离的条形码分析 | 第113-114页 |
| 2.2 基于单系发生的条形码分析 | 第114-115页 |
| 2.3 基于特征法的条形码分析 | 第115-117页 |
| 3 讨论 | 第117-118页 |
| 4 结论 | 第118-119页 |
| 参考文献 | 第119-132页 |
| 致谢 | 第132-133页 |
| 个人简历 | 第133-134页 |
| 硕博期间学术成果 | 第134-136页 |
