| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 引言 | 第12-31页 |
| 1.1 植物 microRNA | 第12页 |
| 1.2 植物miRNA的生物合成过程与作用机制 | 第12-14页 |
| 1.3 miRNA对植物所起的调控作用 | 第14-23页 |
| 1.4 植物miRNA研究方法 | 第23-28页 |
| 1.5 萱草抗逆性研究概况 | 第28-30页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第30页 |
| 1.7 研究内容 | 第30-31页 |
| 2 材料与方法 | 第31-38页 |
| 2.1 植物材料及处理 | 第31页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第31页 |
| 2.1.2 胁迫处理 | 第31页 |
| 2.1.3 样品处理 | 第31页 |
| 2.2 方法 | 第31-38页 |
| 2.2.1 数据库、生物软件、试剂及仪器 | 第31页 |
| 2.2.2 实验方法 | 第31-37页 |
| 2.2.3 技术路线 | 第37-38页 |
| 3 结果与分析 | 第38-96页 |
| 3.1 萱草small RNA测序数据分析 | 第38-49页 |
| 3.1.1 总RNA质量分析 | 第38-39页 |
| 3.1.2 总RNA完整性分析 | 第39-40页 |
| 3.1.3 萱草Small RNA初级分析 | 第40-43页 |
| 3.1.4 基因组定位 | 第43-44页 |
| 3.1.5 dean序列分类注释 | 第44-49页 |
| 3.2 萱草miRNA表达谱构建、差异显著性及功能分析 | 第49-68页 |
| 3.2.1 萱草miRNA与水稻已知miRNA数据库的比对分析 | 第49-61页 |
| 3.2.2 与所有植物miRNA数据库的对比分析 | 第61-68页 |
| 3.3 已知miRNA家族分析 | 第68-74页 |
| 3.4 萱草新miRNA的预测 | 第74-95页 |
| 3.4.1 新miRNA预测原理及前体统计 | 第74页 |
| 3.4.2 各温度下候选miRNA的首位碱基偏向性分析 | 第74-76页 |
| 3.4.3 预测得到的miRNA 二级结构 | 第76-81页 |
| 3.4.4 候选miRNA靶基因预测 | 第81-91页 |
| 3.4.5 候选miRNA的靶基因分析 | 第91-95页 |
| 3.5 创新性 | 第95-96页 |
| 4 讨论 | 第96-99页 |
| 4.1 萱草小分子RNA | 第96页 |
| 4.2 萱草miRNA的保守性 | 第96-97页 |
| 4.3 萱草小分子RNA的基因组分布 | 第97页 |
| 4.4 miRNA在萱草抗低温胁迫中的作用 | 第97页 |
| 4.5 木研究测序结果体现了丰富的miRNA信息 | 第97-98页 |
| 4.6 下一步工作展望 | 第98-99页 |
| 5 结论 | 第99-100页 |
| 致谢 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-118页 |
| 附录A | 第118-150页 |
| 附录B | 第150-151页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第151页 |
