基于BWT的DNA重叠群序列合并算法研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-18页 |
| 1.1 课题背景 | 第9-11页 |
| 1.2 研究目的及意义 | 第11-12页 |
| 1.3 国内外研究现状 | 第12-16页 |
| 1.4 本文主要研究内容 | 第16-18页 |
| 第2章 BWT 索引 | 第18-29页 |
| 2.1 BWT 的序列匹配原理 | 第18-21页 |
| 2.2 配对信息数据处理 | 第21-24页 |
| 2.3 Contig 及其参考序列 | 第24-26页 |
| 2.4 BWT 后缀数组 | 第26-28页 |
| 2.5 本章小结 | 第28-29页 |
| 第3章 查找 contig 间最优关联算法 | 第29-38页 |
| 3.1 Contig 的 BWT 索引结构 | 第29-30页 |
| 3.2 查找 contig 间末端关联性 | 第30-34页 |
| 3.3 Contig 间末端匹配 | 第34-37页 |
| 3.4 本章小结 | 第37-38页 |
| 第4章 Contig 合并算法 | 第38-52页 |
| 4.1 Contig 间关联结构 | 第38-41页 |
| 4.2 Contig 间合并 | 第41-44页 |
| 4.3 Overlap 处理 | 第44-47页 |
| 4.4 Gap 填充 | 第47-51页 |
| 4.5 本章小结 | 第51-52页 |
| 第5章 系统的运行结果及评价 | 第52-59页 |
| 5.1 程序运行结果 | 第52-54页 |
| 5.2 质量与长度评价 | 第54-56页 |
| 5.3 算法性能评价 | 第56-58页 |
| 5.4 本章小结 | 第58-59页 |
| 结论 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-66页 |
| 致谢 | 第66页 |
